中国美利奴羊TLR4基因多态性的PCR-SSCP鉴定

发布时间：2019-03-31 12:59

【摘要】：为了研究中国美利奴羊TOLL样受体(TLR4)基因第3外显子上的单核苷酸多态性(SNPS)和单氨基酸多态性(SAPS)。利用生物信息学方法对NCBI上公布的有关绵羊的TLR4序列进行下载并用Seq Man对下载的绵羊TLR4基因外显子进行多态性比对分析,然后采用PCR-SSCP并结合测序的方法对119只中国美利奴羊TLR4基因的外显子3的扩增片段进行分析。通过分析发现,在中国美利奴羊第3外显子1 180 bp处有1个突变位点,由G突变成T,氨基酸由天冬氨酸(D)变成酪氨酸(Y),即该位点为有义突变。在1 537 bp处也有1个突变位点,即由G突变成了A,氨基酸由丙氨酸(A)变成苏氨酸(T),在TLR4第3外显子的其他位点并没有SNPS位点,说明中国美利奴羊TLR4基因上的第3外显子区域有2个多态位点。
[Abstract]:To study the single nucleotide polymorphism (SNPS) and single amino acid polymorphism (SAPS).) on exon 3 of TOLL-like receptor (TLR4) gene in Chinese Merino sheep The published TLR4 sequences of sheep on NCBI were downloaded by bioinformatics method, and the polymorphism of the downloaded exon of TLR4 gene in sheep was analyzed by Seq Man. Then the amplified fragment of exon 3 of TLR4 gene was analyzed by PCR-SSCP and sequencing in 119 Chinese Merino sheep. It was found that there was a mutation site in exon 1 180 bp of Chinese Merino sheep, from G mutation to T mutation, and amino acid from aspartic acid (D) to tyrosine (Y), that is, a sense mutation. There was also a mutation site at 1537 bp, that is, the mutation from G to A, and the amino acid from alanine (A) to threonine (T), did not have a SNPS site at the other sites of TLR4 exon 3. The results showed that there were two polymorphic sites in exon 3 of TLR4 gene in Chinese Merino sheep.
【作者单位】： 石河子大学生命科学学院;
【基金】：国家“973”计划(编号:2010CB530200)
【分类号】：S826.86

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本文编号：2450923