马铃薯蔗糖响应基因StMYB44、StMYB44b的克隆及功能分析
发布时间:2021-04-01 18:38
MYB转录因子存在于所有真核生物中,是最具代表的转录因子家族之一,广泛参与植物发育、苯丙烷代谢、生物与非生物胁迫响应、激素响应以及细胞形态建成等过程。本研究以马铃薯‘青薯9号’的块茎为实验材料,克隆了St MYB44、St MYB44b基因,并对其表达模式进行分析,将构建的表达载体转化至同属茄科的模式植物烟草中,分析不同蔗糖浓度下转基因烟草的生长情况,对St MYB44、St MYB44b基因进行功能初探。主要结果如下:1、以马铃薯‘青薯9号’块茎的c DNA为模板,克隆了St MYB44基因。St MYB44有2种类型,CDS长度为962 bp和953 bp,分别编码320和317个氨基酸,为不稳定的亲水性蛋白;亚细胞定位预测发现,St MYB44定位于细胞核;系统进化树和多序列比对分析发现,St MYB44与番茄MYB44的亲缘关系最近,与橡胶树的亲缘关系较远;启动子分析发现,St MYB44含有多种调控元件,如光照、激素、胁迫响应等;q RT-PCR分析发现,St MYB44在花中表达最高,匍匐茎中最低;St MYB44在Me JA处理下,表达量先降低后升高,在8 h表达量最低;...
【文章来源】:青海大学青海省 211工程院校
【文章页数】:93 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
马铃薯块茎的RNA
青海大学硕士学位论文第二章马铃薯StMYB44、StMYB44b的克隆及表达分析24图2.1马铃薯块茎的RNAM:DL2000;1-2为块茎RNAFig.2.1RNAofPotatoTuberM:DL2000;1-2asTuberRNA2)CDS的克隆以马铃薯‘青薯9号’块茎的cDNA为模板,进行特异性扩增,产物经2%的琼脂糖凝胶电泳检测其片段的大小,结果如图2.2所示,获得一条约1000bp的条带,与预期的StMYB44片段大小基本一致。将条带切下,经过回收、连接、转化、筛菌并送生工测序后,将测序结果与NCBI中的原基因序列使用DNAMAN进行比较发现,StMYB44存在2种类型,分别命名为StMYB44-1和StMYB44-2。图2.2StMYB44基因的CDS克隆M:DL2000;1:StMYB44
青海大学硕士学位论文第二章马铃薯StMYB44、StMYB44b的克隆及表达分析25Fig2.2StMYB44geneCDScloningM:DL2000;1:StMYB442.4.1.2马铃薯StMYB44的生物信息学分析1)马铃薯StMYB44基因的序列分析如图2.3所示,StMYB44-1与原序列(XM_006367359.2)一样,CDS长度为962bp,编码的蛋白质含有320个氨基酸,而StMYB44-2发生了11处碱基改变和9处碱基缺失,CDS长度为953bp,编码的蛋白质含有317个氨基酸。StMYB44-1和StMYB44-2均含有两个保守的MYB结构域,为典型的R2R3-MYB转录因子。图2.3-1StMYB44基因的序列比对图Fig2.3-1SequencealignmentofStMYB44gene
【参考文献】:
期刊论文
[1]七种彩色马铃薯的蛋白质营养评价[J]. 徐丽珊,戴一辉,谢子玉,蒲首丞,程林润. 浙江师范大学学报(自然科学版). 2020(01)
[2]利用酵母双杂交系统筛选花生AhMYB44互作蛋白[J]. 刘永惠,沈一,沈悦,陈志德. 植物遗传资源学报. 2020(01)
[3]ABA合成基因StNCED2对马铃薯块茎形成的影响[J]. 朱文姣,刘璐,章甲,陈敏,徐玉伟,杨清. 南京农业大学学报. 2019(05)
[4]青海马铃薯生产的比较优势分析[J]. 苏旺,周云,王舰. 贵州农业科学. 2019(09)
[5]烯效唑(S3307)和胺鲜酯(DTA-6)对马铃薯叶与块茎糖代谢及产量的影响[J]. 齐德强,赵晶晶,冯乃杰,郑殿峰,梁晓艳. 作物杂志. 2019(04)
[6]紫色马铃薯花青素StAN1基因的克隆及功能分析[J]. 贾羊毛加,王芳,叶广继,王舰. 西北植物学报. 2019(03)
[7]CaMV35S启动子及其在转基因作物中的应用和检测[J]. 汤婷,谢实龙,祝旋,徐俊锋,唐俊,汪小福. 浙江农业学报. 2019(01)
[8]马铃薯淀粉合成与降解研究进展[J]. 何虎翼,唐洲萍,杨鑫,樊吴静,谭冠宁,李丽淑,何新民. 生物技术通报. 2019(04)
[9]马铃薯淀粉物化特性分析及其对马铃薯热干面品质影响[J]. 蔡沙,施建斌,隋勇,何建军,陈学玲,范传会,蔡芳,梅新. 现代食品科技. 2019(01)
