基因芯片筛选稳定转染FATE/BJ-HCC-2基因的肝癌细胞中肿瘤转移相关差异表达基因
发布时间:2020-12-06 04:44
目的筛选稳定转染FATE/BJ-HCC-2基因的肝癌细胞中肿瘤转移相关的差异表达基因。方法分别提取稳定转染FATE/BJ-HCC-2的肝癌细胞(5B4)及转染空质粒的对照细胞(Mock)总RNA,通过基因芯片技术筛选差异表达基因。结果与Mock细胞比较,5B4细胞共筛选出1 694个差异表达基因,有11个基因表达差异明显,其中MMP-1、PTGS2、FN、CA9、IL-8、ILK、Areg 7个基因在转染FATE/BJ-HCC-2基因后表达量明显上升,差异倍数分别为81.80、49.86、11.30、16.26,3.48、2.79、2.20。E-cadherin、RhoBTB3、ALPP、HLA-DRB 4个基因表达量明显下降,差异倍数分别为-5.42、-2.23、-5.93、-8.03。结论采用基因芯片技术对FATE/BJ-HCC-2参与的肝癌转移的差异表达基因进行细致的筛选,其最终目的是为研究肝癌转移机制打下坚实的理论基础。
【文章来源】:重庆医学. 2016年12期 第1595-1597页 北大核心
【文章页数】:3 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 细胞的培养
1.2.2 细胞总RNA提取
1.2.3探针制备及芯片杂交
1.2.4检测与分析
1.2.5 实时荧光定量PCR(RT-PCR)技术验证
2 结果
2.1 总RNA提取结果
2.2 芯片杂交信号散点图
2.3 基因芯片检测结果分析
2.4 RT-PCR验证结果
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]MMP-1和TIMP-1在甲状腺癌组织中的表达及意义[J]. 周艳华,周华山,吴平. 中国现代医药杂志. 2015(04)
[2]利用基因芯片技术筛选食管癌细胞侵袭转移的相关分子靶标[J]. 张琪琪,张志强,温浩,李秀娟. 中国老年学杂志. 2015(08)
[3]HLA-DRB1基因多态性与乳腺癌关联研究的Meta分析[J]. 董燕,木克代斯·拜克提亚尔,艾秀清,木妮热·木沙江. 实用肿瘤杂志. 2015(02)
[4]microRNA与肝癌研究进展[J]. 邢茜,陈思宇. 肿瘤基础与临床. 2014(05)
[5]胃癌患者血清VEGF和IL-8水平变化及临床意义[J]. 黄美君,梁小裕,管敏昌,李巍,泮宏伟,陈恩信. 中国卫生检验杂志. 2014(19)
[6]乳腺癌转移相关基因的筛选与生物信息学分析[J]. 余海浪,夏晓燕,丁大鹏,周珏宇,郑文岭,马文丽. 中国生物化学与分子生物学报. 2012(11)
[7]应用基因芯片筛选不同胶质瘤细胞相关基因[J]. 张红,楚胜华,冯东福,马延斌,邱建华,朱志安. 中华实验外科杂志. 2012 (02)
[8]MMP1、TIMP1和TIMP3在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义[J]. 陈中,张素欣,张雨温. 现代口腔医学杂志. 2011(06)
[9]FATE/BJ-HCC-2基因表达促进细胞增殖及肿瘤形成[J]. 闫萌,王巍,杨小昂,张毓,尹艳慧,陈慰峰. 中国生物化学与分子生物学报. 2008(08)
本文编号:2900746
【文章来源】:重庆医学. 2016年12期 第1595-1597页 北大核心
【文章页数】:3 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 细胞的培养
1.2.2 细胞总RNA提取
1.2.3探针制备及芯片杂交
1.2.4检测与分析
1.2.5 实时荧光定量PCR(RT-PCR)技术验证
2 结果
2.1 总RNA提取结果
2.2 芯片杂交信号散点图
2.3 基因芯片检测结果分析
2.4 RT-PCR验证结果
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]MMP-1和TIMP-1在甲状腺癌组织中的表达及意义[J]. 周艳华,周华山,吴平. 中国现代医药杂志. 2015(04)
[2]利用基因芯片技术筛选食管癌细胞侵袭转移的相关分子靶标[J]. 张琪琪,张志强,温浩,李秀娟. 中国老年学杂志. 2015(08)
[3]HLA-DRB1基因多态性与乳腺癌关联研究的Meta分析[J]. 董燕,木克代斯·拜克提亚尔,艾秀清,木妮热·木沙江. 实用肿瘤杂志. 2015(02)
[4]microRNA与肝癌研究进展[J]. 邢茜,陈思宇. 肿瘤基础与临床. 2014(05)
[5]胃癌患者血清VEGF和IL-8水平变化及临床意义[J]. 黄美君,梁小裕,管敏昌,李巍,泮宏伟,陈恩信. 中国卫生检验杂志. 2014(19)
[6]乳腺癌转移相关基因的筛选与生物信息学分析[J]. 余海浪,夏晓燕,丁大鹏,周珏宇,郑文岭,马文丽. 中国生物化学与分子生物学报. 2012(11)
[7]应用基因芯片筛选不同胶质瘤细胞相关基因[J]. 张红,楚胜华,冯东福,马延斌,邱建华,朱志安. 中华实验外科杂志. 2012 (02)
[8]MMP1、TIMP1和TIMP3在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义[J]. 陈中,张素欣,张雨温. 现代口腔医学杂志. 2011(06)
[9]FATE/BJ-HCC-2基因表达促进细胞增殖及肿瘤形成[J]. 闫萌,王巍,杨小昂,张毓,尹艳慧,陈慰峰. 中国生物化学与分子生物学报. 2008(08)
本文编号:2900746
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/2900746.html
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