基因突变与纯红再障发生的相关性研究

发布时间：2021-02-17 08:18

　　单纯红细胞再生障碍性贫血（pure red cell aplasia,PRCA）,简称纯红再障,是一种罕见的血液系统疾病。分为先天性和后天性两种类型。后天性PRCA又分为特发性和继发性两类。目前认为继发性PRCA的发生与某些疾病如胸腺瘤、细小病毒B19感染以及白血病等相关。但特发性PRCA的发病机制尚不完全清楚,可能与自身免疫异常相关。现阶段特发性PRCA常用的治疗手段是免疫抑制剂类药物如糖皮质激素和环孢素等,这些治疗手段虽然在大多数患者中取得了较好的疗效,然而一旦停药,PRCA常会出现复发。因此,从DNA突变的角度寻找PRCA患者可能的发病机制,将为PRCA药物研发提供新的靶点,进而提高PRCA患者的治疗效果和生活质量。本研究采用二代测序技术,对4例PRCA患者的295个关键基因进行了深度测序,分析后共发现529个突变位点。根据2015版美国医学遗传学与基因组学学会关于基因突变的解释指南和ClinVar数据库,我们将这529个突变分为三组:不确定（uncertain）突变组（25个）、可能良性（likely benign）突变组（20个）及良性（benign）突变组（484个）。并利... 

【文章来源】：上海交通大学上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

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基因突变的获取流程图

：良性突变组，可能良性突变组和不确定突变组。在 2015 版美国医学遗传基因组学学会的突变解释指南中，一共将突变类型分为 5 组，即良性突变enign），可能良性突变组（likely benign），意义不确定突变组（uncertainificance），致病突变组（pathogenic）和可能致病突变组（likely pathogenic们的结果中，没有突变符合致病突变组或可能致病突变组的条件。同时，不确定突变组（uncertain）与 2015 版指南中的不确定突变组（uncertainificance）含义相同。然后我们通过两种白血病细胞的Hi-C数据库（KBM7细胞系与K562细胞系6]，将不确定突变组与良性突变组中的突变位点在染色质空间分布的聚集性较，发现无论是在 KBM7 细胞系中，还是在 K562 细胞系中，不确定突变坐标的数值都更靠近 1。其中数值越大，表明接触概率越大，即空间距离结果表明，与良性突变组相比，不确定突变组中的突变位点在染色质的空中有更强的聚集性(见图 2，A 图 P=0.026，B 图 P=0.044)。

上海交通大学医学院博士学位论文Figure 2. Spatial proximity comparison of mutation pairs of uncertain group and benign group分别通过 KBM7 细胞系(A)和 K562 细胞系（B）Hi-C 数据库，对两组突变位点在空间聚集性方面的比较接着本研究对它们在空间的聚集性是否是由于它们在染色质上的线性距离所决定进行了探讨。通过分析发现，在这两种细胞系（KBM7 和 K562）中，不同的突变组之间，突变位点在染色质中线性距离比较均没有明显的差异（见图 3，P﹥0.05）。这表明在染色质中的线性距离并不是它们在空间聚集的主要原因。


本文编号：3037712