基于NRPS功能基因筛选鉴定盐生海芦笋内生细菌的研究

发布时间：2018-10-17 09:37

【摘要】：本研究从盐生海芦笋中分离得到两株具有抑菌活性的内生细菌YK-7、YK-10,利用形态学观察、分子生物学方法与生理生化实验对其进行鉴定,并对其发酵产物进行了预测与验证。结果表明两株菌株分别为解淀粉芽胞杆菌亚种(Bacillus amyloliquefaciens subsp.Plantarum)以及阿氏芽孢杆菌(Bacillus aryabhattai)。通过PCR扩增非核糖体多肽合成酶(NRPS)基因,发现菌株YK-7含有NRPS基因片段,经系统发育树分析,预测该菌株可能产生环脂肽类化合物Surfactin,进一步对该菌株发酵产物进行电喷雾质谱(Electrospray mass,ESI-MS)分析证实了预测结果。该研究结果证实了从基因预测化合物的结构类型对于定向筛选有价值的化合物具有重要意义。
[Abstract]:In this study, two endophytic bacteria (YK-7,YK-10,) with bacteriostatic activity were isolated from halophytic asparagus. Morphological observation, molecular biological methods and physiological and biochemical experiments were used to identify the two endophytic bacteria, and the fermentation products were predicted and verified. The results showed that the two strains were Bacillus amylolyticus subspecies (Bacillus amyloliquefaciens subsp.Plantarum) and Bacillus Alba (Bacillus aryabhattai)., respectively. The non-ribosomal polypeptide synthase (NRPS) gene was amplified by PCR. It was found that the strain YK-7 contained NRPS gene fragment, which was analyzed by phylogenetic tree. It was predicted that the strain might produce cyclopeptide compound Surfactin,. The predicted results were confirmed by electrospray ionization mass spectrometry (Electrospray mass,ESI-MS). The results confirm that it is important to predict the structural types of compounds from genes for directional screening of valuable compounds.
【作者单位】： 南京农业大学食品科技学院;
【基金】：2016年农产品质量安全风险评估项目(GJFP201601205)
【分类号】：Q93

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