基于meta分析确定基因单核苷酸多态性与吸烟在消化道癌症中的交互作用及vimentin在结直肠癌发生与预后中的作用
发布时间:2021-03-24 22:15
研究背景癌症是21世纪人类疾病死亡的第二大死因。部分患者死于消化道癌症,其中以结直肠癌(colorectal cancer,CRC),胃癌(gastric cancer,GC),肝癌(liver cancer,LC)和食管癌(oesophageal cancer,OC)为主。癌症的发展涉及遗传因素和环境因素的共同参与。吸烟作为一种癌症相关的环境因素,可能与基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)之间存在交互作用。目前关于二者交互作用在消化道肿瘤发生中的研究为少量的单项研究,缺乏统计学效能,并且研究结果之间不一致。由于meta分析能够对同一课题的多项研究结果作出系统性的评价和总结,提高统计学效能。因此,本研究首先通过meta分析研究基因单核苷酸多态性与吸烟在以上四种消化道癌症发生中的关系。由于CRC具有高发病率、高死亡率和预后差的特点,因此,其预后也是研究的重点。Vimentin是肿瘤发生中上皮-间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)的最好标志之一,但是尚不确定vimentin是否可以作...
【文章来源】:西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:130 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略语对照表
第一章 绪论
1.1 消化道肿瘤概述
1.2 CRC概述
1.2.1 CRC的流行病学
1.2.1.1 CRC的地域分布差异
1.2.1.2 CRC的人群分布差异
1.2.2 CRC的相关危险因素
1.2.2.1 遗传因素
1.2.2.2 环境和饮食因素
1.2.2.3 生活方式因素、疾病因素和其他
1.3 吸烟与基因单核苷酸多态性的交互作用对CRC易感性的影响
1.3.1 代谢基因与吸烟的交互作用对CRC易感性的影响
1.3.1.1 谷胱甘肽转移酶(GSTs)家族基因与吸烟的交互作用研究
1.3.1.2 细胞色素P450(CYP450)家族基因与吸烟的交互作用研究
1.3.1.3 N-乙酰基转移酶(NATs)家族基因与吸烟的交互作用研究
1.3.1.4 亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因与吸烟的交互作用研究
1.3.2 DNA修复基因与吸烟的交互作用对CRC易感性的影响
1.3.3 肿瘤抑制基因与吸烟的交互作用对CRC易感性的影响
1.4 CRC预后预测研究
1.4.1 组织源性的预后标志物
1.4.1.1 分子预后标志物
1.4.1.2 具有预后意义的DNA变异
1.4.1.3 具有预后意义的miRNA
1.4.2 血液源性的预后标志物
1.4.2.1 术前和术后的血清癌胚抗原(carcinoembryonicantigen,CEA)水平
1.4.2.2 癌症抗原19-9(CA19-9)水平
1.4.2.3 循环肿瘤细胞(circulatingtumorcells,CTCs)
第二章 基因单核苷酸多态性与吸烟的交互作用对四种消化道癌症易感性影响的META分析
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 文献检索策略
2.2.2 纳入与剔除标准
2.2.3 数据提取
2.2.4 质量评价
2.2.5 统计学方法
2.3 结果
2.3.1 文献检索结果
2.3.2 纳入研究的特征
2.3.3 质量评价结果
2.3.4 烟草代谢相关基因与吸烟的交互作用
2.3.4.1 GSTM1
2.3.4.2 GSTT1
2.3.4.3 GSTP1
2.3.4.4 CYP1A1
2.3.4.5 SULT1A1
2.3.4.6 NAT2
2.3.5 DNA修复基因与吸烟的交互作用
2.3.5.1hOGG1
2.3.5.2XRCC1
2.3.6 肿瘤抑制基因与吸烟的交互作用
2.4 讨论
第三章 基于META分析和TCGA数据库确定VIMENTIN参与结直肠癌的发生与预后
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 Meta分析
3.2.1.1 检索策略
3.2.1.2 文献选择标准
3.2.1.3 数据提取
3.2.1.4 质量评价
3.2.1.5 统计学分析
3.2.2 TCGA数据库的分析
3.3 结果
3.3.1 文献检索
3.3.2 研究特征和质量评价
3.3.3 Vimentin表达与总生存率之间的关系
3.3.4 Vimentin表达与无疾病生存率(diseasefreesurvival,DFS)之间的关系
3.3.5 Vimentin表达与临床病理学特征之间的关系
3.3.6 TCGA数据库的分析
3.4 讨论
结论
参考文献
攻读博士学位期间取得的科研成果
