油橄榄转录组数据库中HMGR基因的挖掘及生物信息学分析

发布时间：2020-02-17 11:29

【摘要】：药用植物中萜类次生代谢产物数量庞大,结构多样,药理活性突出。3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR)是MVA途径中第一个速控酶,对药用植物活性萜类成分的生物合成起重要调控作用。HMGR在很多植物中均有研究,但未见油橄榄中该基因的报道。本研究从油橄榄转录组数据库中挖掘到两条HMGR基因序列(Oe HMGR1和Oe HMGR2),并对其编码蛋白的理化性质、结构特征、功能及系统进化关系进行了预测分析。结果表明,Oe HMGR1基因与人参Pg HMGR基因一致性达到80%,含有1 713 bp的开放阅读框(ORF);Oe HMGR2基因与人参Pg HMGR基因一致性达到76%,含有1 773 bp的ORF。Oe HMGR基因编码蛋白均包含2个跨膜区,不含信号肽,具有N、L、S 3个催化活性中心结构域。Oe HMGR基因位于双子叶植物进化枝,在进化中保守度较高,Oe HMGR1与Eu HMGR和Pg HMGR遗传距离较近,Oe HMGR2与Js HMGR遗传距离最近。本研究为进一步鉴定Oe HMGR的功能和开展萜类成分的合成生物学研究提供了一定的理论依据。

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本文编号：2580394