花生1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶ITPK家族基因的鉴定和分析

发布时间：2021-02-19 20:32

　　1,3,4-三磷酸肌醇5/6-激酶（ITPK）是一种保守的多功能酶,调控磷酸肌醇的代谢过程,广泛存在于动植物和线虫中。本研究从两个野生种花生基因组（Arachis duranensis和Arachis ipaensis）中获得Ad ITPK家族基因7个,Ai ITPK家族基因7个,利用生物信息学手段,系统地分析花生ITPK家族基因生物学特征。结果表明,Ad ITPKs和AiITPKs基因的染色体定位相似,在03号和05号染色体上都分别有2个ITPK家族成员,Ad ITPKs在A01、A08和A10号染色体上各1个,Ai ITPKs在B01、B07和B10号染色体上各1个;花生各ITPK基因含外显子数量在1～10个不等,可编码220～483个氨基酸;进化关系分析显示花生ITPK家族基因可分为3个亚家族;基于保守结构域分析显示,此家族蛋白含有4～6个保守结构基序。两基因组同源基因的二级结构相似性较大,而Ad ITPK5和Ai ITPK5、Ad ITPK6和AiITPK6两对同源基因例外;大部分基因的三级结构皆相似,但Ad ITPK1、Ad ITPK6、Ai ITPK1和Ai ITPK6与其... 

【文章来源】：中国油料作物学报. 2020,42(03)北大核心

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

大豆、水稻、拟南芥、玉米和野生花生ITPK基因系统发育树

野生花生ITPK家族基因染色体定位

从花生数据库Peanutbase中下载花生ITPK家族基因表达数据，得到花生AdITPK2、AdITPK5、AiITPK2、AiITPK5在生长过程中不同部位、不同时期的表达量，如图5所示。AdITPK2和AiIPKT2在所测定的各个组织、不同发育时期均有表达，其中AdIT-PK2在根瘤中（萌发25d后）表达量最高，其次是在萌发10d后的根系中，在其余部位表达量相对较小。AiITPK2在种子（种子白色或一端粉色时期和荚果呈鱼雷形时期）、种皮（荚果呈鱼雷形时期）、生殖茎尖（始花期）和萌发10d后根系等部位都有较高的表达量。AdITPK5在雄蕊中无表达，在雌蕊中表达极低，而在种子（胚轴呈白色时期）、茎尖（主茎始花期）和主茎（始花期）中表达量较高，AiITPK5在花被和种皮中无表达，在种子（白色或一端粉色）、生殖茎尖（始花期）等部位有较高的表达。图4 A.ipansis ITPK家族基因结构及蛋白保守基序示意图

【参考文献】：
期刊论文
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[3]花生14-3-3基因家族的生物信息学分析[J]. 姜焕焕,王通,禹山林,陈明娜,王冕,陈娜,潘丽娟,祁佩时,迟晓元.  中国油料作物学报. 2018(04)
[4]植物膜联蛋白基因研究进展[J]. 王立科,张边江,唐宁,杨平,周峰,陈全战.  分子植物育种. 2016(08)
[5]玉米1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶ITPK家族基因的鉴定和分析[J]. 张中保,李向龙,吴忠义,魏建华.  科技导报. 2015(16)
[6]一个编码1,3,4-三磷酸肌醇5/6-激酶类似物的拟南芥基因的克隆及其在胁迫条件下的表达分析（英文）[J]. 陈其军,钮旭光,柴茂峰,陈珈,刘强,王学臣.  Acta Botanica Sinica. 2003(02)

博士论文
[1]拟南芥1，3，4-三磷酸肌醇5/6-激酶在光形态建成中的功能研究[D]. 秦治翔.中国农业大学 2005



本文编号：3041649