致谢
作者简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]中国居民2015年恶性肿瘤死亡率流行病学特征分析[J]. 兰蓝,赵飞,蔡玥,武瑞仙,孟群. 中华流行病学杂志. 2018 (01)
[2]Dietary factors can protect against liver cancer development[J]. Lemonica Koumbi. World Journal of Hepatology. 2017(03)
[3]CYP1A1, CYP2E1 and EPHX1 polymorphisms in sporadic colorectal neoplasms[J]. Glaucia Maria M Fernandes,Anelise Russo,Marcela Alcantara Proen?a,Nathalia Fernanda Gazola,Gabriela Helena Rodrigues,Patrícia Matos Biselli-Chicote,Ana Elizabete Silva,Jo?o Gomes Netinho,érika Cristina Pavarino,Eny Maria Goloni-Bertollo. World Journal of Gastroenterology. 2016(45)
[4]波形蛋白在结直肠腺癌中的表达及其临床意义[J]. 谭景浪,陈琼,乔莎莎,覃勤英,邓娟荣,李美良,陆厚良. 广西医科大学学报. 2016(05)
[5]从肿瘤登记数据看中国恶性肿瘤的发病特点和趋势[J]. 陈万青. 中华健康管理学杂志. 2016 (04)
[6]Systematic review of the old and new concepts in the epithelial-mesenchymal transition of colorectal cancer[J]. Simona Gurzu,Camelia Silveanu,Annamaria Fetyko,Vlad Butiurca,Zsolt Kovacs,Ioan Jung. World Journal of Gastroenterology. 2016(30)
[7]RhoGDI2与EMT相关蛋白在结直肠癌组织中表达的临床意义及相关性[J]. 陈颖,姜昊声,马俐君,柳思琪,金珍婧,徐庆. 中国实验诊断学. 2015(09)
[8]结直肠癌病人Vimentin表达的临床意义[J]. 高照华,张皓,石刚. 实用肿瘤学杂志. 2015 (04)
[9]结直肠癌流行病学趋势[J]. 李道娟,李倩,贺宇彤. 肿瘤防治研究. 2015(03)
[10]结直肠癌基因组流行病学研究进展[J]. 陈尔飞,徐晓娜,杨进. 基因组学与应用生物学. 2014(05)
硕士论文
[1]E-cadherin和Vimentin在新疆维吾尔族、汉族结肠癌中的表达及其临床意义[D]. 李龙龙.新疆医科大学 2015
[2]环境暴露、代谢酶基因多态性与结直肠癌的病例对照研究[D]. 蒋沁婷.浙江大学 2003
本文编号:3098490
【文章来源】:西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:130 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
缩略语对照表
第一章 绪论
1.1 消化道肿瘤概述
1.2 CRC概述
1.2.1 CRC的流行病学
1.2.1.1 CRC的地域分布差异
1.2.1.2 CRC的人群分布差异
1.2.2 CRC的相关危险因素
1.2.2.1 遗传因素
1.2.2.2 环境和饮食因素
1.2.2.3 生活方式因素、疾病因素和其他
1.3 吸烟与基因单核苷酸多态性的交互作用对CRC易感性的影响
1.3.1 代谢基因与吸烟的交互作用对CRC易感性的影响
1.3.1.1 谷胱甘肽转移酶(GSTs)家族基因与吸烟的交互作用研究
1.3.1.2 细胞色素P450(CYP450)家族基因与吸烟的交互作用研究
1.3.1.3 N-乙酰基转移酶(NATs)家族基因与吸烟的交互作用研究
1.3.1.4 亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因与吸烟的交互作用研究
1.3.2 DNA修复基因与吸烟的交互作用对CRC易感性的影响
1.3.3 肿瘤抑制基因与吸烟的交互作用对CRC易感性的影响
1.4 CRC预后预测研究
1.4.1 组织源性的预后标志物
1.4.1.1 分子预后标志物
1.4.1.2 具有预后意义的DNA变异
1.4.1.3 具有预后意义的miRNA
1.4.2 血液源性的预后标志物
1.4.2.1 术前和术后的血清癌胚抗原(carcinoembryonicantigen,CEA)水平
1.4.2.2 癌症抗原19-9(CA19-9)水平
1.4.2.3 循环肿瘤细胞(circulatingtumorcells,CTCs)
