陆地棉GhMYB9基因克隆及结合特性分析

发布时间：2018-07-26 14:13

【摘要】：MYB转录因子蛋白普遍存在于植物中,广泛参与植物的生长发育和代谢调控。为研究GhMYB9基因对棉纤维的调控机制,使用PCR方法,从棉花中克隆1个R2R3-MYB基因GhMYB9(Gen Bank登录号:AF336286.1);利用生物信息学方法分析其氨基酸序列;构建酵母表达载体。结果表明,该基因c DNA全长1 145 bp,开放阅读框长795 bp,编码264个氨基酸,预测其蛋白分子量约为29.624 k D,等电点为9.13。推测的氨基酸序列中含有2个高度保守的SANT结构域。GhMYB9基因组包含2个外显子和1个内含子。进化树分析表明,GhMYB9和Gh MYB聚在同一分支(HQ234875.1)。酵母单杂交试验结果表明,GhMYB9转录因子能够特异结合AC顺式作用元件。本研究结果为进一步阐明GhMYB9的生物学功能奠定了基础。
[Abstract]:MYB transcription factor proteins are widely involved in plant growth and metabolism. In order to study the regulation mechanism of GhMYB9 gene on cotton fiber, a R2R3-MYB gene (GhMYB9 (Gen Bank accession number: AF336286.1) was cloned from cotton by PCR method, the amino acid sequence was analyzed by bioinformatics method, and yeast expression vector was constructed. The results showed that the full length of c DNA was 1 145 BP, the length of open reading frame was 795 BP, encoding 264 amino acids. The predicted molecular weight of c DNA was about 29.624 KD and the isoelectric point was 9.13. The deduced amino acid sequence contains two highly conserved SANT domains. GhMYB9 genome contains two exons and one intron. Phylogenetic tree analysis showed that GhMYB9 and Gh MYB were clustered in the same branch (HQ234875.1). Yeast single hybrid test showed that GhMYB9 transcription factor could specifically bind to AC cis-acting elements. The results of this study lay a foundation for further elucidating the biological function of GhMYB9.
【作者单位】： 新疆农业大学农学院/新疆农业大学农业生物技术重点实验室;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室;
【基金】：国家863项目(2012AA101108) 棉花生物学国家重点实验室开放课题基金资助项目(CB2015A26) 国家自然基金项目(31260361;31560409)
【分类号】：S562

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本文编号：2146273