2011—2015年我国南方地区PEDV分子流行病学调查及S基因遗传变异分析

发布时间：2018-10-16 15:39

【摘要】：应用RT-PCR方法对南方地区五省(广东、广西、福建、四川、江苏)18个猪场7日龄以内发病仔猪的小肠组织和粪便样本进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测,对9个猪场进行为期5年的动态监控,并对2011—2015年期间分离的35个PEDV流行株的S基因进行测序,与Gen Bank中的PEDV参考序列进行比较,并绘制了系统进化树。结果显示,上述地区五省存在Group1和Group 2两种类型毒株。Group1与美国、韩国毒株较为接近,可分为G1-1、G1-2、G1-3和G1-4等4个亚群,Group 2与2004年国内分离毒株较为接近,可分为G2-1、G2-2两个亚群。25个中国南方地区毒株集中于G1-2和G1-3,而另外8株与2004年国内毒株(JS-2004-2)同属G2-2亚群。不同类型的毒株引发的PEDV临床表现及死亡率不同,G2-2亚群的毒株引发的PED相对缓和,死亡率较低且病程较短,而位于G1-2和G1-3亚群(尤其是G1-3)的毒株则引起大规模急性暴发,病程较长,死亡率较高。
[Abstract]:RT-PCR method was used to detect porcine epidemic diarrhea virus (ECDV) (PEDV) in small intestine and feces of piglets from 18 pig farms in southern China (Guangdong, Guangxi, Fujian, Sichuan, Jiangsu). The results showed that there were two types of Group1 and Group 2 strains in the five provinces. Group1 was close to that of the United States and Korea, and could be divided into four subgroups, G1-1G1-2G1-3 and G1-4, and Group _ 2 was close to that isolated in China in 2004. The clinical manifestations and mortality of PEDV caused by different types of strains were different. The PED caused by G2-2 subgroup was relatively mild, the mortality was lower and the course of disease was shorter, while the strains located in G1-2 and G1-3 subgroups (especially G1-3) caused large-scale acute outbreaks. The course of disease is longer and the mortality is higher.
【作者单位】： 佛山科学技术学院生命科学与工程学院;华南农业大学动物科学学院;
【基金】：国家自然科学基金(31502071)
【分类号】：S858.28

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：2274819