甲状腺乳头状癌差异蛋白筛选及CAP1、UGP2基因增殖功能初步研究

发布时间：2021-02-02 02:28

　　背景:甲状腺癌（Thyroid carcinoma,TC）是内分泌系统发病率最高的恶性肿瘤,发病率有逐年上升趋势,无论在全球还是中国范围内,TC均成为发病率增长最快的恶性肿瘤之一,其中甲状腺乳头状癌（Papillary thyroid carcinoma,PTC）是最常见组织学类型。目前用于检测和判断预后的PTC相关基因标记物有BRAF V600E基因、RAS基因突变和TERT启动子突变,蛋白标志物有半乳糖凝集素-3（Galectin-3）、细胞角蛋白-19（CK19）、间皮瘤相关抗体-1（HBME-1）等。近年来,蛋白质组学发展为深入研究PTC的分子标志物,为探讨PTC发病机制、明确诊断、发现治疗新靶点提供更多可能。目的:1、筛查甲状腺乳头状癌（PTC）和甲状腺良性结节（BTN）差异表达蛋白;2、验证差异蛋白基因对PTC细胞增殖的影响,寻找与甲状腺癌细胞增殖有关的新靶点;3、检测目标蛋白在在PTC组织中的表达情况,并分析其与临床病理参数之间的关系。方法:1、选取经皮甲状腺细针穿刺液标本36例,BTN 18例为A（1-3）组,PTC18例为B（1-3）组,应用非标记定量（Label-f... 

【文章来源】：天津医科大学天津市 211工程院校

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【学位级别】：博士

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MaxQuant软件进行非标记定量的原理

图 1.4 质谱分析 Basepeak 图谱Figure 1.4 Mass Spectrometric Analysis of Basepeak Atlas表 1-5 质谱分析结果（数据库：uniprot HomoSapiens 20161205. fasta）Table 1-5 Mass Spectrometric Analysis Results (Database: UniProt HomoSapiens 20161205. fasta)良性甲状腺结节BTN甲状腺乳头状癌PTC编号 1 2 3 4 5 6样本名称A1组A2组A3组B1组B2组B3 组Protein group 308 247 241 800 547 641Protein group(Unique Peptide≥2)220 172 188 576 434 504

表 1-6 蛋白质鉴定结果统计Table 1-6 Statistics of Protein Identification ResultsDatabase Peptides Protein groupsHomoSapiens 10169 14391.2.4.2 肽段离子的得分分布本实验使用Andromeda[51]对质谱图谱数据进行分析，以Peptide FDR≤0.0和Protein FDR≤0.01作为Label free数据筛选标准，获得MS图谱的得分。根据鉴定到的肽段得分和肽段数量绘制肽段离子得分分布示意图，横坐标为鉴定到的肽段得分；主纵坐标Number of peptides表示鉴定到的对应离子得分的肽段数量大部分位于50-120之间，对应图中的柱状图；次纵坐标表示不高于对应得分肽段所占的累积比例，分布较均匀，对应图中的红色曲线，见下图1-5，大约70%的肽段得分在60分以上，实验数据质量较好。


本文编号：3013878