苹果YABBY基因家族的鉴定、进化及表达分析

发布时间：2019-04-19 07:07

【摘要】：从苹果全基因组范围内共鉴定出13个YABBY基因,通过聚类分析将其分为YAB1/YAB3、YAB2、INO、YAB5和CRC 5个亚家族。Md YABBY基因分布在苹果的9条染色体上,在第16条染色体上分布最多。Md YABBY蛋白长度介于60~538个氨基酸,等电点为4.84~9.81,所有Md YABBY蛋白都包含有锌指结构和YABBY两个保守结构域,同一个亚家族内的成员表现出相似的基因结构和蛋白保守基序分布;基因顺式作用元件分析发现,Md YABBY基因包含许多与抗逆和激素响应有关的作用元件。基因表达分析发现,Md YABBY基因在花、果和叶中的表达量较高,5个Md YABBY基因在果实发育的3个时期均明显地上调表达。
[Abstract]:A total of 13 YABBY genes were identified from the whole genome of apple and divided into 5 subfamilies YAB1/YAB3,YAB2,INO,YAB5 and CRC by cluster analysis. Md YABBY gene was distributed on 9 chromosomes of apple. The maximum length of. Md YABBY protein on chromosome 16 was between 60 and 538 amino acids, and the isoelectric point was 4.84 and 9.81. All Md YABBY proteins contained two conserved domains: zinc finger structure and YABBY. The members of the same subfamily showed similar gene structure and protein conserved motif distribution. Cis-acting element analysis revealed that the, Md YABBY gene contained many elements related to stress resistance and hormone response. Gene expression analysis showed that the expression of, Md YABBY gene was higher in flowers, fruits and leaves, and the expression of 5 Md YABBY genes was up-regulated at three stages of fruit development.
【作者单位】： 西北农林科技大学园艺学院;
【基金】：国家科技支撑计划项目(2013BAD20B03) 国家星火计划项目(2014GA850002) 国家现代农业产业技术体系项目(CARS-28) 国家苹果改良中心杨凌分中心,陕西省农业科技创新与攻关项目(2015NY114) 陕西省果业发展协同中心和陕西果业发展项目
【分类号】：S661.1

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：2460720