三角帆蚌TRAF家族基因的克隆及与β-arrestin蛋白互作
发布时间：2021-01-17 02:52
肿瘤坏死因子受体相关因子家族（The tumor necrosis factor receptor associated factors,TRAFs）是一类具有重要功能的胞内信号传递蛋白,广泛参与了如TNFR、TLR、NLR、RLR等多条免疫通路。介导免疫、胚胎发育、应激反应、骨代谢等多种生理功能。β-arrestins是一类支架蛋白,在各组织中广泛存在,能与许多蛋白结合从而激活或抑制NF-κB、JNK、ERK等途径,在细胞趋化、转移和凋亡等方面发挥重要作用。三角帆蚌是重要的淡水育珠蚌,在养殖过程中常因细菌、病毒感染和插核排异反应而导致大量死亡,造成巨大的经济损失。展开对TRAFs基因家族和β-arrestins研究,有利于丰富贝类免疫学知识和养殖业健康发展。1、根据三角帆蚌转录组文库筛选,利用RT-PCR克隆出HcTRAF2、HcTRAF3、HcTRAF3B、HcTRAF4 和 HcTRAF7 基因的 cDNA 全长序列,分别编码562、431、384、464和600个氨基酸。通过对氨基酸序列预测发现HcTRAF2和HcTRAF3都含有1个环指结构域、1个锌指结构域和1个卷曲螺旋结构...
【文章来源】：南昌大学江西省 211工程院校
【文章页数】：99 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图１．１人类ＴＲＡＦ家族七个成员的蛋白结构［２６］??Ｆｉｇ．?１．１?Ｐｒｏｔｅｉｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｓｅｖｅｎ?ｍｅｍｂｅｒｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｈｕｍａｎ?ＴＲＡＦ?ｆａｍｉｌｙ［２６］??
Ｇ］。??ＮＬＲ受到刺激后，通过ＮＡＣＨＴ结构域寡聚，然后通过ＣＡＲＤ结构域与??ＲＩＰＫ２结合形成复合物［７７］，ＲＩＰＫ２再诱导ＴＡＫ１和ＮＥＭＯ泛素化，募集ＩＫＫ复??合物致使ＴＡＫ１磷酸化ＩＫＫＪ３，激活ＮＦ－ｋＢ［８１］。ＮＯＤ１和ＮＯＤ２还可由ＴＲＡＦ６??和ＣＡＲＤ９转导信号使ＭＡＰＫｓ激活最终活化转录因子ＡＰ－］［８２］，也可以通过与??ＲＩＰＫ２结合后募集ＴＲＡＦ３最后磷酸化ＩＲＦ７［７６］?ＡＬＲ家族的ＮＬＲＰ３可以在ＴＲＡＦ３??调控下诱导分泌炎症小体［８３］（图１．３）。有关ＴＲＡＦｓ对ＮＬＲ的负调控作用，目??前只发现能通过ＮＯＤ２与ＴＲＡＦ４直接结合，而后ＩＫＫａ磷酸化ＴＲＡＦ４最终达到??抑制ＮＦ－ｋＢ活性的效果［８４Ｌ??＾?ＮＯＤ１?ＮＯＤ２?＾?Ｖｉｒａｌ?ｓｓＲＮＡ??ｄａｐｚ）／》；！４ｒ??１?—麵鱗ａｖｓ??ＮＡ譬?ｌ?Ｌ?■喻??ＴＢＫ１／ＩＫＫ；，?？?ＮＥＭＯ?（＾；?ＭＡＰＫｓ??／?＼?ＮＡＰＩ？＾??ｍＦ＿７，二鬌?ｌ??方－弋—／—??，广?Ｔｙｐｅ?丨?ＩＦＮｓ?