玉米散粉期的基因定位与全基因组选择研究
发布时间：2021-01-04 23:03
玉米（Zea.mays.L）作为我国总产量最高的粮食作物,其产量和品质的提高是保障我国粮食安全的重大举措。全基因组选择（Genomic Selection,GS）首先利用训练群体估计分子标记效应,然后利用覆盖基因组的分子标记来计算预测群体的重要农艺性状的基因组估计育种值,从而实现对育种材料的筛选,因而GS在玉米的商业化育种中具有广阔的应用前景。本研究利用骨干自交系PH4CV为父本,郑58为母本,构建481份BC1F3遗传家系。通过2016和2017年北京顺义和新疆昌吉的散粉期表型鉴定和玉米55 K芯片基因型鉴定,进行全基因组关联分析和GS分析,主要研究结果如下:1.利用两年两点散粉期最佳线性无偏估计值（Best Linear Unbiased Estimation,BLUE）和基因型数据进行遗传方差分解,发现在散粉期遗传变异中,加性方差占据77.6%,加加互作方差占14.3%,显显互作方差占5.6%,不存在加显互作方差,说明在该群体中散粉期性状主要受到基因加性效应影响,非加性效应并不明显。同时,利用GWAS方法对数量性状位点（Quantita...
【文章来源】：中国农业科学院北京市
【文章页数】：53 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
全基因组选择育种流程(Crossaetal.,2017)
士学位论文 第二章 花期性状分析群体多环境表型分析结果境下的材料，计算 2 次重复的平均值，不同环境下散粉期性状的果如表 1，可以发现，散粉期数据的变异系数均在 5%以内，遗传高温、积温偏高，导致 17BJ 环境下散粉期提前。表 2.1 四个环境下，BC1F3:4群体 DA 表型基本统计量e 2.1 Basic statistical description of DA of the BC1F3:4population in four environN Mean SD Min Max CV/%480 73.09 2.13 68.5 79.5 2.91467 72.68 2.57 67.5 79.5 3.53410 63.55 2.43 57 71 3.83355 70.13 2.69 64.5 78 3.84D：标准差；CV：变异系数；Heritability: 遗传力性的分析和数据分布如图 2.1。在不同环境之间相关系数在 0.48环境的相关性较高。
学院硕士学位论文 第二章 花期性状全基因表 2.2 SNP 标记在基因组的分布Tbale 2.2 Distribution of SNPs across the genome标记个数 起始物理位置(Mb) 终止物理距离(Mb) 区间大小(Mb) 标记平均距1885 5.633 301.204 295.570 0.151162 0.167 236.968 236.801 0.201310 0.163 232.075 231.912 0.171420 4.321 246.361 242.040 0.171128 0.947 217.628 216.681 0.191043 5.398 169.227 163.829 0.15959 0.033 175.286 175.253 0.18988 0.098 175.787 175.689 0.171045 0.068 155.980 155.912 0.14841 0.276 150.018 149.743 0.17Mb大小为窗口，计算区间内的标记个数，绘制标记密度在基因组上分布的热图
本文编号：2957528
【文章来源】：中国农业科学院北京市
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【学位级别】：硕士
【部分图文】：
全基因组选择育种流程(Crossaetal.,2017)
士学位论文 第二章 花期性状分析群体多环境表型分析结果境下的材料，计算 2 次重复的平均值，不同环境下散粉期性状的果如表 1，可以发现，散粉期数据的变异系数均在 5%以内，遗传高温、积温偏高，导致 17BJ 环境下散粉期提前。表 2.1 四个环境下，BC1F3:4群体 DA 表型基本统计量e 2.1 Basic statistical description of DA of the BC1F3:4population in four environN Mean SD Min Max CV/%480 73.09 2.13 68.5 79.5 2.91467 72.68 2.57 67.5 79.5 3.53410 63.55 2.43 57 71 3.83355 70.13 2.69 64.5 78 3.84D：标准差；CV：变异系数；Heritability: 遗传力性的分析和数据分布如图 2.1。在不同环境之间相关系数在 0.48环境的相关性较高。
学院硕士学位论文 第二章 花期性状全基因表 2.2 SNP 标记在基因组的分布Tbale 2.2 Distribution of SNPs across the genome标记个数 起始物理位置(Mb) 终止物理距离(Mb) 区间大小(Mb) 标记平均距1885 5.633 301.204 295.570 0.151162 0.167 236.968 236.801 0.201310 0.163 232.075 231.912 0.171420 4.321 246.361 242.040 0.171128 0.947 217.628 216.681 0.191043 5.398 169.227 163.829 0.15959 0.033 175.286 175.253 0.18988 0.098 175.787 175.689 0.171045 0.068 155.980 155.912 0.14841 0.276 150.018 149.743 0.17Mb大小为窗口，计算区间内的标记个数，绘制标记密度在基因组上分布的热图
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