沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因的鉴定及序列分析

发布时间：2020-12-29 11:06

　　利用高通量测序技术对沙田柚自交和异交花柱进行转录组测序。通过差异分析得到GDSL酯酶/脂肪酶的基因序列,该基因全长1 306 bp(Gen Bank登录号:KU159279),开放阅读框(简称ORF)全长1 104 bp,共编码367个氨基酸,编码的蛋白质分子量为40.09 ku,理论等电点为6.44,含有1个与SGNH蛋白相同的保守结构域(conserved active sites,简称CAS);GDSL基因在沙田柚自交1 d花柱中的表达量(简称RPKM)为4.68,2 d为2.41,3 d则迅速下降到0.27;在异交1 d花柱中该基因的表达量为4.48,2 d迅速升高至7.43,3 d仍维持较高水平为4.37;系统进化树显示,沙田柚GDSL酯酶/脂肪酶基因与甜橙(Citrus sinensis)亲缘关系很近,属于同一进化分支。 

【文章来源】：江苏农业科学. 2017年11期 北大核心

【文章页数】：4 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 试验材料
    1.2 试验方法
        1.2.1 RNA的提取、建库及测序
        1.2.2 序列分析和系统树构建
2 结果与分析
    2.1 基因的生物信息学分析
    2.2 编码蛋白质的分析和疏水性预测
    2.3 功能结构域分析
    2.4 跨膜预测
    2.5 蛋白质磷酸化预测
    2.6 蛋白质二级结构及三级结构预测
    2.7 同源性分析
3 结论与讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]自交不亲和杏李品种‘风味玫瑰’授粉早期花柱蛋白质差异分析[J]. 何兴波,雷莉莉,杨绍彬,傅建敏,李芳东.  林业科学研究. 2014(05)
[2]植物GDSL脂酶家族基因的研究进展[J]. 李志兰,华水金,蒋立希.  农业生物技术学报. 2014(07)
[3]沙田柚花粉管S1-RNase免疫胶体金定位研究[J]. 秦新民,莫花浓,石菁萍,薛妙男,杨继华.  广西农业科学. 2009(05)
[4]沙田柚花粉管特异蛋白的免疫细胞化学研究[J]. 秦新民,莫花浓,万珊,张杏辉,杨继华,薛妙男.  广西师范大学学报(自然科学版). 2008(04)
[5]沙田柚自交、异交花粉管蛋白双向电泳分析[J]. 秦新民,李惠敏,薛妙男,杨继华.  广西植物. 2004(06)
[6]沙田柚自交花柱中识别蛋白的免疫金定位[J]. 薛妙男,李义平,张杏辉,杨继华.  园艺学报. 2001(01)
[7]沙田柚花柱S-糖蛋白的纯化和N-端序列测定[J]. 杨继华,饶桂荣,薛妙男.  广西师范大学学报(自然科学版). 2001(01)
[8]沙田柚花柱S-糖蛋白的分离及鉴定[J]. 杨继华,李红艳,薛妙男.  广西师范大学学报(自然科学版). 2000(04)
[9]沙田柚自交和异交亲和性观察[J]. 薛妙男,陈腾土,杨继华.  园艺学报. 1995(02)



本文编号：2945537