ｊ—?广?ｐ?Ｔｙｐｅ?Ｉ?ＩＦＮｓ?、??ＡＰｌｙＶ￥￥＼?ａＷＫａａａａ??Ｐｒｏｉｎｔｌａｍｍａｔｏｒｙ?ｃｙｔｏｋｉｎｅｓ??图１．３?ＴＲＡＦｓ介导ＮＬＲ受体家族免疫途径［２６］??Ｆｉｇ．?１．３?ＴＲＡＦｓ?ｍｅｄｉａｔｅ?ＮＬＲ?ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ?ｉｍｍｕｎｅ?ｐａｔｈｗａｙ［２６］??１．３．３?ＴＲＡＦｓ?介导?ＲＬＲ?途径??ＲＩＧ－Ｉ样受体（ＲＬＲ）包含视黄酸诱导基因１?（ＲＩＧ－Ｉ）、蛋白黑色素瘤分化相??关分子－５?（ＭＤＡ５）和遗传学与生理学
ＡＰＫｓＰｌＲＩＧ－Ｉ／ＭＤＡＳ??也可以由ＭＡＶＳ募集ＴＲＡＦ３使其泛素化，然后募集并活化ＴＡＫ１和ＩＫＫｄ秀导??ＩＲＦ３发挥作用丨ＩＴＲＡＦ２和ＴＲＡＦ５参与ＲＬＲ诱导的ＮＦ－ｋＢ激活过程［８８］。丁１＾？６??被ＭＡＶＳ募集后可激活ＴＢＫ１／ＩＫＫＳ／ＩＲＦ７和ＭＡＰＫｓ／ＡＰ－１两条信号通路。??ＲＩＧ－Ｉ－ＭＡＶＳ－ＴＲＡＦ６可激活ＩＫＫｐ依赖型ＮＦ－ｋＢ，与泛素特异性蛋白酶４（ＵＳＰ４）??互作可诱导ＮＦ－ｋＢ活化［８９］，还可诱导Ｂｅｃｌｉｎ－１泛素化后产生自噬反应胃（图１．４）。??负调控ＲＬＲ的途径有：１）去泛素化酶０ＴＵＢ１、０ＴＵＢ２、ＤＵＢＡ和ＨＳＣＡＲＧ??破坏ＴＲＡＦ３和ＴＲＡＦ６的Ｋ６３链多聚泛素化从而抑制ＲＬＲ介导的ＩＦＮ－Ｉ的活化??［９１Ｕ）ＭＣＰＩＰ１去泛素化ＴＲＡＦｓ抑制ＪＮＫ和ＮＦ－ｋＢ活化［７５］。３）泛素化酶０ＴＵＤ１??使泛素连接酶Ｓｍｕｒｆｌ失活，ＭＡＶＳ、ＴＲＡＦ３、ＴＲＡＦ６被降解［５０］。??Ｖｉｒａｌ?ＲＮＡ????ＲＩＧ－ｌＨ?Ｈ?ＭＤＡ－５??（？｜：ｌ?８??ＴＲＡＦ６??：■夢，ｇ??＼?ＣａｓｐＩＯ?＃１?Ｂ?Ｕｂｃ５?Ｊ??ＪＫＫ１?Ｃａｓｐｅｊｆ?＼?？‘酴??ＴＡＫ１?ｚ?Ｗ?／?ＦＡＤＤ／?＼?ＴＡＮＫ－ＮＡＰ?１／ＳＩＮＴＢＡＤ??ｚ?ｖ??ＮＥＭＯ?▲?ＮＥＭ〇?龜?ＮＥＭ０??￣?９?＝啊？删ＫＫ，??Ｊ?＇?ｉ?＼?＼??ＩＲＦ－７?ＩｋＢｕ?＾＾ＡＰ－１?ＩＲＦ－３??ｚＵｋ—／［十、、??ｆ?Ｔｙｐｅ?Ｉ?ＩＦＮｓ?Ｔｙｐｅ?Ｉ?ＩＦＮｓ?＼??１?ａＷＫａａａａ?／／ｗｗｙｖ＼?＇??Ｐ?ｒｏｉｎｆ?ｌａｍ
本文编号：2982054
【文章来源】：南昌大学江西省 211工程院校
【文章页数】：99 页
【学位级别】：硕士
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图１．１人类ＴＲＡＦ家族七个成员的蛋白结构［２６］??Ｆｉｇ．?１．１?Ｐｒｏｔｅｉｎ?ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ?ｏｆ?ｓｅｖｅｎ?ｍｅｍｂｅｒｓ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｈｕｍａｎ?ＴＲＡＦ?ｆａｍｉｌｙ［２６］??
