中华鳖实时定量PCR内参基因的筛选与评价

发布时间：2018-10-05 14:37

【摘要】：选择合适的内参基因是采用q-PCR方法研究基因表达的前提.选取中华鳖GAPDH、EF1α、18SrRNA、Tubulin和β-actin等5个候选内参基因,通过q-PCR方法得到各基因在不同组织中的Ct值,利用4种内参筛选软件和综合评定法进行评价.geNorm和NormFinder软件分析均显示18SrRNAEF1αβ-actinGAPDHTubulin(稳定性由高到低).BestKeeper软件分析显示18SrRNAGAPDHEF1αβ-actinTubulin.RefFinder软件分析和综合评价法显示18SrRNA最佳.推荐优先使用18SrRNA或EF1α,不建议用β-actin和Tubulin.上述结果可为中华鳖和其它爬行动物的基因表达研究提供参考依据.
[Abstract]:The selection of suitable internal reference gene is the premise of using q-PCR method to study gene expression. Five candidate internal reference genes, including tubulin and 尾 -actin, were selected and the Ct values of each gene in different tissues were obtained by q-PCR method in Trionyx sinensis (Trionyx sinensis), including 18s rRNA tubulin and 尾 -actin. The analysis of 18SrRNAEF1 伪 尾 -actinGAPDHTubulin (stability from high to low). BestKeeper software showed that 18SrRNAGAPDHEF1 伪 尾 -actinTubulin.RefFinder software analysis and comprehensive evaluation method showed that 18SrRNA was the best. Preferred use of 18SrRNA or EF1 伪, not 尾 -actin and Tubulin. These results may provide a reference for the gene expression of Trionyx sinensis and other reptiles.
【作者单位】： 河北大学生命科学学院;保定水产技术推广站;
【基金】：河北省自然科学基金项目(C2016201207) 河北省现代农业产业技术体系淡水养殖创新团队项目
【分类号】：Q78;S917.4

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本文编号：2253774