蓖麻RcSCP基因克隆与生物信息学分析

发布时间：2019-06-02 03:28

【摘要】：植物的丝氨酸羧肽酶(serine carboxypeptidases,简称SCP)是一类属于α/β水解酶家族的蛋白酶,在许多生化途径(包括次生代谢产物的生物合成、催化酰基转移、除草剂共轭、种子萌发相关蛋白质的降解过程)中起着重要作用。丝氨酸羧肽酶基因是植物的一种抗逆基因,在植物生长发育及抵抗逆境方面发挥着重要作用。蓖麻作为重要的油料作物,用途广泛。本研究利用c DNA末端快速克隆(RACE)方法克隆蓖麻Rc SCP基因的3'端、5'端片段,最后设计全长引物获得蓖麻Rc SCP全长序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,丝氨酸羧肽酶蛋白基因的c DNA完整开放阅读框序列为1 377 bp,推测它可编码458个氨基酸;蓖麻Rc SCP蛋白含有丝氨酸羧肽酶蛋白家族保守区,预测它定位于细胞质中。
[Abstract]:Plant serine carboxypeptidase (serine carboxypeptidases, (SCP) is a kind of protease belonging to 伪 / 尾 hydrolase family, which is used in many biochemical pathways (including biosynthesis of secondary metabolites, catalytic acyl transfer, herbicide conjugated). The degradation process of seed germination related proteins plays an important role. Serine carboxypeptidase gene is a kind of stress resistance gene in plants, which plays an important role in plant growth and development and resistance to stress. Castor, as an important oil crop, has a wide range of applications. In this study, the 3 'and 5' end fragments of castor Rc SCP gene were cloned by c DNA terminal rapid cloning (RACE). Finally, the full length primers were designed to obtain the full length sequence of castor Rc SCP, and the bioinformatics analysis was carried out. The results showed that the c DNA complete open reading frame sequence of serine carboxypeptidase protein gene was 1377 bp, suggesting that it could encode 458amino acids, and the castor Rc SCP protein contained the conserved region of serine carboxypeptidase protein family, which was predicted to be located in the cytoplasm.
【作者单位】： 内蒙古民族大学农学院;内蒙古阿鲁科尔沁旗农业局;内蒙古民族大学生命科学学院;内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心/内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室/内蒙古自治区蓖麻产业协同创新培育中心;
【基金】：国家自然科学基金(编号:31260336) 内蒙古自治区蓖麻育种重点实验室开放基金(编号:MDK2016030) 内蒙古高校蓖麻产业工程技术中心项目(编号:BMYJ2011007) 内蒙古自治区高校蓖麻产业工程技术研究中心与军事医学科学院军事兽医研究所合作项目(编号:MV-201201-1)
【分类号】：S565.6

【参考文献】

相关期刊论文 前6条

1 狄建军;张庆波;孙颖飞;闫娜;袁庆龙;魏永春;张继星;;蓖麻种子总RNA提取方法比较[J];江苏农业科学;2013年05期

2 刘丽;王静;张志明;赵茂俊;潘光堂;;玉米丝氨酸羧肽酶基因(ZmSCP)的克隆及表达分析[J];作物学报;2013年01期

3 王育华;邹杰;陈信波;;植物丝氨酸羧肽酶及其类蛋白的研究进展[J];生物学杂志;2010年06期

4 ;蓖麻基因组测序初步完成[J];农业生物技术学报;2010年05期

5 张继星;刘鹏;黄凤兰;陈永胜;鲁廷超;;蓖麻总RNA提取[J];内蒙古民族大学学报(自然科学版);2010年01期

6 郑鹭;祁建民;陈绍军;方平平;;蓖麻遗传育种进展及其在生物能源与医药综合利用潜势[J];中国农学通报;2006年09期

相关硕士学位论文 前1条

1 叶玲飞;水稻OsSCP基因的耐逆相关功能研究[D];湖南农业大学;2013年

【共引文献】

相关期刊论文 前10条

1 冯紫洲;刘春梅;衡宝山;张继星;陈永胜;王云;刘海臣;穆莎茉莉;冀照军;霍红雁;;蓖麻RcSCP基因克隆与生物信息学分析[J];江苏农业科学;2017年12期