Ｇ］。??ＮＬＲ受到刺激后，通过ＮＡＣＨＴ结构域寡聚，然后通过ＣＡＲＤ结构域与??ＲＩＰＫ２结合形成复合物［７７］，ＲＩＰＫ２再诱导ＴＡＫ１和ＮＥＭＯ泛素化，募集ＩＫＫ复??合物致使ＴＡＫ１磷酸化ＩＫＫＪ３，激活ＮＦ－ｋＢ［８１］。ＮＯＤ１和ＮＯＤ２还可由ＴＲＡＦ６??和ＣＡＲＤ９转导信号使ＭＡＰＫｓ激活最终活化转录因子ＡＰ－］［８２］，也可以通过与??ＲＩＰＫ２结合后募集ＴＲＡＦ３最后磷酸化ＩＲＦ７［７６］?ＡＬＲ家族的ＮＬＲＰ３可以在ＴＲＡＦ３??调控下诱导分泌炎症小体［８３］（图１．３）。有关ＴＲＡＦｓ对ＮＬＲ的负调控作用，目??前只发现能通过ＮＯＤ２与ＴＲＡＦ４直接结合，而后ＩＫＫａ磷酸化ＴＲＡＦ４最终达到??抑制ＮＦ－ｋＢ活性的效果［８４Ｌ??＾?ＮＯＤ１?ＮＯＤ２?＾?Ｖｉｒａｌ?ｓｓＲＮＡ??ｄａｐｚ）／》；！４ｒ??１?—麵鱗ａｖｓ??ＮＡ譬?ｌ?Ｌ?■喻??ＴＢＫ１／ＩＫＫ；，?？?ＮＥＭＯ?（＾；?ＭＡＰＫｓ??／?＼?ＮＡＰＩ？＾??ｍＦ＿７，二鬌?ｌ??方－弋—／—??，广?Ｔｙｐｅ?丨?ＩＦＮｓ?ｊ—?广?ｐ?Ｔｙｐｅ?Ｉ?ＩＦＮｓ?、??ＡＰｌｙＶ￥￥＼?ａＷＫａａａａ??Ｐｒｏｉｎｔｌａｍｍａｔｏｒｙ?ｃｙｔｏｋｉｎｅｓ??图１．３?ＴＲＡＦｓ介导ＮＬＲ受体家族免疫途径［２６］??Ｆｉｇ．?１．３?ＴＲＡＦｓ?ｍｅｄｉａｔｅ?ＮＬＲ?ｓｕｐｅｒｆａｍｉｌｙ?ｉｍｍｕｎｅ?ｐａｔｈｗａｙ［２６］??１．３．３?ＴＲＡＦｓ?介导?ＲＬＲ?途径??ＲＩＧ－Ｉ样受体（ＲＬＲ）包含视黄酸诱导基因１?（ＲＩＧ－Ｉ）、蛋白黑色素瘤分化相??关分子－５?（ＭＤＡ５）和遗传学与生理学
ＡＰＫｓＰｌＲＩＧ－Ｉ／ＭＤＡＳ??也可以由ＭＡＶＳ募集ＴＲＡＦ３使其泛素化，然后募集并活化ＴＡＫ１和ＩＫＫｄ秀导??ＩＲＦ３发挥作用丨ＩＴＲＡＦ２和ＴＲＡＦ５参与ＲＬＲ诱导的ＮＦ－ｋＢ激活过程［８８］。丁１＾？６??被ＭＡＶＳ募集后可激活ＴＢＫ１／ＩＫＫＳ／ＩＲＦ７和ＭＡＰＫｓ／ＡＰ－１两条信号通路。??ＲＩＧ－Ｉ－ＭＡＶＳ－ＴＲＡＦ６可激活ＩＫＫｐ依赖型ＮＦ－ｋＢ，与泛素特异性蛋白酶４（ＵＳＰ４）??互作可诱导ＮＦ－ｋＢ活化［８９］，还可诱导Ｂｅｃｌｉｎ－１泛素化后产生自噬反应胃（图１．４）。??负调控ＲＬＲ的途径有：１）去泛素化酶０ＴＵＢ１、０ＴＵＢ２、ＤＵＢＡ和ＨＳＣＡＲＧ??破坏ＴＲＡＦ３和ＴＲＡＦ６的Ｋ６３链多聚泛素化从而抑制ＲＬＲ介导的ＩＦＮ－Ｉ的活化??［９１Ｕ）ＭＣＰＩＰ１去泛素化ＴＲＡＦｓ抑制ＪＮＫ和ＮＦ－ｋＢ活化［７５］。３）泛素化酶０ＴＵＤ１??使泛素连接酶Ｓｍｕｒｆｌ失活，ＭＡＶＳ、ＴＲＡＦ３、ＴＲＡＦ６被降解［５０］。??Ｖｉｒａｌ?ＲＮＡ????ＲＩＧ－ｌＨ?Ｈ?ＭＤＡ－５??（？｜：ｌ?８??ＴＲＡＦ６??：■夢，ｇ??＼?ＣａｓｐＩＯ?＃１?Ｂ?Ｕｂｃ５?Ｊ??ＪＫＫ１?Ｃａｓｐｅｊｆ?＼?？‘酴??ＴＡＫ１?ｚ?Ｗ?／?ＦＡＤＤ／?＼?ＴＡＮＫ－ＮＡＰ?１／ＳＩＮＴＢＡＤ??ｚ?ｖ??ＮＥＭＯ?▲?ＮＥＭ〇?龜?ＮＥＭ０??￣?９?＝啊？删ＫＫ，??Ｊ?＇?ｉ?＼?＼??ＩＲＦ－７?ＩｋＢｕ?＾＾ＡＰ－１?ＩＲＦ－３??ｚＵｋ—／［十、、??ｆ?Ｔｙｐｅ?Ｉ?ＩＦＮｓ?Ｔｙｐｅ?Ｉ?ＩＦＮｓ?＼??１?ａＷＫａａａａ?／／ｗｗｙｖ＼?＇??Ｐ?ｒｏｉｎｆ?ｌａｍ
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