糜子ASR家族基因克隆与表达分析
发布时间：2021-01-26 18:35
干旱缺水已经成为世界农业生产面临的严重问题,由于降水量不足和降水模式发生改变,造成的干旱与盐害成为限制作物品质和产量的主要非生物胁迫因素。糜子是我国古老的禾本科粮食作物,具有生育期短,耐旱、耐瘠薄、干旱后复水能力强等特性,是研究作物抗逆性改良的优质材料。ABA-acid-stress-ripening（ASR）基因是一种存在于作物体内的亲水性特异性基因,在作物非生物胁迫中发挥不可或缺的作用。尽管已经在多种作物物种中证明ASR基因能响应多种非生物胁迫并且赋予植株抗逆性,但对糜子ASR基因家族的研究还未见报道。本研究通过筛选糜子基因组数据库,确定了6个糜子ASR家族成员,并通过分析其基因结构、蛋白质比对、系统发育关系和不同组织表达分析,可以发现PmASR蛋白C端含有高度保守的基序,系统进化分析可将糜子ASR基因分成三组:（1）PmASR1、PmASR2、PmASR5（2）PmASR3（3）PmASR4、PmASR6。亚细胞定位结果分析发现除PmASR5定位在细胞质中其余基因均在细胞核内。通过组织表达分析发现PmASR1、2、3、6基因表达量情况为根>茎>叶,PmASR4、5基因...
【文章来源】：山西大学山西省
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术路线
19图 2.2 糜子 ASR 家族基因结构分析Figure 2.2 Analysis of the gene broomcorn millet of the ASR family糜子 ASR 家族基因系统发育树；B：糜子 ASR 家族蛋白结构分析 C:糜子 ASR 蛋白 mo颜色背景表示 B 中相同颜色的方块.2 糜子 ASR 家族蛋白系统发育树分析将糜子ASR氨基酸序列与其他已被发现的含有ASR基因八种植物(柳枝稷6豆 1 个、番茄 4 个、谷子 7 个、玉米 5 个、小麦 1 个、水稻 4 个、二穗短柄
糜子 ASR 家族基因克隆与表达分析个、马铃薯 3 个、花生 3 个)（基因登录号见附录 2）的 ASR 家族基因进行多重比较，并用 MEGA 7.0 构建系统发育树（如图 2.3）。可将这些 ASR 蛋白一共分为三组，分别为 Group1、Group2、Group3 分别占进化树的 21 %、21 %、58 %，其中 Group1含有糜子 PmASR4 和 PmASR6，Group2 含有 PmASR3，Group3 包含最多的糜子 ASR蛋白，其中包含 PmASR1、2、5，内有少部分双子叶植物 ASR 蛋白和单子叶植物ASR 蛋白，系统发育树显示糜子 PmASR 蛋白与柳枝稷 PvASR 蛋白高度同源，其次是和谷子 ASR 基因也有较高同源性，双子叶植物番茄 LyASR 和花生 StASR 蛋白也是高度同源等，大豆和花生作为双子叶作物与谷子 SiASR4 基因的同源性较高，所以ASR 基因存在并且在单子叶和双子叶植物的遗传中非常保守。
【参考文献】：
期刊论文
[1]谷子eIF5A基因家族鉴定与分析[J]. 张杰伟,秦新月,陈亚娟,刘婧,崔进荣,姚磊,魏建华. 西南农业学报. 2018(07)
[2]厚藤ASR基因克隆及功能初步分析[J]. 张会,郑洁旋,简曙光,夏快飞,张美. 植物科学学报. 2018(03)
[3]糜子Ty 1-copia型反转录转座子基因的序列特征及表达分析[J]. 何杰丽,薛延桃,王瑞云,陈国荣,陈凌,王海岗,杨美红,乔治军. 山西农业大学学报(自然科学版). 2018(06)
[4]苗期外源脱落酸和茉莉酸缓减小麦花后干旱胁迫的效应及其生理机制[J]. 谢静静,王笑,蔡剑,周琴,戴廷波,姜东. 麦类作物学报. 2018(02)
