水貂TOll样受体5编码区基因的克隆及序列分析

发布时间：2018-11-04 15:38

【摘要】：为了解水貂Toll样受体5(TLR5)蛋白的结构特征和遗传演化关系,采用RT-PCR方法从水貂肺脏组织总RNA中扩增出TLR5基因的片段,经拼接获得全长编码区序列。序列全长2 577 bp,编码858个氨基酸,含172%的亮氨酸,并有一段20个氨基酸的信号肽序列。蛋白预测结果表明,该分子具有亲水性,由胞外区(具有LRR结构域)、跨膜区和胞内区(具有TIR结构域)组成,表现出典型的TLR家族结构特征;同源性分析结果显示,与蒙眼貂同源性最高,达97%以上,与海象、大熊猫和北极熊同源性80%以上,与其他物种同源性大都在70%以上。水貂TLR5基因序列的成功克隆为进一步研究其在水貂机体免疫应答中的作用奠定了基础。
[Abstract]:In order to understand the structural characteristics and genetic evolution of mink Toll like receptor 5 (TLR5) protein, the fragment of TLR5 gene was amplified from total RNA of mink lung tissue by RT-PCR method, and the full-length coding region was obtained by splicing. The complete sequence of 2 577 bp, encodes 858 amino acids, containing 172% leucine and a signal peptide sequence of 20 amino acids. The predicted results showed that the molecule was hydrophilic and consisted of extracellular domain (with LRR domain), transmembrane region and intracellular region (with TIR domain), which showed typical TLR family structure. The results of homology analysis showed that the highest homology with mink was over 97%, the homology with walrus, giant panda and polar bear was over 80%, and the homology with other species was more than 70%. The successful cloning of mink TLR5 gene lays a foundation for further study of its role in mink immune response.
【作者单位】： 青岛农业大学动物科技学院;
【基金】：科技部科技基础性工作专项项目(2012FY111000) 山东省优秀中青年科学科研奖励基金(博士基金)(BS2011SW010) 山东省自主创新及成果转化专项(2014ZZCX07105) 青岛农业大学研究生创新计划项目(1215004)
【分类号】：S865.22

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本文编号：2310288