低温胁迫下秋茄基因差异表达及可变剪切谱的研究

发布时间：2021-03-13 06:57

　　红树林是处于热带、亚热带陆地与海洋过渡带的特殊生态系统。红树物种“秋茄（Kandelia obovata）”在我国自然分布纬度的最北端位于福建省福鼎市,是我国最耐寒的红树物种。研究低温胁迫对秋茄的影响为红树植物品种向北种植和红树植物抗寒性研究具有十分重要的意义。目前的研究关于秋茄低温胁迫及抗寒研究较多集中在生理生态水平,较少从转录组、分子水平上研究低温胁迫对秋茄影响分子机制。本文将实验室培养1年生的秋茄进行25℃常温培养和5℃低温胁迫培养4 d。利用转录组测序技术以及生物学信息方法分析秋茄应对低温胁迫的分子机制。本研究取得的主要结果和结论如下:1.利用Illumina高通量测序平台进行双端测序。对秋茄常温条件和低温胁迫下的六组转录组数据进行原始数据过滤得到161,275,740条clean reads。对转录组测序结果进行参考基因组比对,比对率均高于94%。通过基因差异表达分析,结果得到474个显著上调表达基因和892个显著下调表达基因。2.通过比对秋茄长时间低温胁迫与常温条件的基因表达分析发现,差异表达基因主要富集在植物昼夜节律、植物激素传导通路和植物次级代谢相关等途径。（1）秋茄通... 

【文章来源】：厦门大学福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：95 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１－１可变剪切形式??Ｆｉｇ．?１－１?Ｔｙｐｅｓ?ｏｆ?ａｌｔｅｒｎａｔｉｖｅ?ｓｐｌｉｃｉｎｇ??

图１－２技术流程??Ｆｉｇ．?１－２?Ｔｅｃｈｆｌｏｗ??

图２－１数据分析流程??Ｆｉｇ．?２－１?Ａｎａｌｙｓｅｓ?ｗｏｒｋｆｌｏｗ??

【参考文献】：
期刊论文
[1]植物应答非生物胁迫信号传导研究进展[J]. 刘铃,武小龙,诸葛强.  分子植物育种. 2018(02)
[2]植物次生代谢产物-酚类化合物的研究进展[J]. 华晓雨,陶爽,孙盛楠,郭娜,阎秀峰,蔺吉祥.  生物技术通报. 2017(12)
[3]红树林耐寒性和向海性生态系列对气候变化响应的研究进展[J]. 陈鹭真,郑文教,杨盛昌,王文卿,张宜辉.  厦门大学学报(自然科学版). 2017(03)
[4]植保素及其在增强作物抗性中的作用[J]. 陈东菊,安敏敏,李丽兰,方继朝,刘永锋,罗玉明,杨立明.  分子植物育种. 2017(02)
[5]植物内源激素研究进展[J]. 段娜,贾玉奎,徐军,陈海玲,孙鹏.  中国农学通报. 2015(02)
[6]角果木和红海榄对低温胁迫的生理响应差异研究[J]. 陈燕,谢正生,刘锴栋,许方宏,陈粤超.  西北农林科技大学学报(自然科学版). 2013(03)
[7]2008年南方低温对我国红树植物的破坏作用[J]. 陈鹭真,王文卿,张宜辉,黄丽,赵春磊,杨盛昌,杨志伟,陈粤超,徐华林,钟才荣,苏博,方柏州,陈乃明,曾传志,林光辉.  植物生态学报. 2010(02)
[8]Effect of soil salinity on cold tolerance of mangrove Kandelia candel[J]. 杨盛昌,李云波,林鹏.  Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2005(01)
[9]夜间低温对红树幼苗光合特性的影响[J]. 杨盛昌,林鹏,李振基,王文卿,中须贺常雄.  厦门大学学报(自然科学版). 1999(04)
[10]六种红树植物的抗寒特性研究[J]. 林鹏,沈瑞池,卢昌义.  厦门大学学报(自然科学版). 1994(02)

博士论文
[1]玉米苗期盐胁迫响应转录本表达谱构建[D]. 丁冬.华中农业大学 2008

硕士论文
[1]甘蓝型油菜响应低硼胁迫差异剪接基因的研究[D]. 谷金.华中农业大学 2016



本文编号：3079770