3种鲍16S rRNA基因片段分析及系统发育研究

发布时间：2018-10-21 16:43

【摘要】：运用PCR技术对皱纹盘鲍(Haliotis discus hannai)、黑足鲍(H.iris)和黑唇鲍(H.rubra)3种鲍16S rRNA基因扩增,纯化后测序。结果表明:皱纹盘鲍、黑足鲍和黑唇鲍序列长度分别为544、546、550 bp,序列AT含量分别为58.1%、56.1%和55.9%,三者序列同源性高达94.18%,碱基变异位点分别集中在9~34 bp、248~295 bp、326~375 bp。所得结果与Genebank中22种鲍相应序列进行对比分析,25种鲍遗传距离距离在0.00~0.14之间;用NJ和ML法绘制系统发育树分析其亲缘关系,结果表明鲍科系统发育呈现出一定的区域性,并且染色体数目相同的物种容易聚为一支。
[Abstract]:The 16s rRNA genes of (Haliotis discus hannai), abalone (H.iris) and abalone (H.rubra) were amplified by PCR and sequenced. The results showed that the sequence length of abalone, Abalone nigra and abalone were 544546550 bp, AT content was 56.1% and 55.9%, respectively. The homology of the three sequences was 94.18, and the base mutation sites were 90.34 bp,248~295 bp,326~375 bp., respectively. The results showed that the sequence length of abalone, abalone and abalone were 544546550 bp, 56.1% and 55.9%, respectively. The results were compared with the corresponding sequences of 22 species of abalone in Genebank. The genetic distance of 25 species of abalone was 0. 000.The phylogenetic tree was plotted by NJ and ML to analyze the phylogenetic relationship. And species with the same number of chromosomes tend to converge into one.
【作者单位】： 山东大学(威海)海洋学院;威海市环翠区海洋与渔业研究所;
【基金】：山东省科技发展计划资助项目(2014GHY115014)
【分类号】：S917.4

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