谷子窄颖花突变体sins1的表型分析和突变基因定位
【图文】:
3期张浩等:谷子窄颖花突变体sins1的表型分析和突变基因定位A、B、D、E、F:成熟期的植株、穗、谷码、根、叶;C:花A,B,D,E,F:Wholeplantphenotype,spike,spikelet,root,leafatmaturestage,C:Flower图1野生型(Yugu1)和突变体(sins1)成熟期表型比较Fig.1Phenotypeofthemutant(sins1)anditswild-typeparent(Yugu1)atmaturestage2.3突变体sins1的初步定位在9条染色体上均匀选取了196对SSR引物,检测它们在突变体sins1与SSR41之间的多态性。最终确定可用的标记数量为66个。这66个标记基本覆盖了9条染色体,分布频率满足BSA隐性个体基因混池法的要求,其中在1~9号染色体上分别有7、8、8、6、8、7、6、7、9个多态性标记。利用BSA隐形混池法对这66个标记分别扩增父本SSR41、母本sins1、F1、隐性混池(P),发现在3号染色体上有1个与目的基因紧密连锁的标记CAAS3031(图3-A)。从图3-A可以看出,在标记CAAS3031的混池条带中母本(sins1)带扩增明显,,未出现父本(SSR41)条带。进一步在CAAS3031的上下游寻找标记,最后选出3个可用的标记,分别为SIMS18978、CAAS3132、CAAS3036。用这3个标记分别检测120株收取的窄颖花表型植株叶片DNA,根据电泳检测结果,将窄颖花突变基因sins1定位在SIMS18978(图3-B)与CAAS3031这2个标记之间,物理距离为11.53Mb。为了缩小区间,在11.53Mb的区间内,设计了20个SSR标记,对这些SSR标记在母本(sins1)与父本(SSR41)之间进行多态性检测,仅发现5对标记可用,分别为3-2318、3-2428、3-2534、3-2658、3-2979。通过6%聚丙烯酰胺凝胶电泳对F2群体中963份隐性单株进行检测,最终将目的基因定位在标记3-2658和CAAS3031间的7.709Mb区间(表1)。因为F2群体只选取了963份单株,因此无法继续?
3期张浩等:谷子窄颖花突变体sins1的表型分析和突变基因定位表1SSR标记检测结果Table1TestresultsofSSRmarkers株号CodeSSR标记SSRmarkersSIMS189783-23183-24283-25343-26583-2979CAAS3132CAAS3031CAAS30362HSSSSSSSS18HHHHSSSSH21HHHSSSSSS34HSSSSSSSS45HSSSSSSSS84SSSSSSSSH85HHHSSSSSS109SSSSSSSSH114HSSSSSSSH158HHHHHSSSS553SSSSSSSHH554HHHSSSSSS567HHSSSSSSS610HHHHSSSSS773SSSSSSSHH779HHSSSSSSH792SSSSSSSHH921SSSSSSSHHS:母本sins1突变体带型;H:同时具有双亲带型S:Thestripofsins1,H:Theindividualswiththestripsofparents图4窄颖花突变基因sins1的定位Fig.4Genemappingofthenarrowspikeletmutantsins13讨论花性状的变异是非常重要的表型突变,会直接导致粮食作物产量的变化。之前关于花发育的研究多集中在模式作物拟南芥,但是近年来随着生物技术的发展,在单子叶植物的研究也越来越多。如在水稻中,GS3基因负责编码一个包含232个氨基酸的蛋白,并且含有一个类PEBP结构域。GS3含有5543
【作者单位】: 山西大学生物工程学院;中国农业科学院作物科学研究所;山西省农业科学院农作物品种资源研究所/农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室;
【基金】:国家现代农业产业技术体系(CARS07-13.5-A02) 中国农业科学院创新工程杂粮团队 国家“863”计划(2013AA102603) 国家自然科学基金(31301328,31522040)
【分类号】:S515
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本文编号:2517709
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