核桃内参基因实时荧光定量PCR表达稳定性评价

发布时间：2019-06-01 21:12

【摘要】：利用实时荧光定量PCR技术,结合geNorm、NormFinder和BestKeeper软件研究了5个常用的植物内参基因GAPDH、β-Actin、18S rRNA、UBQ和EF-1在不同基因型、不同组织、不同发育时期核桃(Juglans spp.)中的表达情况,以期筛选出在核桃中稳定表达的内参基因。结果显示:GAPDH和EF-1在核桃所有样品中均表达稳定,由于表达丰度偏低,所以适合作为分析较低表达丰度目标基因时的内参;18S rRNA在核桃所有样品中表达稳定性较好,且18S rRNA表达丰度偏高,适合作为分析较高表达丰度目标基因时的内参;β-Actin和UBQ在核桃样品中的表达稳定性较差,不适合作为核桃中基因表达分析时的内参基因。
[Abstract]:Using real-time fluorescence quantitative PCR and geNorm,NormFinder and BestKeeper software, five common plant reference genes GAPDH, 尾-Actin,18S rRNA,UBQ and EF-1 were studied in different genotypes, different tissues and different developmental stages of walnut (Juglans spp.). In order to screen the stable expression of internal reference genes in walnut. The results showed that GAPDH and EF-1 were stable in all walnut samples, and were suitable for the analysis of target genes with low abundance because of their low expression abundance. The expression stability of 18s rRNA in all walnut samples was good, and the expression abundance of 18s rRNA was high, which was suitable for the analysis of high abundance target genes. The expression stability of 尾-Actin and UBQ in walnut samples is poor, so it is not suitable to be used as internal reference gene in gene expression analysis of walnut.
【作者单位】： 贵州大学/贵州省果树工程技术研究中心;
【基金】：贵州省高层次创新型人才培养项目(黔科合人才[2016]4038号) 贵州大学研究生创新基金(研农2017019)~~
【分类号】：S664.1

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