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番鸭细小病毒YL08分离株NS1基因的克隆及序列分析

发布时间:2018-11-26 15:10
【摘要】:为了了解番鸭细小病毒(MDPV)非结构蛋白(NS1)基因的分子生物学特性,试验根据GenBank中发布的其他MDPV基因序列,设计并合成可扩增NS1基因的特异性引物,利用PCR方法从MDPV阳性病料中获得MDPV YL08株NS1基因,将其克隆至载体p ET-32a(+)中,构建重组质粒p ET-32a-NS1,并进行同源性分析和构建系统发育进化树。结果表明:MDPV YL08分离株NS1基因全长为1 884 bp,编码627个氨基酸;MDPV YL08分离株NS1基因与国内外已发表的MDPV分离株核苷酸序列同源性为98.5%~99.4%,该分离株与福建株亲缘关系最近。
[Abstract]:In order to understand the molecular biological characteristics of (MDPV) nonstructural protein (NS1) gene of muscovy duck parvovirus, specific primers for amplification of NS1 gene were designed and synthesized according to other MDPV gene sequences published in GenBank. The NS1 gene of MDPV YL08 strain was obtained from MDPV positive venereal disease material by PCR method and cloned into vector p ET-32a (). The recombinant plasmid p ET-32a-NS1, was constructed and the phylogenetic tree was constructed by homology analysis. The results showed that the total length of NS1 gene of MDPV YL08 isolate was 1 884 bp, encoding 627 amino acids. The nucleotide sequence homology of NS1 gene between MDPV YL08 isolate and MDPV isolate published at home and abroad was 98.55.99. 4, and this isolate had the closest relationship with Fujian strain.
【作者单位】: 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院;齐齐哈尔大学计算机与控制工程学院;黑龙江省兽医科学研究所;
【基金】:黑龙江省自然科学基金项目(QC2014C034) 黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划项目(UNPYSCT-2015093) 齐齐哈尔大学青年教师科研启动项目(2014k-M06;2014k-Z02)
【分类号】:S852.65

【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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本文编号:2358901

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