山羊STAT3基因克

发布时间：2020-12-07 01:43

　　本研究利用RT-PCR、TA克隆和重亚硫酸盐测序（BSP）等方法,旨在克隆、分析山羊STAT3基因完整编码区,并解析该基因甲基化修饰水平及其与体重的关系。结果表明,山羊STAT3基因编码区全长2 313bp,编码770个氨基酸;与绵羊、牛、野猪、小鼠、大鼠和人的氨基酸序列一致性分别为99.7%、99.6%、99.4%、99.2%、99.4%和99.5%。山羊高体重组与低体重组之间甲基化差异研究发现,高体重组STAT3基因启动子区甲基化水平显著高于低体重组（P=0.020）,提示该基因甲基化修饰对体重具有显著影响,可作为标记辅助选择（MAS）的有效表观遗传标记。这些结果为研究山羊肉用性能的遗传与表观遗传机制提供了科学资料。 

【文章来源】：畜牧兽医学报. 2016年03期 第457-466页 北大核心

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【部分图文】：

图１山羊ＳＴＡＴ３基因的ＲＴ－ＰＣＲ电泳结果Ｆｉｇ．１ＴｈｅＲＴ－ＰＣＲｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓｒｅｓｕｌｔｓｏｆｔｈｅｇｏａｔＳＴＡＴ３ｇｅｎｅ

畜牧兽医学报４７卷图１山羊ＳＴＡＴ３基因的ＲＴ－ＰＣＲ电泳结果Ｆｉｇ．１ＴｈｅＲＴ－ＰＣＲｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓｒｅｓｕｌｔｓｏｆｔｈｅｇｏａｔＳＴＡＴ３ｇｅｎｅ２．２山羊ＳＴＡＴ３氨基酸序列的系统进化树构建将山羊ＳＴＡＴ３氨基酸序列与牛（ＮＰ＿００１０１２６８９）、人（ＡＡＳ６６９８６）、小鼠（ＡＡＡ１９４５２）、大鼠（ＡＡＨ８７０２５）、野猪（ＡＢＦ２１１５０）、绵羊（ＸＰ＿００４０１２９７４）氨基酸序列进行同源性比对，发现它们高度同源；在氨基酸同源性分析中（图３），山羊ＳＴＡＴ３基因氨基酸序列与牛、绵羊、小鼠、大鼠、野猪和人氨基酸序列的相似性分别为９９．６％、９９．７％、９９．２％、９９．４％、９９．４％和９９．５％。系统发育树显示（图４），山羊与牛的亲缘关系最为接近，与人类、大鼠、小鼠和绵羊亲缘关系较远。图２山羊ＳＴＡＴ３基因ＣＤＳ与氨基酸序列Ｆｉｇ．２ＴｈｅＣＤＳａｎｄａｍｉｎｏａｃｉｄｓｅｑｕｅｎｃｅｏｆｔｈｅｇｏａｔＳＴＡＴ３ｇｅｎｅ４６０

畜牧兽医学报４７卷图４不同物种ＳＴＡＴ３基因的系统发育树Ｆｉｇ．４ＰｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｔｒｅｅｏｆＳＴＡＴ３ｇｅｎｅａｍｏｎｇｖａｒｉｏｕｓｓｐｅｃｉｅｓＴｒｐ（１．９％）、Ｔｙｒ（２．７％）和Ｖａｌ（５．３％）。其不稳定系数为４９．５８，且预计在哺乳动物网织红细胞内半衰期为３０ｈ；脂溶指数为８３．５８，总平均疏水指数－０．４００，属亲水蛋白。２．３．２山羊ＳＴＡＴ３蛋白结构预测山羊ＳＴＡＴ３蛋白主要由α－螺旋（４６．６２％）、β折叠（１８．１８％）、β转角（７．４０％）及无规则卷曲（２７．７９％）构成。采用ＳＷＩＳＳ－ＭＯＤＥＬ和ＰｙＭｏｌ软件对山羊ＳＴＡＴ３建模获得二级结构模型及结构域的预测（图５，图６）。图５山羊ＳＴＡＴ３蛋白质二级结构分析Ｆｉｇ．５ＴｈｅｓｅｃｏｎｄａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅａｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｏａｔＳＴＡＴ３ｐｒｏｔｅｉｎ图６山羊ＳＴＡＴ３蛋白质结构域Ｆｉｇ．６ＰｒｏｔｅｉｎｄｏｍａｉｎｓｏｆｇｏａｔＳＴＡＴ３２．３．３山羊ＳＴＡＴ３亚细胞定位、蛋白磷酸化和糖基化位点预测山羊ＳＴＡＴ３蛋白在细胞质、细胞核、线粒体基质、内质网、膜泡分泌系统及质膜中的分布比例分别为３４．８％、３０．４％、１７．４％、８．７％、４．３％和４．３％，在细胞质中分布最多。磷酸化分析显示（图７ａ），山羊ＳＴＡＴ３蛋白存在较多的丝氨酸（Ｓｅｒ）磷酸化位点，而酪氨酸（Ｔｙｒ）和苏氨酸（Ｔｈｒ）磷酸化位点较少。糖基化位点分析表明

【参考文献】：
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硕士论文
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本文编号：2902388