KCNQ1基因多态性与汉族人群2型糖尿病易感性的关联

发布时间：2020-04-28 22:52

【摘要】：目的研究电压门控钾通道亚家族Q1(Poyassium voltage-gated channel,KQT-like subfamily member 1,KCNQ1)基因多态性与2型糖尿病(Type 2 diabetes mellitus,T2DM)易感性的关系,阐述基因-环境交互作用对T2DM遗传易感性的影响。方法研究共纳入522名T2DM患者,按照同性别、年龄(±3岁)的原则匹配522名对照者。被调查者均来自于河南农村队列研究(注册号:ChiCTR-OOC-15006699)。采用SNPscan~?技术实现KCNQ1基因rs163182位点、rs2237892位点、rs2283228位点和rs2299620位点的基因分型,采用配对t检验和配对χ~2检验进行基本特征的比较;运用方差分析比较不同基因型空腹血糖浓度的分布情况;采用条件logistic回归探讨基因多态性与T2DM易感性的关联;构建遗传风险评分并分析其与T2DM易感性的关联;采用R软件分析单体型与T2DM易感性的关联;通过多因子降维法分析基因与环境的交互作用,探讨rs2299620位点和体质指数(Body mass index,BMI)的相加和相乘交互作用与T2DM的关联。结果1.一般特征的分析:病例组和对照组之间文化程度、婚姻状况、吸烟、饮酒、体力活动、BMI、腰围、腰身比、腰臀比、血压相关指标和空腹血糖浓度的分布差异均具有统计学意义(P0.05)。2.基因多态性分析:调整协变量后,相对于原始基因型CC,KCNQ1基因rs2299620位点TT基因型与T2DM易感性之间相对危险度(Odds ratio,OR)及95%可信区间(Confidence interval,CI)是0.578(0.358,0.931),T等位基因与T2DM易感性存在负相关关联(OR:0.761,95%CI:0.626,0.926)。rs2237892位点TT基因型相对于原始基因型CC与T2DM易感性的关联是0.807(0.606,1.073),T等位基因与T2DM易感性的关联是0.772(0.632,0.943)。rs163182位点的C等位基因相对于G基因与T2DM的关联是0.974(0.806,1.178)。rs2283228位点的C等位基因相对于A基因与T2DM的关联是0.899(0.742,1.088)。3.单体型分析:与单体型GCAC相比,单体型GTCT与T2DM的易感性的关联是0.695(0.546,0.884)。CCAC、CCAT、CCCC、GCCC、GCCT、GTAC和GTCC单体型未发现与T2DM的易感性有关联。4.遗传风险评分分析:在简单遗传风险评分中,评分值增加与T2DM易感性的关联是0.878(0.768,1.004)。加权遗传风险评分和基于微小等位基因频率(Minor Allele Frequency,MAF)的加权遗传风险评分的模型中Q4组人群与T2DM易感性的关联分别是0.567(0.356,0.903)和0.561(0.352,0.893)。随着评分值增加,两种加权模型中发生T2DM的风险分别是0.867(0.757,0.994)和0.857(0.751,0.979)。5.基因-环境交互作用分析:rs2299620位点和BMI构成的模型是研究中的最优交互模型。rs2299620位点和BMI存在负相加交互作用,相对超额危险度为-1.220(-2.348,-0.092),交互作用归因比为-0.634(-1.184,-0.084),交互作用指数为0.431(0.190,0.672)。二者相乘模型与T2DM易感性的关联为0.611(0.384,0.972)。结论1.KCNQ1基因rs2299620位点TT基因型与T2DM呈负相关。rs2237892位点的T等位基因和rs2299620位点的T等位基因可降低T2DM的易感性。2.KCNQ1基因四个位点构成的单体型GTCT、较高的加权遗传风险评分和基于MAF的加权遗传风险评分均会降低T2DM的发生。3.KCNQ1基因rs2299620位点和BMI在T2DM的发生中存在相乘和相加交互作用。
【图文】：

荧光峰,位点,基因

9图 2.1 KCNQ1 基因四个位点不同基因型的荧光峰图（A：rs163182 位点荧光峰图；B：rs2237892 位点荧光峰图；C：rs2283228 位点荧光峰图；D：rs2299620 位点荧光峰图。）

位点,基因,协变量,易感性

图 3.1 KCNQ1 基因四个位点不同基因型的空腹血糖浓度分布rs163182 位点不同基因型空腹血糖浓度；B：rs2237892 位点不同基因型空腹血糖浓度3228 位点不同基因型空腹血糖浓度；D：rs2299620 位点不同基因型空腹血糖浓度。）KCNQ1 基因 4 个位点的多态性、等位基因的分布及其与 T2DM 易感性果见表 3.4。调整协变量后，在 rs2237892 位点上，与野生纯合子基因型，突变杂合子 CT 基因型与 T2DM 易感性的关联为 0.853（0.630, 1.15纯合子 TT 与 T2DM 的易感性呈现负相关（OR: 0.642, 95%CI: 0.389, 1.0始基因 C 相比，突变基因 T 调整协变量前和调整协变量后对应的5%CI）分别是 0.800（0.663, 0.965）和 0.772（0.632, 0.943）。在 rs229上，，调整协变量后，突变基因型 TT 发生 T2DM 的风险是野生纯合子基的 0.578 倍（95%CI: 0.358, 0.931），CT 基因型发生 T2DM 的风险是 0.886（5）。突变基因 T 与 T2DM 的易感性关联是原始基因 C 的 0.761 倍（956, 0.926）。在 rs163182 位点上，等位基因 C 相对于 G 发生 T2DM 的风4（0.806, 1.178）。在 rs2283228 位点上，等位基因 C 相对于 A 发生 T
【学位授予单位】：郑州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R587.1

【参考文献】