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东海原甲藻热激蛋白90和视紫红质基因的克隆及环境应答

发布时间:2019-12-04 13:38
【摘要】:赤潮是当前全球性的海洋环境热点问题。东海原甲藻(Prorocentrum donghaiense)是我国近海海域常见的赤潮藻种,当前对东海原甲藻在各种胁迫环境下的分子适应机制研究不够深入。本文主要对东海原甲藻的两种重要基因—热激蛋白90(Heat Shock Protein 90,HSP90)和视紫红质进行了克隆和表达分析,以期增加对东海原甲藻在各种环境条件下的分子适应机制的认识。HSP90是一种分子伴侣,在帮助蛋白质折叠、维持蛋白结构完整以及保护细胞免受环境胁迫等方面具有重要作用。以前期获得的部分HSP90基因序列为基础,设计了特异性扩增引物,通过c DNA末端快速扩增(Rapid Amplification of c DNA Ends,RACE)技术获得了HSP90的5'端和3'端,将5'端和3'端序列进行拼接,得到了2 443 bp的全长cDNA。将序列提交至Gen Bank数据库,得到的入口号为KX899924。东海原甲藻HSP90基因的全长c DNA序列包括1个111 bp的5′-UTR,1个199 bp的3′-UTR并含有一个poly(A)尾巴,ORF的长度为2 133 bp。ORF编码711个氨基酸,预测氨基酸的等电点为4.95,分子量为85.81 k Da。系统发育树显示,东海原甲藻HSP90属于甲藻属,并与Gen Bank中的Prorocentrum minimun(Accession No.ADP65795.1)和Prorocentrum micans(Accession No.AAR27546.1)的HSP90关系较近。荧光定量PCR结果表明:在温度胁迫下,HSP90的相对表达量在10℃时达到最大,并与20℃相比有显著差异(P0.05),在20℃以下时,HSP90的表达量随着温度升高而逐渐降低,在温度高于20℃时,HSP90的表达量随着温度升高而升高;在氮胁迫下,氮浓度在88μM时HSP90的相对表达量最大,并与对照组(氮浓度为880μM)有显著差异(P0.05);在磷胁迫下,磷浓度在3.6μM时HSP90的相对表达量最大,并与对照组(磷浓度为36.0μM)有显著差异(P0.05),随着氮或磷浓度的降低,HSP90的表达量都呈现先升高后降低的趋势;在铜离子胁迫下,铜离子浓度在31.25μM时HSP90的相对表达量最大,并与对照组(铜离子浓度为0μM)有显著差异(P0.05),HSP90的相对表达量在达到最大值10.81倍后又降低到最小值3.04倍。上述结果说明,温度、营养盐和重金属等胁迫条件可以致使HSP90大量表达以对抗环境胁迫带来的负面影响。视紫红质的主要功能是捕获光能并将其转化为其他能量,该基因在原甲藻中研究甚少,其对不同光谱和光强的转化机制尚未清楚。以前期获得的部分视紫红质基因序列为基础,设计了特异性引物,通过RACE技术获得了视紫红质的5'端和3'端,将5'端和3'端序列进行拼接,得到了1 104 bp的全长c DNA。将该序列提交至Gen Bank数据库,得到的入口号为KY399746。东海原甲藻视紫红质基因c DNA序列包含1个106 bp的5′-UTR,1个221 bp的3′-UTR并含有一个poly(A)尾巴,ORF的长度为777 bp。ORF编码259个氨基酸,预测氨基酸的等电点为5.83,分子量为28.79 k Da。系统进化发育分析发现,东海原甲藻的视紫红质基因与Gen Bank中的Pseudo-nitzschia granii(Accession No.AJA37445.1)的视紫红质基因基因在同一分支,亲缘关系较近。荧光定量PCR结果显示:在持续光照循环中,视紫红质基因的表达量随光照时间延长表现出先升高后降低的趋势;在持续黑暗循环中,视紫红质基因的表达量呈现逐渐降低的趋势,且各组与对照组均有显著差异(P0.05);在暗亮光照循环中,视紫红质基因的表达量在黑暗条件下逐渐降低,恢复光照后表达量又急速上升;在红光、蓝光和绿光照射下,视紫红质基因的表达量在绿色光照组表达量最高,且蓝光、绿光均与白光(对照组)有显著差异(P0.05);在磷胁迫下,视紫红质的表达量随着磷浓度降低而减少,当磷浓度低于7.2μM时,视紫红质的表达量与对照组均有显著差异(P0.05)。进一步通过构建视紫红质基因的重组表达载体,制备视紫红质蛋白重组表达菌株,并用其对该蛋白的光谱特性进行初步分析,发现视紫红质蛋白在320 nm处有最大吸收峰。上述结果为了解东海原甲藻在环境胁迫下的适应机制提供了新见解,对研究其他甲藻的适应机制也有一定的借鉴意义。
【图文】:

标准曲线,内参,引物,标准曲线


28图 2-10 内参基因 GAPDH 引物的扩增曲线和标准曲线Fig. 2-10 The amplification plot and standard curve of GAPDH primers

标准曲线,标准曲线,温度条件,对照组


29图 2-11 HSP90 基因引物的扩增曲线和标准曲线Fig. 2-11 The amplification plot and standard curve of GAPDH prime温度胁迫下 HSP90 基因表达胁迫下 HSP90 基因的相对表达量如图 2-12 所示。其中,20 与对照组相比,,具有显著差异(P < 0.05)的是 10 °C 、15 °C10 °C 时,HSP90 的表达量达到最大,是对照组的 7.6 倍;其次,在这两个温度条件下 HSP90 表达量接近,并为对照组的 5.1 在 25 °C 最低,为对照组的 2.8 倍,并且和对照组没有显著两个极端的温度条件 10 °C 和 30 °C 虽然没有显著差异(P > 胁迫下 HSP90 表达量比较多的两组。温度两两接近的两组比
【学位授予单位】:哈尔滨工业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2017
【分类号】:Q943.2

【参考文献】

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本文编号:2569636

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