酒酒球菌β-葡萄糖苷酶基因克隆及生物信息学分析

发布时间：2018-12-20 22:04

【摘要】：【目的】从分子水平上揭示酒酒球菌β-葡萄糖苷酶基因(bgl)的结构特点,为β-葡萄糖苷在酒酒球菌中的代谢研究提供理论依据。【方法】采用PCR法从4株优良的酒酒球菌(SD-1d,SD-2gf,31-DH和NM-2c)中克隆目的基因,并对其编码产物进行生物信息学分析。【结果】bgl基因含有一个完整的开放阅读框,全长2 215 bp,编码737个氨基酸,起始密码子为TTG,终止密码子为TAA。生物信息学分析均显示该蛋白疏水性较弱,无信号肽,无跨膜区,属于糖苷水解酶家族3成员。【结论】bgl基因编码产物为1个81 625.3 u蛋白,具有一个明显的β-葡萄糖苷酶活性位点,为非分泌蛋白,主要存在于细胞质中。
[Abstract]:[objective] to reveal the structural characteristics of 尾 -glucosidase gene (bgl) of Bacillus cereus at molecular level. To provide a theoretical basis for the study of 尾 -glucoside metabolism in Bacillus cereus. [methods] the target genes were cloned from four excellent strains of SD-1d,SD-2gf,31-DH and NM-2c by PCR method. The bgl gene contains a complete open reading frame. The total length of 2 215 bp, encodes 737 amino acids, and the initial codon is TTG, terminator codon is TAA.. Bioinformatics analysis showed that the protein had weak hydrophobicity, no signal peptide, no transmembrane region, and belonged to 3 members of the glycoside hydrolase family. [conclusion] the encoding product of bgl gene was 1 81 625.3 u protein. It has an obvious 尾-glucosidase activity site, which is a non-secretory protein and mainly exists in the cytoplasm.
【作者单位】： 西北农林科技大学葡萄酒学院;西北农林科技大学园艺学院;陕西省葡萄与葡萄酒工程技术研究中心;西北农林科技大学合阳葡萄试验示范站;
【基金】：国家重点研发计划项目(2016YFD0400504) 国家现代农业产业技术体系建设专项(nycytx-30-ch-03)
【分类号】：Q811.4;TS262.6

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