烟草NtNHX1-1基因特征分析

发布时间：2020-03-14 11:15

【摘要】：烟草是中国重要的经济作物之一。盐胁迫对烟草生产造成巨大危害,克隆盐胁迫响应基因,为从分子水平抵御盐胁迫提供基因资源。本研究克隆了Na+/H+反向转运蛋白基因。该基因编码的蛋白为膜蛋白,具有12个跨膜区。进化分析表明,Nt NHX1-1与番茄的Sl-NHX1遗传距离最近,相似性为95%,其次为甜辣椒的Ca-NHX2,相似性为94%。组织特性表达分析表明,NtNHX1-1基因在茎中表达最高、其次为叶、花和根。NaCl处理后NtNHX1-1基因的表达明显上调,表明该基因可能在烟草抵抗盐胁迫中发挥重要功能。通过调控NtNHX1-1基因的表达有望获得耐盐胁迫烟草新品系。
【图文】：

Bassiletal.,2011)等生理过程中发挥重要功能。烟草是中国重要的经济作物之一，中国盐渍化土壤日益加重，培育耐盐渍化烟草品种可以增加烟草种植面积。同时，提高钾含量可以提高烟叶品质。所以克隆烟草NHX1基因并研究其功能，对烟叶生产意义重大。1结果与分析1.1烟草NtNHX1-1基因克隆通过NCBI数据库比对、ORF分析获得烟草NtNHX1-1基因序列信息。通过PCR扩增获得1600bp左右一个片段(图1)，回收后测序，结果与NCBI数据库中的序列100%一致。NtNHX1-1基因全长CDS和推测的氨基酸序列(图2)。1.2NtNHX1-1蛋白质结构及进化分析利用在线工具预测NtNHX1-1蛋白的理论等电点为6.86，分子量为58.90kD。WolfpSORT预测NtNHX1-1为膜蛋白，TMpred分析NtNHX1-1具有12个跨膜区，与拟南芥AtNHX1-1一致。SignalP4.1预测NtNHX1-1没有信号肽。二级结构预测NtNHX1-1主要含有ɑ螺旋，，占34.89%，其次是β折叠和无规则卷曲，分别占28.17%和26.87%，β转角占10.07%。将NtNHX1-1与拟南芥AtNHX1蛋白序列进行比对，序列比对结果显示在12个跨膜区NtNHX1-1与AtNHX高度同源(图3)，与TMpred预测结果一致。将烟草NtNHX1-1与番茄(Sl-NHX1:NP_00123-3885.2)、甜辣椒(Ca-NHX2:XP_016553152.1)，枣(Zj-NHX2:XP_015875303.1)、冰菜(Mc-NHX1:CAN995-89.1)、木豆(Cc-NHX1:KYP74415.1)、番杏(Tt-NHX1:AAQ08988.1)、大豆(Gm-NHX1:AAY43006.1)、绿豆(Vr-NHX2:NP_001304257.1)、葡萄(Vv-NHX1:XP_010649604.1)、花生(Ai-NHX1:XP_016175144.1)、胡杨(Pe-NHX1:XP_011032540.1)、苜蓿(Mt-NHX1:XP_013469021.1;Ms-NHX1:AAR19085.1)、蓖麻(Rc-NH-X1:NP_001310702.1)、川桑(Mn

本文编号：2586974