2 迟越;李平;冯紫洲;李惠根;张继星;;蓖麻RcNHX3基因的克隆与生物信息学分析[J];内蒙古民族大学学报(自然科学版);2017年01期

3 冯紫洲;李平;张继星;陈永胜;;蓖麻BCH基因的克隆与序列分析[J];内蒙古民族大学学报(自然科学版);2016年05期

4 冯紫洲;耿学军;李平;张继星;陈永胜;霍红雁;冀照君;穆莎茉莉;丛娇娇;李惠根;;蓖麻RcNHX2基因克隆与生物信息学分析[J];分子植物育种;2016年11期

5 孙华军;李国瑞;黄凤兰;李跃;丛安琪;李威;齐蒙;陈永胜;;蓖麻矮化相关基因RcDof的克隆及分析[J];华北农学报;2016年04期

6 杨俊芳;王亚;张欢欢;王亦学;郝耀山;郭志强;王宏伟;;农杆菌介导萌动种胚转化法将抗草甘膦基因导入蓖麻[J];中国油料作物学报;2016年02期

7 陈晓凤;黄凤兰;赵永;姜桐桐;李佳会;周婷婷;常旭丰;刘佳琪;;cDNA-AFLP分析不同发育时期蓖麻种子脂肪酸差异基因表达的关键技术[J];安徽农业科学;2016年06期

8 黄凤兰;雷雪;赵永;李国瑞;罗蕊;陈晓凤;李跃;孙华军;;毒蛋白A链基因被共抑制的蓖麻种子中毒蛋白含量的测定[J];华北农学报;2016年01期

9 狄建军;张树军;陈宇杰;朱小慧;王云;;通蓖5号蓖麻籽粒干物质及粗脂肪积累规律研究[J];内蒙古民族大学学报(自然科学版);2016年01期

10 杨炳艳;刘云婷;胡文靖;么大轩;段会军;;基于cDNA-AFLP及MSAP技术分析西瓜同源二倍体和四倍体低温胁迫差异表达[J];植物遗传资源学报;2015年06期

相关硕士学位论文 前1条

1 刘丽娟;水稻OsCesA4基因的纤维素合成与纤维性状调控功能研究[D];湖南农业大学;2014年

【二级参考文献】

相关期刊论文 前10条

1 薛仁风;朱振东;王晓鸣;王兰芬;武小菲;王述民;;普通菜豆镰孢菌枯萎病抗病相关基因PvCaM1的克隆及表达[J];作物学报;2012年04期

2 孙霞;刘晋跃;袁晓辉;潘相文;杜维广;任海祥;马永波;Jun ABE;邱丽娟;刘宝辉;;非生物胁迫诱导的GmMYB基因克隆与表达分析[J];作物学报;2012年02期

3 王育华;邹杰;陈信波;;植物丝氨酸羧肽酶及其类蛋白的研究进展[J];生物学杂志;2010年06期

4 冯英;俞朝;;水稻与拟南芥全基因组丝氨酸羧肽酶类蛋白家族比较分析(英文)[J];浙江大学学报(农业与生命科学版);2009年01期

5 任增凯;禹山林;杨庆利;潘丽娟;陈明娜;郑强;;花生种子总RNA提取的一种有效方法[J];花生学报;2008年03期

6 徐莎;胡军;陈宇红;胡赞民;向其柏;;DREB转录因子研究进展[J];农业生物技术学报;2008年04期

7 姚滢秋;陈星;王璞;梁燕;闫梅;肖白;;高质量提取大豆叶片总RNA的改良方法[J];生物技术通报;2008年01期

8 丁勇;刘英;杨鸯鸯;甘莉;;油菜种子高质量总RNA提取的一种有效方法[J];华中农业大学学报;2006年05期

9 郑鹭;祁建民;陈绍军;方平平;;蓖麻遗传育种进展及其在生物能源与医药综合利用潜势[J];中国农学通报;2006年09期

10 冯英,刘庆坡,贾佳,薛庆中;拟南芥丝氨酸羧肽酶类蛋白家族的基因组学分析[J];遗传学报;2005年08期

相关硕士学位论文 前4条

1 马杰;水稻OsRHC22基因功能的初步研究[D];湖南农业大学;2012年

2 李灵之;3个水稻WAX2同源基因的蜡质合成及抗逆性功能分析[D];湖南农业大学;2012年

3 刘翠芳;水稻Hsp17.0、DREBA5-1和RAV1-1基因功能的初步研究[D];湖南农业大学;2011年

4 邹杰;水稻OsHSP基因表达分析与遗传转化研究[D];湖南农业大学;2008年

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 田清震,郑洪源,郭志强;单雌蓖麻的研究与应用[J];中国油料作物学报;2001年03期

