大白菜早抽薹突变基因ebm4的定位及克隆

发布时间：2021-01-23 11:16

　　大白菜（Brassica rapa ssp.pekinensis）属于十字花科芸薹属,是中国传统的蔬菜,其栽培面积和产量在中国居各类蔬菜之首。抽薹是大白菜由营养生长向生殖生长转变的关键发育事件。先期抽薹会导致春季白菜或高山白菜严重减产甚至绝收。大白菜进化出复杂而精细的调控机制严格控制抽薹时间,但是该调控机制尚不明了。因此,创制早、晚抽薹突变体,挖掘调控大白菜抽薹的重要节点基因,无疑具有重要的理论意义和应用价值。1.以大白菜DH系（‘FT’）萌发种子为诱变材料,利用0.8%EMS处理12小时,然后流水处理12小时,最终获得528个M₀诱变株系,其中有6个不同株系内出现早抽薹突变植株,经过M₂和M₃代连续鉴定,均表现为早抽薹,分别命名为ebm3、ebm4、ebm5、ebm6和ebm7、ebm8。2.相较于野生型‘FT’,大白菜早抽薹突变体ebm4在秋季不经过春化就可实现抽薹开花,没有明显的结球阶段。遗传分析表明,该突变性状是由单隐性核基因（ebm4）控制。3.采用改良的MutMap方法对ebm4进行了基因定位,26个突变位点... 

【文章来源】：沈阳农业大学辽宁省

【文章页数】：62 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 文献综述
    1.1 抽薹开花的遗传和分子机制
        1.1.1 抽薹开花的遗传机制
        1.1.2 抽薹开花的分子机制
    1.2 开花整合因子与花分生组织
    1.3 DNA测序技术的发展及其应用
        1.3.1 DNA测序技术的发展
        1.3.2 DNA测序技术在转录组分析中的应用
第二章 大白菜早抽薹突变基因ebm4 的定位
    2.1 材料与方法
        2.1.1 试验材料
        2.1.2 大白菜早抽薹突变体ebm4 的遗传分析
        2.1.3 定位群体的构建与候选基因的预测
        2.1.4 候选基因的定位
        2.1.5 候选基因的序列分析
    2.2 结果与分析
        2.2.1 大白菜早抽薹突变体ebm4 的遗传分析
        2.2.2 测序数据的质量分析
        2.2.3 候选基因的预测
        2.2.4 候选基因的定位
        2.2.5 候选基因的序列分析
第三章 大白菜早抽薹突变体ebm4 的转录组分析
    3.1 材料与方法
        3.1.1 总RNA提取检测
        3.1.2 构建c DNA文库及RNA-Seq
        3.1.3 转录组数据处理
        3.1.4 参考序列比对分析
        3.1.5 基因差异表达分析
        3.1.6 差异表达基因的GO与 KEGG富集分析
        3.1.7 qRT-PCR分析
    3.2 结果与分析
        3.2.1 总RNA的质量检测
        3.2.2 测序数据的质量分析
        3.2.3 参考序列比对分析
        3.2.4 差异表达基因分析
        3.2.5 差异表达基因的GO富集分析
        3.2.6 差异表达基因的KEGG富集分析
        3.2.7 qRT-PCR验证
讨论
结论
参考文献
附录
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]菜薹乳白色花突变体的遗传规律研究及瓣化型细胞质不育系的应用[J]. 张德双,李佩荣,张凤兰,余阳俊,赵岫云,于拴仓,汪维红,苏同兵,辛晓云,卢桂香.  中国蔬菜. 2019(02)
[2]木本植物EMS诱变育种研究进展[J]. 高文杰,陈敏健,刘爱琴,帅鹏.  分子植物育种. 2019(20)
[3]转录组测序的发展和应用[J]. 王楚彪,卢万鸿,林彦,罗建中.  桉树科技. 2018(04)
[4]光周期途径成花关键基因GIGANTEA和CONSTANS的研究进展[J]. 帅敏敏,黄有军.  分子植物育种. 2018(17)
[5]拟南芥成花调控途径的研究进展[J]. 齐仙惠,巫东堂,李改珍,赵军良,李梅兰.  山西农业大学学报(自然科学版). 2018(09)
[6]多年生黑麦草EMS诱变与耐旱性评价[J]. 董文科,路旭平,姜寒玉,马晖玲.  核农学报. 2018(10)
[7]黄秋葵果实转录组测序及分析[J]. 李和平,姚运法,练冬梅,赖正锋,洪建基.  生物技术通报. 2018(03)
[8]改良CTAB法用于苹果果实基因组DNA的提取[J]. 闫玖英,马长青,常博,范献光,李征,杨亚州,赵政阳.  分子植物育种. 2017(09)
[9]基于全基因组测序的MutMap方法在正向遗传学研究中的应用[J]. 袁金红,李俊华,袁娇娇,贾克利,李书粉,邓传良,高武军.  遗传. 2017(12)
[10]鹅等级前卵泡组织转录组测序分析[J]. 孙永峰,武惠岩,王子遒,路洪涛,李书哲,杨威,隋玉健.  中国畜牧杂志. 2017(06)

博士论文
[1]小尾寒羊和杜泊羊臂二头肌转录组及肌球蛋白轻链基因家族结构特征分析[D]. 张春兰.山东农业大学 2014

硕士论文
[1]大白菜叶片黄化突变基因lcm3的克隆与鉴定[D]. 侯爱琳.沈阳农业大学 2018
[2]甘蓝TT8及WD40转录因子影响花青素合成及开花时间的研究[D]. 周雯.西南大学 2017



本文编号：2995119