桃FLA家族基因的生物信息学及表达分析

发布时间：2019-08-27 14:51

【摘要】：从桃基因组数据库筛选出了12个假定的成束状阿拉伯半乳糖蛋白(FLA)基因序列。对其蛋白结构进行分析,结果显示PpFLA7不具有特定的阿拉伯糖或半乳糖糖基化位点,不属于典型的FLA家族。PpFLA6的氨基酸组成和保守域的分布与其他成员相比差别较大。聚类分析结果表明PpFLAs家族可以分为CladeⅠ、CladeⅡ和CladeⅢ3类。利用荧光定量PCR(qPCR)对不同组织和成熟阶段果实中的FLA进行表达分析,发现各个成员在不同时期的组织中差异化表达,其中PpFLA4在果实成熟阶段显著上调表达,暗示其可能在桃果实的成熟阶段扮演重要角色。
【图文】：

BianKun，ShaoJiarong，XuLiwei，，ShenZiming，ChenWei，YangZhenfeng.BioinformaticandexpressionanalysisofFasciclin-likearabinogalactanproteins（FLAs）genefamilyinpeach.658ActaHorticulturaeSinica，2017，44(4)：653 663.图1桃（Pp）和拟南芥（At）FLA蛋白成束区域序列比对结果Fig.1Alignmentofmultiplesequencesencodingthefasciclin-likedomainsofPpFLAsandAtFLAs图2桃FLA蛋白结构简图Fig.2SchematicrepresentationofFLAsinpeach

BianKun，ShaoJiarong，XuLiwei，ShenZiming，ChenWei，YangZhenfeng.BioinformaticandexpressionanalysisofFasciclin-likearabinogalactanproteins（FLAs）genefamilyinpeach.658ActaHorticulturaeSinica，2017，44(4)：653 663.图1桃（Pp）和拟南芥（At）FLA蛋白成束区域序列比对结果Fig.1Alignmentofmultiplesequencesencodingthefasciclin-likedomainsofPpFLAsandAtFLAs图2桃FLA蛋白结构简图Fig.2SchematicrepresentationofFLAsinpeach
【作者单位】： 上海海洋大学食品学院;浙江万里学院生物与环境学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31371866) 浙江省自然科学基金项目(LQ15C200004) 浙江省重中之重学科学生创新项目(1740002979)
【分类号】：S662.1

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：2529831