胃黏膜基因芯片技术在儿童幽门螺杆菌感染诊断及耐药性检测中的应用研究

发布时间：2020-08-21 04:28

【摘要】：研究背景:幽门螺杆菌(helicobacter pylori,Hp)感染是一个全球性的问题,全世界人群感染率已超过50%,根除Hp可以提高消化性溃疡愈合率,减少胃癌的发病率,但Hp的根除率逐渐下降,甚至低于80%。Hp培养仍是诊断Hp感染的金标准方法,并可进行药敏试验、细菌分型和致病基因的研究等,但Hp培养耗时,技术要求高,阳性率低。如何快速准确的诊断Hp感染并根据耐药性选择治疗方案是及早有效治疗Hp的关键。目的:通过胃黏膜基因芯片技术快速高通量检测儿童幽门螺杆菌(Hp)感染及其耐药性,并与Hp培养及药敏结果相比较,评估胃黏膜基因芯片技术在儿童Hp感染的诊断及其耐药性检测中的临床应用价值。方法:对2016年1月至2016年5月因恶心、呕吐、腹痛、黑便等消化系统症状在本院门诊或住院的患儿,行电子胃镜检查,胃镜下取3块胃窦部黏膜,常规进行病理组织学检查、快速尿素酶试验(RUT)、Hp分离培养并药敏试验。通过基因芯片技术快速检测Hp感染及Hp耐药基因情况。并对Hp培养和药敏检查结果与基因芯片耐药基因检查结果进行比较。结果:1.根据Hp现症感染诊断依据,分为Hp感染组(207例)和Hp非感染组(60例)。Hp培养阳性169例(均为Hp感染组患儿),阴性98例(Hp感染组38例,非感染组60例),其诊断Hp感染的敏感度、特异度、阳性预测值(PPV)、阴性预测值(NPV)和准确性分别为 81.6%、100.0%、100.0%、61.2%和 85.8%。而 Hp基因芯片检测阳性208例(Hp感染组199例、非感染组9例),阴性59例(Hp感染组8例,非感染组51例),其诊断Hp感染的敏感度、特异度、PPV、NPV和准确性分别为 96.1%、85.0%、95.7%、86.4%和 93.6%。2.169例Hp培养阳性的药敏结果显示,甲硝唑、克拉霉素和左氧氟沙星的耐药率依次为77.51%、33.72%、19.52%,全敏感株占11.83%;未检测到四环素及阿莫西林耐药菌株。而199例Hp感染组基因芯片检测显示,甲硝唑、克拉霉素、左氧氟沙星、阿莫西林的耐药率分别为44.72%、63.31%、18.09%、12.56%,全敏感株占14.07%;未检测到四环素耐药菌株。3.基因芯片检测Hp耐药基因位点结果,克拉霉素突变以2143A/G为主,占92.9%,其中有1个发生双突变;左氧氟沙星突变为91位点(占58.3%)、87位点(占41.7%);阿莫西林突变以556ser位点为主,占84%。4.对Hp培养药敏试验及耐药基因检测均阳性的130例患儿进行比较,结果显示,对甲硝唑耐药符合率为76.2%,甲硝唑敏感符合率为19.7%;对克拉霉素耐药符合率为52.2%,克拉霉素敏感符合率为92.8%;对左氧氟沙星耐药符合率为58.3%,左氧氟沙星敏感符合率为89.6%。5.对行基因芯片及测序检测的22例患儿样本进行比较,对VacA-S1/S2/M1/M2,16S-RNA,23S-RNA及gyrA的检测的一致率高于95%,对PBP1及rdxA的检测的一致率高于80%。结论:1.胃黏膜Hp基因芯片技术能快速诊断Hp感染,其敏感性和准确性高于Hp培养;2.基因芯片技术通过检测常见Hp耐药基因位点而快速判断耐药性,与Hp培养药敏结果相比,对四环素、克拉霉素、左氧氟沙星及阿莫西林敏感的符合率均高达90%左右,对甲硝唑敏感符合率较低;3.基因芯片技术及测序的一致性较好,基因芯片检查能很好的反应Hp耐药的基因型。4.胃黏膜基因芯片技术可用于儿童Hp感染的快速诊断和耐药性分析。
【学位授予单位】：浙江大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：R725.7

【参考文献】