[5]甘蔗ASR基因克隆及水分胁迫下的表达分析[J]. 梁潘霞,邢颖,廖青,黄杏,李长宁,黄太庆,江泽普,李杨瑞. 西南农业学报. 2017(10)
[6]枇杷ASR基因分离及其在果实发育中的表达分析[J]. 许灿,王朝丽,冯健君,杨肖芳,秦巧平. 中国南方果树. 2017(03)
[7]覆盖条件下不同生育期干旱胁迫对玉米植株生长的影响探讨[J]. 王俊雅,胡兵辉. 绿色科技. 2017(09)
[8]气相色谱-质谱法定性定量测定糜子中的脂肪酸[J]. 田翔,乔治军,田琴,曹晓宁,王君杰,刘思辰. 食品科学. 2016(14)
[9]FaASR基因超表达促进草莓果实着色[J]. 贾海锋,刘众杰,赵鹏程,崔力文,房经贵. 园艺学报. 2015(12)
[10]大豆GmWRI1基因在糖、植物激素及盐胁迫下的表达分析[J]. 李丹丹,闫丽,常健敏,王志坤,李文滨. 作物杂志. 2015(04)
博士论文
[1]小麦抗逆相关转录因子bZIP和NAC基因的功能研究[D]. 张丽娜.中国农业科学院 2014
[2]小麦TaASR1基因克隆及抗逆功能研究[D]. 胡伟.华中科技大学 2013
[3]枳和柑橘microRNA及其靶基因的识别、鉴定与表达分析[D]. 宋长年.南京农业大学 2011
[4]小麦抗逆相关DREB/ERF转录因子基因的克隆与鉴定[D]. 徐兆师.中国农业科学院 2005
[5]高粱、玉米苗期抗旱生理与分子机制的比较研究[D]. 邵艳军.西北农林科技大学 2005
硕士论文
[1]基于糜子转录组的NCED基因克隆及干旱胁迫下的表达分析[D]. 杨阳.山西农业大学 2015
[2]不同外源激素处理对库尔勒香梨抗寒生理变化的研究[D]. 王一静.新疆农业大学 2015
[3]二穗短柄草BdASR基因家族的克隆、表达分析和遗传转化[D]. 杨晓月.华中科技大学 2015
[4]外源ABA对玉米苗期抗冷性的影响及对Asr1基因表达的调控[D]. 杨晔.东北农业大学 2014
[5]东乡野生稻ASR2基因的克隆与表达分析[D]. 罗茜.江西农业大学 2014
[6]转DREB1A基因水稻耐盐抗旱性鉴定及生理生化分析[D]. 张亚洲.湖南农业大学 2010
[7]香蕉ASR基因抗逆功能的研究[D]. 王园.海南大学 2010
本文编号：3001618
【文章来源】：山西大学山西省
【文章页数】：84 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
技术路线
19图 2.2 糜子 ASR 家族基因结构分析Figure 2.2 Analysis of the gene broomcorn millet of the ASR family糜子 ASR 家族基因系统发育树；B：糜子 ASR 家族蛋白结构分析 C:糜子 ASR 蛋白 mo颜色背景表示 B 中相同颜色的方块.2 糜子 ASR 家族蛋白系统发育树分析将糜子ASR氨基酸序列与其他已被发现的含有ASR基因八种植物(柳枝稷6豆 1 个、番茄 4 个、谷子 7 个、玉米 5 个、小麦 1 个、水稻 4 个、二穗短柄
糜子 ASR 家族基因克隆与表达分析个、马铃薯 3 个、花生 3 个)（基因登录号见附录 2）的 ASR 家族基因进行多重比较，并用 MEGA 7.0 构建系统发育树（如图 2.3）。可将这些 ASR 蛋白一共分为三组，分别为 Group1、Group2、Group3 分别占进化树的 21 %、21 %、58 %，其中 Group1含有糜子 PmASR4 和 PmASR6，Group2 含有 PmASR3，Group3 包含最多的糜子 ASR蛋白，其中包含 PmASR1、2、5，内有少部分双子叶植物 ASR 蛋白和单子叶植物ASR 蛋白，系统发育树显示糜子 PmASR 蛋白与柳枝稷 PvASR 蛋白高度同源，其次是和谷子 ASR 基因也有较高同源性，双子叶植物番茄 LyASR 和花生 StASR 蛋白也是高度同源等，大豆和花生作为双子叶作物与谷子 SiASR4 基因的同源性较高，所以ASR 基因存在并且在单子叶和双子叶植物的遗传中非常保守。
