甲基磺酸甲酯处理对白花泡桐丛枝病发生基因表达变化的影响

发布时间：2021-03-13 01:41

　　由植原体侵染泡桐韧皮部而导致的泡桐丛枝病（Paulownia Witches Broom,PaWB）是泡桐生产中的致命病害,这种传染性病害具有危害性高、治愈难、致死率高等特点,给农林业生产带来了严重的经济损失。转录组学分析使人们了解植物环境变化的表达谱;时间序列转录组分析可以帮助了解植物对环境变化反应的敏感期。权重基因共表达网络分析（WGCNA）分析不仅可以识别具有较高生物学意义的模块;还可以识别那些具有高连通性或模块中的基因。因此,为深入挖掘与泡桐丛枝病发病密切相关的基因,解析泡桐丛枝病发病机理,本研究选取不同浓度及不同时间点(20 mg·L^-1和60 mg·L^-1甲基磺酸甲酯methyl methane sulfonate,MMS)处理的白花泡桐患病幼苗和白花泡桐健康幼苗,模拟了泡桐由感病→形态恢复健康→患病以及逐渐恢复健康的过程。利用Illumina HiSeq高通量测序技术,构建泡桐响应植原体侵染的转录组数据库。采用“标准分析”和“网络分析”两种方法对转录组数据进行分析。在标准分析中,通过对各比对组进行比对分析挖掘与泡桐丛枝病发生相关... 

【文章来源】：河南农业大学河南省

【文章页数】：68 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

技术路线Fig.1Technicalroute

转录组生物信息分析流程图

TopHat2分析流程


本文编号：3079351