第二章 基因单核苷酸多态性与吸烟的交互作用对四种消化道癌症易感性影响的META分析
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 文献检索策略
2.2.2 纳入与剔除标准
2.2.3 数据提取
2.2.4 质量评价
2.2.5 统计学方法
2.3 结果
2.3.1 文献检索结果
2.3.2 纳入研究的特征
2.3.3 质量评价结果
2.3.4 烟草代谢相关基因与吸烟的交互作用
2.3.4.1 GSTM1
2.3.4.2 GSTT1
2.3.4.3 GSTP1
2.3.4.4 CYP1A1
2.3.4.5 SULT1A1
2.3.4.6 NAT2
2.3.5 DNA修复基因与吸烟的交互作用
2.3.5.1hOGG1
2.3.5.2XRCC1
2.3.6 肿瘤抑制基因与吸烟的交互作用
2.4 讨论
第三章 基于META分析和TCGA数据库确定VIMENTIN参与结直肠癌的发生与预后
3.1 引言
3.2 材料和方法
3.2.1 Meta分析
3.2.1.1 检索策略
3.2.1.2 文献选择标准
3.2.1.3 数据提取
3.2.1.4 质量评价
3.2.1.5 统计学分析
3.2.2 TCGA数据库的分析
3.3 结果
3.3.1 文献检索
3.3.2 研究特征和质量评价
3.3.3 Vimentin表达与总生存率之间的关系
3.3.4 Vimentin表达与无疾病生存率(diseasefreesurvival,DFS)之间的关系
3.3.5 Vimentin表达与临床病理学特征之间的关系
3.3.6 TCGA数据库的分析
3.4 讨论
结论
参考文献
攻读博士学位期间取得的科研成果
致谢
作者简介
【参考文献】:
期刊论文
[1]中国居民2015年恶性肿瘤死亡率流行病学特征分析[J]. 兰蓝,赵飞,蔡玥,武瑞仙,孟群. 中华流行病学杂志. 2018 (01)
[2]Dietary factors can protect against liver cancer development[J]. Lemonica Koumbi. World Journal of Hepatology. 2017(03)
[3]CYP1A1, CYP2E1 and EPHX1 polymorphisms in sporadic colorectal neoplasms[J]. Glaucia Maria M Fernandes,Anelise Russo,Marcela Alcantara Proen?a,Nathalia Fernanda Gazola,Gabriela Helena Rodrigues,Patrícia Matos Biselli-Chicote,Ana Elizabete Silva,Jo?o Gomes Netinho,érika Cristina Pavarino,Eny Maria Goloni-Bertollo. World Journal of Gastroenterology. 2016(45)
[4]波形蛋白在结直肠腺癌中的表达及其临床意义[J]. 谭景浪,陈琼,乔莎莎,覃勤英,邓娟荣,李美良,陆厚良. 广西医科大学学报. 2016(05)
[5]从肿瘤登记数据看中国恶性肿瘤的发病特点和趋势[J]. 陈万青. 中华健康管理学杂志. 2016 (04)
[6]Systematic review of the old and new concepts in the epithelial-mesenchymal transition of colorectal cancer[J]. Simona Gurzu,Camelia Silveanu,Annamaria Fetyko,Vlad Butiurca,Zsolt Kovacs,Ioan Jung. World Journal of Gastroenterology. 2016(30)
[7]RhoGDI2与EMT相关蛋白在结直肠癌组织中表达的临床意义及相关性[J]. 陈颖,姜昊声,马俐君,柳思琪,金珍婧,徐庆. 中国实验诊断学. 2015(09)
[8]结直肠癌病人Vimentin表达的临床意义[J]. 高照华,张皓,石刚. 实用肿瘤学杂志. 2015 (04)
[9]结直肠癌流行病学趋势[J]. 李道娟,李倩,贺宇彤. 肿瘤防治研究. 2015(03)
[10]结直肠癌基因组流行病学研究进展[J]. 陈尔飞,徐晓娜,杨进. 基因组学与应用生物学. 2014(05)
硕士论文
[1]E-cadherin和Vimentin在新疆维吾尔族、汉族结肠癌中的表达及其临床意义[D]. 李龙龙.新疆医科大学 2015
[2]环境暴露、代谢酶基因多态性与结直肠癌的病例对照研究[D]. 蒋沁婷.浙江大学 2003
本文编号:3098490
本文链接:https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3098490.html
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