郑麦366α-醇溶蛋白基因的克隆及生物信息学分析

发布时间：2018-08-14 13:00

【摘要】：为研究优质强筋小麦品种郑麦366α-醇溶蛋白的组成,应用简并引物进行PCR扩增,从郑麦366中扩增得到13条核苷酸序列,其中9条序列推导的氨基酸序列具有完整的开放阅读框。进一步分析显示,克隆的9个基因(分别命名为ZM366-1—ZM366-9)编码的蛋白质均具有α-醇溶蛋白的典型结构特征,根据T-细胞毒性抗原表位数目和多聚谷氨酰胺区特征分别将ZM366-1、ZM366-2定位到6A染色体,ZM366-3、ZM366-4定位到6D染色体,ZM366-5—ZM366-9定位到6B染色体。蛋白质二级结构预测显示,克隆的9个α-醇溶蛋白都仅含有α-螺旋结构,其中B基因组α-醇溶蛋白的α-螺旋含量明显高于其他基因组。同源系统进化树分析表明,克隆的9个α-醇溶蛋白具有明显的基因组特异性。
[Abstract]:In order to study the composition of Zhengmai 366 伪 -gliadin, 13 nucleotide sequences were obtained from Zhengmai 366 by PCR amplification with degenerate primers, among which 9 amino acid sequences had complete open reading frame. Further analysis showed that the proteins encoded by the nine cloned genes (named ZM366-1-ZM366-9) all had typical structural characteristics of 伪 -gliadin. According to the epitope number of T- cytotoxic antigen and the characteristics of polyglutamine region, ZM366-1 ZM366-2 was mapped to chromosome 6A ZM366-4 to chromosome 6D ZM366-5-ZM366-9 to chromosome 6B. The prediction of protein secondary structure showed that all the nine 伪 -gliadin clones contained only 伪 -helix structure, and the 伪 -helix content of B genome was significantly higher than that of other genomes. Homologous phylogenetic tree analysis showed that the nine 伪-gliadins were genome-specific.
【作者单位】： 河南省农业科学院小麦研究所;
【基金】：国家自然科学基金青年基金项目(31501382) 河南省农业科学院优秀青年基金项目(2013YQ02);河南省农业科学院自主创新基金项目(2016ZC07)
【分类号】：S512.1

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