湖北地区克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区ORF14/15、ORF23/24基因序列比较分析

发布时间：2020-12-30 17:58

　　试验扩增、克隆了在湖北地区采集的19份克氏原螯虾(Procambarus clarkii)白斑综合征病毒(White spot syndrome virus,WSSV)阳性样品的变异区ORF14/15和ORF23/24基因,通过测序比较分析了湖北各WSSV毒株与Gen Bank公布的标准毒株间在变异区ORF14/15及ORF23/24基因的差异性。结果显示,19份WSSV阳性样品中有部分样品在变异区扩增出ORF14/15、ORF23/24基因片段,变异区基因序列分析发现,与Gen Bank已公布的标准毒株相比,存在大片段缺失。在变异区ORF14/15,有3个毒株扩增出1 442 bp的片段,4个毒株扩增出630 bp的片段,基于变异区ORF14/15构建的系统进化树显示,这些毒株归属两个不同的分支。在变异区ORF23/24,有2个毒株扩增出大小为2 096 bp的片段,进化分析发现这2个毒株在变异区ORF23/24的遗传距离较近。 

【文章来源】：淡水渔业. 2017年05期 北大核心

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 样品采集
    1.2 主要试剂和仪器
    1.3 引物设计
    1.4 WSSV巢式PCR检测
    1.5 WSSV变异区ORF14/15和ORF23/24基因扩增
    1.6 WSSV变异区ORF14/15和ORF23/24基因的克隆及序列分析
2 结果与分析
    2.1 WSSV巢式PCR检测结果
    2.2 WSSV变异区ORF14/15基因扩增与序列分析
    2.3 WSSV变异区ORF23/24基因扩增与序列分析
    2.4 WSSV变异区进化树分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]2014年中国不同地区对虾白斑综合征病毒ORF14/15和ORF23/24缺失区序列比较[J]. 孙新颖,刘庆慧,万晓媛,黄倢.  渔业科学进展. 2016(04)
[2]白斑综合征病毒2014年中国毒株变异区的序列比较[J]. 孙新颖,万晓媛,刘庆慧,黄倢.  渔业科学进展. 2016(02)
[3]养殖克氏原螯虾体内白斑综合征病毒的绝对定量分析[J]. 兰江风,代云佳,林蠡.  水产学报. 2016(03)
[4]凡纳滨对虾白斑综合征病毒广西株变异区基因的比较分析[J]. 童桂香,黎小正,韦信贤,叶欣宇,吴明媛,秦振发,兰柳春,周靓婧.  病毒学报. 2014(01)
[5]白斑综合征病毒广西株缺失区基因的比较分析[J]. 童桂香,黎小正,韦信贤,杨先乐,张益峰,吴祥庆,叶欣宇,黄国秋.  上海海洋大学学报. 2014(01)
[6]中国对虾和日本对虾对白斑综合征病毒(WSSV)敏感性的比较[J]. 盖春蕾,许拉,叶海斌,于晓清,王勇强.  水产科技情报. 2013(04)
[7]白斑综合征病毒对脊尾白虾的致病性研究[J]. 沈辉,万夕和,王李宝,费荣梅,李淑,柏玲,凌云,黎慧,高波.  海洋科学. 2013(05)
[8]白斑综合征病毒江苏分离株变异区和缺失区基因的序列比较[J]. 薛晖,王晓丰,丁正峰,唐建清.  中国水产科学. 2011(05)
[9]虾白斑综合征病毒的研究进展[J]. 于力,李庆章.  中国预防兽医学报. 2008(06)
[10]对虾白斑综合征病毒中国地方株变异区基因的比较[J]. 康桦华,陆承平.  病毒学报. 2007(06)

硕士论文
[1]中国境内白斑综合征病毒（WSSV）分离株的序列差异分析[D]. 于洪涛.中国海洋大学 2008



本文编号：2948060