高羊茅FaFT2基因克隆及表达分析

发布时间：2019-11-28 23:22

【摘要】：以高羊茅(Festuca arundinacea)‘黔草1号’为材料,利用c DNA末端快速扩增(RACE)技术克隆了调控植物开花关键基因FLOWERING LOCUS T(FT),命名为FaFT2。序列分析结果表明,FaFT2基因cDNA全长1 073 bp,具有开放阅读框为537bp,编码一条含178个氨基酸残基的蛋白质。该蛋白序列比对发现,所推测的FaFT2氨基酸序列具有1个保守的磷脂酰乙醇胺结合蛋白(PEBP)结构域。系统遗传进化树分析表明FaFT2与黑麦草、节节麦和二穗短柄草的FT亲缘关系较近。利用实时荧光定量PCR技术分析高羊茅苗期FaFT2表达水平,发现该基因在光照时段表达水平持续上调,黑暗时段表达水平下调。由此推测,FaFT2基因与高羊茅光周期敏感性具有一定的相关性,可能在光周期调控开花途径中发挥作用。
【图文】：

与二级结构分析预测的相同(图6)。在线软件SignalP4.1分析的结果表明该蛋白无信号肽序列。4高羊茅FaFT2氨基酸序列的系统进化通过NCBI中BLAST搜索比对,采用MEGA6.0软件对FaFT2基因编码的氨基酸序列和Gen-Bank收录的19种植物的同源序列构建系统进化树,聚类后进行分析,结果表明,高羊茅与黑麦草(AMB21810.1)氨基酸序列一致性为95%,与节节麦(XP020173323.1)氨基酸序列一致性为98%,与二穗短柄草(XP010238355.1)氨基酸序列一致性为97%,与高粱(KXG35998.1)和玉米(ONM22839.1)的氨基酸序列一致性均在90%以上,与小野果芭蕉图1FaFT2基因cDNA扩增电泳图Fig.1ElectropherogramsofcDNAamplificationofFaFT2geneA:3'RACE;B:5'RACE;C:cDNART-PCR。M:DL2000marker。

1526植物生理学报(AIU38061.1)、番木瓜(ACX85427.1)及毛白杨(AFU08240.1)序列一致性为80%以上。高羊茅首先与黑麦草、节节麦和二穗短柄草聚为一类,然后与玉米和高粱亲缘关系较近(图7)。5高羊茅FaFT2基因的表达特征采用实时荧光定量PCR技术分析高羊茅幼苗期叶片中FaFT2基因在48h昼夜的表达水平,结果显示,第一个光周期内,在光照条件下12:30~20:30,图2FaFT2基因的核苷酸序列及推导的氨基酸序列Fig.2ThenucleotideanddeducedaminoacidsequencesofFaFT2gene图3FaFT2保守功能域的预测分析Fig.3PredictionofconserveddomainsofFaFT2

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