基于形态、线粒体及核基因对东海28种虾虎鱼类的系统进化分析
发布时间:2020-12-09 02:33
虾虎鱼亚目是鲈形目中种类最多的类群,其中所有鱼类都称为虾虎鱼类,广泛分布于热带亚热带及温带地形复杂的浅海区域中。本文利用虾虎鱼的形态特征,线粒体COI基因以及核基因Ptr和plagl2对采自东海的28种虾虎鱼类的系统进化进行研究,并从NCBI下载5亚科45属75种虾虎鱼条形码序列,几乎涵盖了中国所有的虾虎鱼科中属的种类,进行COI条形码对中国虾虎鱼科鱼类的适用性研究,以期为虾虎鱼的分类研究及物种鉴定工作提供理论依据。1.28种虾虎鱼类形态特征及分析测量虾虎鱼28个物种的长度、鳞片、鳍条等数量特征以及对虾虎鱼的形态进行简单描述,从中找出26个主要的分级特征,特征的有无用1和0来表示,形成形态矩阵,运用贝叶斯的方法构建形态系统发育树。近盲虾虎鱼亚科除孔虾虎鱼和小头栉孔虾虎鱼以外的三种鱼亲缘关系比较近,因为这三种虾虎鱼均为全身裸露。纹缟和双带缟虾虎鱼形态十分相似,但是此两种鱼跟髭缟虾虎鱼在形态上差异较明显,最主要的差异为髭缟虾虎鱼下颌及吻边都有小须,在之前鱼类志中,髭缟虾虎鱼被分在髭缟虾虎鱼属(Triaenopogon)中,但是形态聚类分析中三种虾虎鱼为平行关系,本结果较倾向于支持将三种虾虎...
【文章来源】:上海海洋大学上海市
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
虾虎鱼早期分类发展Developmentintaxonomicofgobiesearly注:a-d分别为Berg(1940)、Miller(1973)、Hoses(1984)、Akihito(2000)的分
上海海洋大学硕士学位论文5图1-2 近期虾虎鱼分类情况注:A、B分别为Nelson在1994和2006年提出的分类,C为Thacker在2009年提出的分类Fig.1-2 Classification of the gobies recentlyNote,A and B are the categories that Nelson proposed in 1994 and 2006respectively, and C is proposed by Thacker in 2009.Thacker等利用4个线粒体基因分析了虾虎鱼亚目4个科,得出其中最古老的是溪鳢科,虾虎鱼科与塘鳢科和峡塘鳢科是并系关系[24]。此后的研究中,Agorreta等多位学者的研究中发现分子系统研究结果与形态学基本一致[24-28]。但是仍有难区分的分类,如Christine(2003)利用三个线粒体基因虾虎鱼亚目的亲缘关系,结果显示Xenisthmidae 与 Eleotridae为姊妹群
图 2-1 利用形态特征构建的拓扑结构Fig 2-1 The topology constructed with morphological features2.3 讨论通过分析 28 种虾虎鱼的形态特征,以及利用 14 个主要的形态分级特征及其他的特征,构建系统发育树。塘鳢科聚在最外部,为两个并列的分支,因为锯嵴塘鳢在各个鳞片的数目上跟中华乌塘鳢差异特别大,且中华乌塘鳢犁骨有锥状齿,这两个特征也是乌塘鳢区别于其他 27 种虾虎鱼的主要特征,锯嵴塘鳢有一个很明显的特征就是吻部附近及眼上部都有骨质嵴。背眼虾虎鱼亚科亚科和近盲虾虎鱼亚科的特征比较明显,背眼虾虎鱼亚科亚科第一背鳍鳍棘的数目为 5,并且眼睛凸出于头顶,区别于其他 26 种虾虎鱼。近盲虾虎鱼亚科背鳍前鳞都是 0,且眼睛都很小,具有不同程度的退化,且 5 种鱼中,除了孔虾虎鱼和小头栉孔虾虎鱼以外
本文编号:2906099
【文章来源】:上海海洋大学上海市
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
虾虎鱼早期分类发展Developmentintaxonomicofgobiesearly注:a-d分别为Berg(1940)、Miller(1973)、Hoses(1984)、Akihito(2000)的分
上海海洋大学硕士学位论文5图1-2 近期虾虎鱼分类情况注:A、B分别为Nelson在1994和2006年提出的分类,C为Thacker在2009年提出的分类Fig.1-2 Classification of the gobies recentlyNote,A and B are the categories that Nelson proposed in 1994 and 2006respectively, and C is proposed by Thacker in 2009.Thacker等利用4个线粒体基因分析了虾虎鱼亚目4个科,得出其中最古老的是溪鳢科,虾虎鱼科与塘鳢科和峡塘鳢科是并系关系[24]。此后的研究中,Agorreta等多位学者的研究中发现分子系统研究结果与形态学基本一致[24-28]。但是仍有难区分的分类,如Christine(2003)利用三个线粒体基因虾虎鱼亚目的亲缘关系,结果显示Xenisthmidae 与 Eleotridae为姊妹群
图 2-1 利用形态特征构建的拓扑结构Fig 2-1 The topology constructed with morphological features2.3 讨论通过分析 28 种虾虎鱼的形态特征,以及利用 14 个主要的形态分级特征及其他的特征,构建系统发育树。塘鳢科聚在最外部,为两个并列的分支,因为锯嵴塘鳢在各个鳞片的数目上跟中华乌塘鳢差异特别大,且中华乌塘鳢犁骨有锥状齿,这两个特征也是乌塘鳢区别于其他 27 种虾虎鱼的主要特征,锯嵴塘鳢有一个很明显的特征就是吻部附近及眼上部都有骨质嵴。背眼虾虎鱼亚科亚科和近盲虾虎鱼亚科的特征比较明显,背眼虾虎鱼亚科亚科第一背鳍鳍棘的数目为 5,并且眼睛凸出于头顶,区别于其他 26 种虾虎鱼。近盲虾虎鱼亚科背鳍前鳞都是 0,且眼睛都很小,具有不同程度的退化,且 5 种鱼中,除了孔虾虎鱼和小头栉孔虾虎鱼以外
本文编号:2906099
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