文心兰铁氧还蛋白基因克隆定位及表达分析

发布时间：2019-06-03 02:09

【摘要】：采用RACE-PCR法,从‘小樱桃’文心兰中克隆到一个全长989bp的铁氧还蛋白基因cDNA序列,命名为OnFd(登录号KX461907)。OnFd基因开放阅读框长为465bp,预测可编码154个氨基酸;gDNA和cDNA序列比对结果显示OnFd基因不含内含子。生物信息学分析表明,OnFd具有1个典型的[2Fe-2S]结构域;同源分析显示,OnFd与玉米Fd3的相似度最高(64.29%)。蛋白亚细胞定位结果显示OnFd定位于叶绿体。实时荧光定量PCR检测发现:OnFd基因在花中表达量最高,其次是叶与根,在假鳞茎中表达量最低;接种病原菌研究显示,文心兰感染软腐病后,各个部位的OnFd基因表达量均呈上升趋势,尤其是接种部位假鳞茎在接种病原菌1d后表达量便表现出极显著上调,并且在5个感病阶段的表达量是健康植株的2.83~3.98倍。研究表明,OnFd基因可能在文心兰响应抗软腐病过程中具有重要作用。
[Abstract]:A full-length 989bp cDNA sequence of ferredoxin gene, named OnFd (the length of open reading frame of accession number KX461907). OnFd gene was 465bp), was cloned from 'Cherry' Wenxin orchid by RACE-PCR, and it was predicted that it could encode 154amino acids. The results of gDNA and cDNA sequence alignment showed that OnFd gene did not contain introns. Bioinformatics analysis showed that OnFd had a typical [2Fe-2S] domain, and homology analysis showed that the similarity between OnFd and corn Fd3 was the highest (64.29%). The results of protein subcellular localization showed that OnFd was located in chloroplast. Real-time fluorescence quantitative PCR showed that the expression of OnFd gene was the highest in flowers, followed by leaves and roots, and the lowest in pseudo-bulb. The study of inoculated pathogenic bacteria showed that the expression of OnFd gene in all parts of Euphorbia pulcherrima increased significantly after inoculated with soft rot, especially after 1 day of inoculating pathogen. The expression of 2.83 脳 3.98 times as much as that of healthy plants in five susceptible stages. Studies have shown that OnFd gene may play an important role in the response of Wenxinlan to soft rot resistance.
【作者单位】： 福建农林大学园艺植物生物工程研究所;
【基金】：福建省重大科技专项(2015NZ0002-1)
【分类号】：S682.31

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本文编号：2491592