【参考文献】：
期刊论文
[1]谷子eIF5A基因家族鉴定与分析[J]. 张杰伟,秦新月,陈亚娟,刘婧,崔进荣,姚磊,魏建华. 西南农业学报. 2018(07)
[2]厚藤ASR基因克隆及功能初步分析[J]. 张会,郑洁旋,简曙光,夏快飞,张美. 植物科学学报. 2018(03)
[3]糜子Ty 1-copia型反转录转座子基因的序列特征及表达分析[J]. 何杰丽,薛延桃,王瑞云,陈国荣,陈凌,王海岗,杨美红,乔治军. 山西农业大学学报(自然科学版). 2018(06)
[4]苗期外源脱落酸和茉莉酸缓减小麦花后干旱胁迫的效应及其生理机制[J]. 谢静静,王笑,蔡剑,周琴,戴廷波,姜东. 麦类作物学报. 2018(02)
[5]甘蔗ASR基因克隆及水分胁迫下的表达分析[J]. 梁潘霞,邢颖,廖青,黄杏,李长宁,黄太庆,江泽普,李杨瑞. 西南农业学报. 2017(10)
[6]枇杷ASR基因分离及其在果实发育中的表达分析[J]. 许灿,王朝丽,冯健君,杨肖芳,秦巧平. 中国南方果树. 2017(03)
[7]覆盖条件下不同生育期干旱胁迫对玉米植株生长的影响探讨[J]. 王俊雅,胡兵辉. 绿色科技. 2017(09)
[8]气相色谱-质谱法定性定量测定糜子中的脂肪酸[J]. 田翔,乔治军,田琴,曹晓宁,王君杰,刘思辰. 食品科学. 2016(14)
[9]FaASR基因超表达促进草莓果实着色[J]. 贾海锋,刘众杰,赵鹏程,崔力文,房经贵. 园艺学报. 2015(12)
[10]大豆GmWRI1基因在糖、植物激素及盐胁迫下的表达分析[J]. 李丹丹,闫丽,常健敏,王志坤,李文滨. 作物杂志. 2015(04)
博士论文
[1]小麦抗逆相关转录因子bZIP和NAC基因的功能研究[D]. 张丽娜.中国农业科学院 2014
[2]小麦TaASR1基因克隆及抗逆功能研究[D]. 胡伟.华中科技大学 2013
[3]枳和柑橘microRNA及其靶基因的识别、鉴定与表达分析[D]. 宋长年.南京农业大学 2011
[4]小麦抗逆相关DREB/ERF转录因子基因的克隆与鉴定[D]. 徐兆师.中国农业科学院 2005
[5]高粱、玉米苗期抗旱生理与分子机制的比较研究[D]. 邵艳军.西北农林科技大学 2005
硕士论文
[1]基于糜子转录组的NCED基因克隆及干旱胁迫下的表达分析[D]. 杨阳.山西农业大学 2015
[2]不同外源激素处理对库尔勒香梨抗寒生理变化的研究[D]. 王一静.新疆农业大学 2015
[3]二穗短柄草BdASR基因家族的克隆、表达分析和遗传转化[D]. 杨晓月.华中科技大学 2015
[4]外源ABA对玉米苗期抗冷性的影响及对Asr1基因表达的调控[D]. 杨晔.东北农业大学 2014
[5]东乡野生稻ASR2基因的克隆与表达分析[D]. 罗茜.江西农业大学 2014
[6]转DREB1A基因水稻耐盐抗旱性鉴定及生理生化分析[D]. 张亚洲.湖南农业大学 2010
[7]香蕉ASR基因抗逆功能的研究[D]. 王园.海南大学 2010
本文编号：3001618
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3001618.html
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