胰腺导管腺癌差异基因表达及临床预后分析

发布时间：2021-01-28 13:56

　　目的分析胰腺导管腺癌（PDAC）差异基因表达及临床预后。方法从GEO（Gene Expression Omnibus）数据库中获取基因及微RNA（miRNA）数据集,并采用R 3.6.1分析数据集中的差异表达基因。采用注释、可视化和集成发现数据库（DAVID）对差异基因的基因本体论（GO）富集通路和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路进行分析,使用miRwalk在线数据库预测miRNA靶基因。通过STRING数据库、miRNet网站和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用（PPI）网络和miRNA-基因网络。通过Kaplan-Meier plot数据库绘制生存曲线,并使用加利福尼亚大学圣克鲁斯分校Xena数据库构建基因表达分析聚类图。结果从GEO数据库4个基因数据集获得217个差异基因,2个miRNA数据集获得13个差异表达的miRNA,DAVID数据库中发现217个基因高度富集于8个生物学过程,8个细胞成分通路,5个分子功能通路及4个KEGG通路[伪发现率（FDR）<0.05]。连接系数> 0.4的基因被用来构建PPI网络,共有167个基因通过分子复合物检测工具分析... 

【文章来源】：医学综述. 2020,26(22)

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

5 APOL1高低表达组的生存情况

4个重要的KEGG通路

1 FN1高低表达组的生存情况

【参考文献】：
期刊论文
[1]2019年胰腺癌研究及诊疗新进展[J]. 刘梦奇,吉顺荣,徐晓武,虞先濬.  中国癌症杂志. 2020(01)



本文编号：3005115