2 李靖霞,李金琴,包红霞,王建伟;蓖麻引种的基本原理及规律[J];内蒙古农业科技;2003年02期

3 李靖霞;李金琴;包红霞;王建伟;;蓖麻引种的基本原理及规律[J];种子世界;2003年04期

4 王春义;;旱作高效的经济作物——蓖麻[J];农村实用科技信息;2006年04期

5 严兴初;王力军;;蓖麻作为能源开发的现状与前景[J];安徽农业科学;2007年34期

6 赵崇耀;;陕北蓖麻产业发展问题探讨[J];陕西农业科学;2009年06期

7 季志强;董学;高立起;许利平;;浅议蓖麻产业发展优势和前景[J];农业科技通讯;2010年02期

8 刘婷婷;孙丽娟;张宝贤;刘红光;谭德云;王光明;;提高蓖麻产量的途径[J];农业科技通讯;2011年09期

9 朱国立;何智彪;贾娟霞;莫德乐吐;张智勇;乔文杰;陈丽丽;;我国栽培蓖麻的生态区划及引种规律初探[J];内蒙古农业科技;2012年05期

10 李孔徒;曹嘉谟;;蓖麻生产几个技术问题的探讨[J];江西农业科技;1981年01期

相关会议论文 前5条

1 冯广敏;刘恩利;;蓖麻亩产超千斤高产高效栽培技术的研究[A];中国作物学会2005年学术年会论文集[C];2005年

2 江惠琼;李文昌;;宿生蓖麻的栽培技术措施[A];云南省作物学会2000—2003年优秀论文选集[C];2004年

3 方平平;郑鹭;祁建民;林荔辉;吴建梅;陶爱芬;;蓖麻种质资源遗传多样性与亲缘关系ISSR分子标记研究[A];2008中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2008年

4 郑鹭;祁建民;方平平;林荔辉;吴建梅;陶爱芬;;蓖麻种质资源遗传多样性与亲缘关系SRAP分子标记研究[A];2008中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2008年

5 张德刚;周磊;刘艳红;李春燕;;云南个旧锡矿废弃地野生蓖麻重金属富集特征[A];十一五农业环境研究回顾与展望——第四届全国农业环境科学学术研讨会论文集[C];2011年

相关重要报纸文章 前5条

1 文学 徐华军 马志勇;向蓖麻要石油[N];科技日报;2002年

2 吉林省磐石市光明油脂化工厂 李文和;蓖麻[N];陕西科技报;2003年

3 ;朱国立其人其事[N];科技日报;2002年

4 冯春贤;蓖麻种植技术[N];福建科技报;2006年

5 专技;土地里写“神奇”[N];通辽日报;2006年

相关硕士学位论文 前10条

1 李春雷;Cu胁迫对蓖麻生理反应和积累特性的影响[D];华中农业大学;2016年

2 吕二锁;蓖麻不同杂交组合的杂种优势和性状遗传表现的研究[D];内蒙古农业大学;2011年

3 李文昌;蓖麻雌性单株两种无性繁殖技术研究及繁殖体系构建[D];中国农业大学;2005年

4 江惠琼;云南红壤上蓖麻的N、P、K吸收与施肥技术研究[D];中国农业大学;2005年

5 高艳平;蓖麻成熟期胚抑制消减cDNA文库构建及其差异表达基因分析[D];华中农业大学;2009年

6 王金妹;蓖麻耐盐性的初步研究[D];辽宁师范大学;2011年

7 陈梅;外源激素对蓖麻营养生长及开花结实的影响[D];中南林业科技大学;2012年

8 袁晓宇;神东矿区采煤塌陷区蓖麻适应性及栽培技术研究[D];内蒙古农业大学;2009年

9 于荣;宁夏灌区蓖麻适应性及栽培技术研究[D];中国农业大学;2005年

10 莫德乐吐;蓖麻杂交种通蓖6号高产优质高效栽培技术研究[D];内蒙古民族大学;2008年

，

本文编号：2490798