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肠癌基质浸润强度评分的建立、评估及基于CRISPR文库的化疗耐药基因筛选及增敏策略探讨

发布时间:2021-01-23 23:55
  微环境是肿瘤组织的重要组成部分。越来越多的证据已经表明微环境细胞浸润模式与患者的预后及临床治疗获益息息相关。在肠癌中,目前研究较成熟的微环境评价方式为Galon J提出的基于免疫组化染色的免疫评分模型。然而,这一评价方法仅观察了 CD3与CD8两个分子的表达,缺乏对肿瘤微环境中基质细胞浸润强度的评价。我们前期研究已发现,基质细胞的浸润影响肠癌患者的预后及化疗获益。因此,本研究的目的是:(1)构建可用于评估肠癌患者微环境基质浸润强度的新型评分模型;(2)探讨新型评分模型在预测预后以及治疗获益中的作用;(3)基于CRISPR文库筛选探索联系基质浸润与化疗耐药的分子机制。取得的主要结果如下:1.建立新型肠癌患者肿瘤微环境全景分型。基于GEO数据库肠癌芯片的基因表达谱解析微环境浸润数据,运用无监督层次聚类分析发现肠癌患者存在三种微环境分型(TMECS1,TMECS2,TMECS3)。不同分型间患者的复发与死亡风险存在显著差异。此外,三种分型中仅有TMECS3患者可从辅助化疗中显著获益。2.基质浸润强度评分(SIIS)模型可预测非转移型肠癌患者预后及化疗获益。以新型微环境分型为目标特征,运用自抽... 

【文章来源】:南方医科大学广东省

【文章页数】:150 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

肠癌基质浸润强度评分的建立、评估及基于CRISPR文库的化疗耐药基因筛选及增敏策略探讨


图1-1肠癌患者微环境分型

分型,肠癌,患者,微环境


及野生型BRAF患者显著增多。桑吉图结果显示,??TMECS1型患者主要集中在C4、C6及CMS4三种表征间质表型的分子亚型上,??而TMECS2型患者主要分布在C2、CMSl、CMS2?种表征免疫浸润表沏及上??皮表型的业型。TMECS3则明显富集于C5、CMS2与CMS3。??A?B??m?TMECS1?m?TMECS2?m?TMECS3??(%)??flllHIi?:?:i?I??1?:|l?B?881!?^?f?%-:;??MMR?CIMP?CIN?BRAF??图1-2肠癌患者微环境分型与分子特征的相关性。(A)堆积柱状图展示TMECS分型在不??N分f特征患f!?的分布情况;(B?)桑々阁展承不N?TMECS分型患者在其他分子分型的分??布情况。??Fig.?1-2?The?correlation?between?tumor?microenvironment?cell?subtyping?and?molecular??characteristic.?(A)?Bar?charts?summarizing?TMECS?proportions?within?and?across?molecular??characteristic?subgroups;?(B)?Sankey?chart?displaying?the?distribution?of?the?TMECS?in?C1-C6??subtypes?and?CMS?subtypes.?TMECS.?tumor?microenvironment?cell?subtype;MMR.?mismatch?repair;??CIMP,?CpG?island?methyl

微环境,肠癌,分型,患者


图1-3肠癌微环境分型与患者生存、化疗获益的相关性分析


本文编号:2996161

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