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Prodiginine基因簇在异源放线菌中的表达

发布时间:2021-02-20 19:17
  次级代谢产物在我们生活的许多方面都发挥着重要的作用,特别在医疗药物领域,目前近三分之二的治疗药物来源于直接分离的次级代谢产物或是其相关的衍生物。随着基因测序技术的发展,放线菌基因组数据的积累,放线菌巨大的次级代谢产物生产潜能被再次发现。但放线菌内蕴含的大量次级代谢基因多数处于沉默状态,或是表达产量过低又无法进行遗传操作改造菌株以提高产量等困难使得放线菌的生产潜能不能被有效开发。因此产生的异源表达技术——将异源基因组导入宿主细胞内进行表达,能进一步开发放线菌的次级代谢产物生产潜能,是目前激活沉默基因簇的重要手段。利用antiSMASH对菌株NA03103的基因组进行分析得到23个次级代谢基因簇信息。其中基因簇ucp经过基因比对发现与化合物marineosins的生物合成基因簇mar高度相似。为排除原菌株复杂代谢背景对检测该基因簇产物的影响,选择构建表达质粒在异源宿主中表达的方法来确认其功能。成功构建菌株NA03103的cosmid文库,利用PCR技术筛选得到包含该基因簇生物合成必须基因的cosmid质粒23H-3,最终在异源宿主S.ablu 中表达获得产物undecylprodigios... 

【文章来源】:南京大学江苏省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:83 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

Prodiginine基因簇在异源放线菌中的表达


图2-3NA03103中i/cp基因簇与基因簇比对结果??

基因簇,质粒,化合物,基因


?M?NOPQRTVVZYW?X?D??■?biosynthetic?genes?■?other?genes?[稼丨?regulatory?genes??图2-3NA03103中i/cp基因簇与基因簇比对结果??marineosin?A?marineosin?B??图2-4化合物marineosins的结构??表2-1基因簇wcp的基因注释结果??.??identities/??protein?aa?homologous?protein?protein?id??positives??ucpA?690?DNA-binding?protein?KDN77539.1?90/94??ucpB?37?hypothetical?protein?EHN75379.i?92/97??ucpE?295?marE,?Putative?acyltransferase?AHF22860.1?77/86??ucpC?226?hypothetical?protein?PHR91277.1?39/58??ucpG?408?marG,?oxidase?AHF22859.1?64/80??ucpH?933?marH,?phosphoenolpyruvate-utilizing?enzyme?AHF22858.1?70/80??ucpl?362?marl,?methyltransferase?AHF22857.1?71/83??ucpJ?280?marJ,?thioesterase?WP?099878120.1?61/67??ucpK?346?marK

化合物,异源表达,质粒


图2-6Cosmid质粒23H-3在S.aW似中异源表达的结果??


本文编号:3043224

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