双线紫蛤COI基因序列多态性与水环境分析

发布时间：2021-03-16 07:50

　　以双线紫蛤（Soletellina diphos）为研究对象,测定南日岛海区自然群体30枚个体的线粒体COI基因部分序列,研究其个体间的序列单核苷酸多态性（SNP）,掌握双线紫蛤的遗传多样性;统计南日岛海域2008年4月—2018年12月期间海水样品的盐度、温度、pH、溶解氧、叶绿素a、透明度、化学需氧量、无机氮、无机磷、石油类10项理化因子检测结果,分析数据随季节月份变化状况,了解双线紫蛤栖息地水环境。结果显示,南日岛双线紫蛤群体30枚个体的序列中碱基T、C、A、G平均含量分别为41.95%、16.07%、18.53%、23.45%,（A+T）含量明显高于（G+C）含量,共发现13个核苷酸多态位点（转换/颠换偏倚率13.04）,具有9个单倍型,有1个为引起亮氨酸/苯丙氨酸变化的非同义突变位点,单倍型多样性指数（Hd）为（0.598 0±0.103 0）,核苷酸多样性（Pi）为（0.002 9±0.000 6）,平均核苷酸变异数（k）为1.912 6,表现出略高于标准值的单倍型多样性和较低的核苷酸多样性,个体间的遗传距离为0～0.009 2、平均值为（0.002 9±0.001 0）,... 

【文章来源】：渔业研究. 2020,42(04)

【文章页数】：15 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 序列多态性
        1.2.2 栖息地水环境
2 结果
    2.1 序列多态性
    2.2 栖息地水环境
3 讨论
    3.1 序列多态性
    3.2 栖息地水环境



本文编号：3085686