玉米CKX基因的遗传演化及其与农艺性状的关联分析

发布时间：2021-01-10 05:19

　　细胞分裂素氧化酶（CKX,cytokinin oxidase）通过降解细胞分裂素（CK）参与植物生长发育的诸多过程,是调控植物生长发育的关键因素之一。细胞分裂素氧化酶由细胞分裂素氧化酶基因（CKX）编码,后者往往以多基因家族的形式存在于植物基因组中。玉米中有13个CKX基因,其对玉米植株形态建成有着重要的影响。然而,CKX基因的遗传演化及其遗传变异对玉米农艺性状的影响却少有报道。本研究以32份大刍草、68份玉米地方品种、348份玉米自交系为试验群体,采用华大基因科技有限公司的NimbleGen平台的目标序列捕获技术对CKX基因进行重测序,分析CKX基因在三个群体中的序列多态性,并探究其玉米驯化过程中的演变模式。在此基础上,结合3个环境下测定的12个玉米农艺性状表型数据,采用候选基因关联分析方法,挖掘影响玉米农艺性状的关键变异位点。主要结果如下:1.在448份材料中成功地捕获到玉米CKX基因家族的10个成员,经多序列比对后,对其进行序列变异分析。结果发现,CKX基因在起始密码子上游、内含子、终止密码子下游的核苷酸多态性较高,而编码区（CDS）则相对较低。从驯化过程来看,CKX基因各区段的... 

【文章来源】：扬州大学江苏省

【文章页数】：52 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略语表
1 前言
    1.1 细胞分裂素的发现
    1.2 细胞分裂素氧化酶的研究概况
        1.2.1 细胞分裂素氧化酶的作用机制
        1.2.2 细胞分裂素氧化酶的生理作用
        1.2.3 细胞分裂素氧化酶基因的研究进展
        1.2.4 细胞分裂素氧化酶基因的表达调控
    1.3 玉米的起源与驯化
    1.4 中性进化理论
    1.5 关联分析
        1.5.1 关联分析的基本原理
        1.5.2 关联分析的优势
        1.5.3 关联分析的策略
        1.5.4 关联分析在玉米中的研究进展
    1.6 本研究的目的与意义
2 材料与方法
    2.1 供试材料与田间试验
    2.2 表型分析
    2.3 DNA提取及候选基因重测序
    2.4 序列变异分析
    2.5 群体结构和亲缘关系分析
    2.6 候选基因的关联分析
3 结果与分析
    3.1 CKX基因的序列变异
        3.1.1 CKX基因的重测序及其在所有材料中的核苷酸多态性
        3.1.2 CKX基因在不同群体中核苷酸多态性
        3.1.4 CKX基因的序列演化模式
    3.2 自交系群体农艺性状的统计分析
    3.3 CKX基因家族与玉米农艺性状的关联分析
        3.3.1 CKX6与叶宽的关联分析
        3.3.2 CKX4与茎粗、叶宽的关联分析
4 讨论
    4.1 候选基因的多序列比对
    4.2 CKX基因的序列变异
    4.3 CKX基因与玉米农艺性状的关联
    4.4 农艺性状对玉米育种的重要性
参考文献
附录
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]植物内源激素研究进展[J]. 王丽萍,李志刚,谭乐和,宋应辉,练飞松,杨逢春,闫林,吴刚.  安徽农业科学. 2011(04)
[2]细胞分裂素氧化酶/脱氢酶的生理生化和分子特性[J]. 张芬,郭得平,林明丽,闫淼淼.  植物生理学通讯. 2008(04)
[3]细胞分裂素氧化酶[J]. 邓江明,潘瑞炽.  植物生理学通讯. 1997(05)

硕士论文
[1]玉米花序发育相关基因TD1与FEA2的序列变异及其与产量相关性状的关联分析[D]. 喻俊杰.扬州大学 2018



本文编号：2968136