齐口裂腹鱼CDH5基因特性及其对温和气单胞菌感染的应答

发布时间：2018-08-25 19:50

【摘要】：探讨齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)血管内皮黏附分子(Cadherin 5,CDH5)的基因特性。用生物信息学软件分析齐口裂腹鱼CDH5基因序列,用Real-time PCR检测CDH5基因在齐口裂腹鱼感染温和气单胞菌后0 h、24 h和48 h的表达变化。获得CDH5基因全长c DNA序列,Gen Bank登录号为KT329441。该序列长4 825 bp,开放阅读框长2 313 bp,编码770个氨基酸。蛋白预测结果显示,该蛋白相对分子量为85.19 k D,等电点为5.01。存在信号肽序列,二级结构以随机卷曲、延伸链、α-螺旋为主。齐口裂腹鱼CDH5氨基酸序列与斑马鱼同源性达74%,与人的相似性为43%。CDH5在感染温和气单胞菌后在各组织中均有表达。脾脏中CDH5基因在24 h表达量显著高于0 h和48 h(P0.05)。肝脏、肾脏和肌肉中CDH5在48 h的表达量均显著高于24 h(P0.05)。心脏和肠道中CDH5基因在48 h的表达量显著高于0 h(P0.05)。CDH5基因在可能参与了齐口裂腹鱼抗温和气单胞菌感染的免疫应答,为深入研究CDH5在齐口裂腹鱼中的功能奠定基础。
[Abstract]:To study the gene characteristics of (Schizothorax prenanti) vascular endothelial adhesion molecule (Cadherin 5 + CDH 5). The sequence of CDH5 gene was analyzed by bioinformatics software, and the expression of CDH5 gene was detected by Real-time PCR at 24 h and 48 h after infection with Aeromonas geniformis. Obtaining the full-length c DNA sequence of CDH5 gene GenGen Bank accession number is KT329441. The length of the sequence was 4 825 bp, open reading frame and 2 313 bp, encoding 770 amino acids. The relative molecular weight of the protein was 85.19 KD and the isoelectric point was 5.01. There is signal peptide sequence, the secondary structure is random crimp, extension chain, 伪-helix. The amino acid sequence of CDH5 was 74% homology with zebrafish, and the similarity with human was that 43%.CDH5 was expressed in all tissues after infection with Aeromonas temperate. The expression of CDH5 gene in spleen at 24 h was significantly higher than that at 0 h and 48 h (P0.05). The expression of CDH5 in liver, kidney and muscle at 48 h was significantly higher than that in 24 h (P0.05). The expression of CDH5 gene in heart and intestine at 48 h was significantly higher than that in 0 h (P0.05). CDH5 gene might be involved in the immune response of Astragalus ziphoreus to temperature resistance and Aeromonas infection, which laid a foundation for further study on the function of CDH5 in the fish.
【作者单位】： 西南民族大学青藏高原研究院;西南民族大学生命科学与技术学院;
【基金】：四川省科技支撑项目(2016NZ0044) 西南民族大学研究生学位点建设项目(2016XWD-SO71007)
【分类号】：S943

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本文编号：2203926