耐碳青霉烯类鲍曼不动杆菌转座子基因检测及同源性分析

发布时间：2019-02-11 17:15

【摘要】：目的探讨耐碳青霉烯类药物鲍曼不动杆菌的转座子基因Tn2006、Tn2008分布及其同源性,为医院感染控制提供实验室依据。方法收集91株对碳青霉烯类药物耐药的非重复鲍曼不动杆菌,PCR检测转座子基因Tn2006和Tn2008,并对扩增产物进行测序及BLAST分析;采用重复序列引物聚合酶链反应(REP-PCR)分析CRAB同源性;采用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)技术对23株CRAB进行同源性分析,利用Bio Numerics软件分析最小生成树。结果在检测的91株CRAB中,40株菌Tn2006基因阳性,Tn2008基因均为阴性;利用REP-PCR方法可将91株CRAB分为A、B、C、D、E、F和G 7个型别,菌株数分别为79株、4株、2株、2株、1株、2株和1株,A型又分为A1和A2两个亚型,分别为46株和33株,所有被检测医院均出现A型菌株;利用MLST分型方法可将23株CRAB分为8个序列型别(ST型),其中ST92型9株、ST195型5株、ST365型3株、ST138型2株、ST75型和ST381型各1株,发现2个新STs型,即STnl(1-15-3-2-2-56-3)和STn2(1-81-3-2-2-3-3)。结论本地区临床分离CRAB存在克隆流行,以A型为主,主要通过转座子Tn2006进行传播,ST92和ST195是本地区CRAB主要ST分型。
[Abstract]:Objective to investigate the distribution and homology of transposon gene Tn2006,Tn2008 of Acinetobacter baumannii, a carbapenem resistant drug, and to provide laboratory evidence for nosocomial infection control. Methods 91 strains of acinetobacter baumannii resistant to carbapenem were collected. Transposon genes Tn2006 and Tn2008, were detected by PCR and amplified products were sequenced and analyzed by BLAST. Repeat sequence primer polymerase chain reaction (REP-PCR) was used to analyze the homology of CRAB, multilocus sequence typing (multilocus sequence typing,MLST was used to analyze the homology of 23 CRAB strains, and Bio Numerics software was used to analyze the minimal spanning tree. Results among 91 CRAB strains, 40 strains were positive for Tn2006 gene and negative for Tn2008 gene. By using REP-PCR method, 91 strains of CRAB were divided into 7 types, namely, Acanthophora, EF and G, with 79 strains, 4 strains, 2 strains, 1 strain, 2 strains and 1 strain respectively. Type A was subdivided into two subtypes: A1 and A2, respectively. There were 46 strains and 33 strains, all the tested hospitals showed A strains. 23 strains of CRAB were classified into 8 ST types by MLST typing, including 9 ST92 type, 5 ST195 type, 3 ST365 type, 2 ST138 type, 1 ST75 type and 1 ST381 type. Two new STs types were found. STnl (1-15-3-2-2-56-3) and STn2 (1-81-3-2-2-3-3). Conclusion the clinical isolated CRAB in this area is prevalent, mainly A type, mainly transmitted by transposon Tn2006. ST92 and ST195 are the main ST types of CRAB in this area.
【作者单位】： 中南大学湘雅医院;长沙市第一医院;
【基金】：中南大学中央高校基本科研业务费专项资金资助(No.2013zzts317) 湖南省发改委(湘发改高技[2012]1493号) 湖南省自然科学基金(No.14JJ7003)
【分类号】：R378

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本文编号：2419933