决明胰蛋白酶抑制剂2基因的克隆与不同胁迫条件下的表达模式

发布时间：2018-08-31 17:20

【摘要】：克隆决明胰蛋白酶抑制剂2(Cassia obtusifolia trypsin inhibitor 2,COTI2)基因序列,并考察其在不同环境下的表达模式。利用RACE方法克隆了COTI2基因的部分序列,利用定量PCR考察其在盐、低温、干旱及ABA处理下的表达模式。从决明种子c DNA中克隆出了长度为565 bp的基因片段,该片段具有典型的Kunitz蛋白酶抑制剂基因家族的结构域。将得到的序列提交GenBank,序列号为ku745416。对获得的COTI2的氨基酸序列进行比较分析,发现COTI2的P1位残基为Ser38。COTI2与其它植物KTI的氨基酸序列的进化分析表明,其与杨树的同源性较近。定量PCR结果表明COTI2在不同环境下具有不同的表达模式。这为研究COTI2基因的功能及分子调控机制奠定了基础。
[Abstract]:The gene sequence of Cassia trypsin inhibitor 2 (Cassia obtusifolia trypsin inhibitor 2 and COTI2) was cloned and its expression patterns in different environments were investigated. The partial sequence of COTI2 gene was cloned by RACE, and the expression patterns of COTI2 gene under salt, low temperature, drought and ABA treatments were investigated by quantitative PCR. A 565 bp gene fragment was cloned from c DNA of the seed of Cassia sinensis, which has the domain of typical Kunitz protease inhibitor gene family. Submit the resulting sequence to the GenBank, sequence number as ku745416. The amino acid sequence of COTI2 was compared and analyzed. It was found that the P1 residue of COTI2 was the amino acid sequence of Ser38.COTI2 and other plant KTI. The result showed that the amino acid sequence of COTI2 was close to that of poplar. Quantitative PCR results showed that COTI2 had different expression patterns in different environments. This will lay a foundation for studying the function and molecular regulation mechanism of COTI2 gene.
【作者单位】： 西南交通大学生命科学与工程学院;
【基金】：国家自然科学基金(31371232,31500276) 成都市科技技术研发项目(2015-HM01-00051-SF) 国家级大学生创新创业训练计划资助项目(201510613070)
【分类号】：Q943.2

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本文编号：2215652