[10]果实蔗糖转运蛋白研究进展[J]. 李馨玥,王爱德. 北方果树. 2018(05)
博士论文
[1]棉花GhMYB44, GhAP2和GhARC基因功能鉴定及CRISPR/Cas9全基因组脱靶分析[D]. HAKIM.华中农业大学 2019
[2]蔗糖及茉莉酸信号在草莓果实发育中的作用及其机理分析[D]. 贾海锋.中国农业大学 2013
[3]植物黄酮类化合物槲皮素与转录因子AtMYB44诱导和调控植物防卫反应的研究[D]. 贾振华.南京农业大学 2010
硕士论文
[1]蔗糖诱导马铃薯(S.tuberosum L.)试管薯形成的转录组分析与关键基因筛选[D]. 高小溪.华中农业大学 2018
[2]棕色棉色素相关MYB转录因子基因的克隆及功能研究[D]. 张小萌.中国农业科学院 2017
[3]蔗糖诱导CmFTL2调控夏菊开花的分子机理研究[D]. 王恒.南京农业大学 2017
[4]火龙果CAT基因在烟草中的遗传转化及功能分析[D]. 葛菲.贵州大学 2016
[5]StPP2C和StABF对马铃薯块茎形成的影响[D]. 叶晖.华中农业大学 2014
[6]茉莉酸信号参与的马铃薯离体块茎发育调控[D]. 李辉军.甘肃农业大学 2013
[7]转录因子AtMYB44促进拟南芥抗病耐热及抑制开花的作用[D]. 田双梅.南京农业大学 2012
[8]蔗糖诱导马铃薯块茎形成的信号分子功能研究[D]. 杨彩菊.云南师范大学 2006
本文编号:3113799
【文章来源】:青海大学青海省 211工程院校
【文章页数】:93 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
马铃薯块茎的RNA
青海大学硕士学位论文第二章马铃薯StMYB44、StMYB44b的克隆及表达分析24图2.1马铃薯块茎的RNAM:DL2000;1-2为块茎RNAFig.2.1RNAofPotatoTuberM:DL2000;1-2asTuberRNA2)CDS的克隆以马铃薯‘青薯9号’块茎的cDNA为模板,进行特异性扩增,产物经2%的琼脂糖凝胶电泳检测其片段的大小,结果如图2.2所示,获得一条约1000bp的条带,与预期的StMYB44片段大小基本一致。将条带切下,经过回收、连接、转化、筛菌并送生工测序后,将测序结果与NCBI中的原基因序列使用DNAMAN进行比较发现,StMYB44存在2种类型,分别命名为StMYB44-1和StMYB44-2。图2.2StMYB44基因的CDS克隆M:DL2000;1:StMYB44
青海大学硕士学位论文第二章马铃薯StMYB44、StMYB44b的克隆及表达分析25Fig2.2StMYB44geneCDScloningM:DL2000;1:StMYB442.4.1.2马铃薯StMYB44的生物信息学分析1)马铃薯StMYB44基因的序列分析如图2.3所示,StMYB44-1与原序列(XM_006367359.2)一样,CDS长度为962bp,编码的蛋白质含有320个氨基酸,而StMYB44-2发生了11处碱基改变和9处碱基缺失,CDS长度为953bp,编码的蛋白质含有317个氨基酸。StMYB44-1和StMYB44-2均含有两个保守的MYB结构域,为典型的R2R3-MYB转录因子。图2.3-1StMYB44基因的序列比对图Fig2.3-1SequencealignmentofStMYB44gene
【参考文献】:
期刊论文
[1]七种彩色马铃薯的蛋白质营养评价[J]. 徐丽珊,戴一辉,谢子玉,蒲首丞,程林润. 浙江师范大学学报(自然科学版). 2020(01)
[2]利用酵母双杂交系统筛选花生AhMYB44互作蛋白[J]. 刘永惠,沈一,沈悦,陈志德. 植物遗传资源学报. 2020(01)
[3]ABA合成基因StNCED2对马铃薯块茎形成的影响[J]. 朱文姣,刘璐,章甲,陈敏,徐玉伟,杨清. 南京农业大学学报. 2019(05)
[4]青海马铃薯生产的比较优势分析[J]. 苏旺,周云,王舰. 贵州农业科学. 2019(09)
[5]烯效唑(S3307)和胺鲜酯(DTA-6)对马铃薯叶与块茎糖代谢及产量的影响[J]. 齐德强,赵晶晶,冯乃杰,郑殿峰,梁晓艳. 作物杂志. 2019(04)
[6]紫色马铃薯花青素StAN1基因的克隆及功能分析[J]. 贾羊毛加,王芳,叶广继,王舰. 西北植物学报. 2019(03)
[7]CaMV35S启动子及其在转基因作物中的应用和检测[J]. 汤婷,谢实龙,祝旋,徐俊锋,唐俊,汪小福. 浙江农业学报. 2019(01)
[8]马铃薯淀粉合成与降解研究进展[J]. 何虎翼,唐洲萍,杨鑫,樊吴静,谭冠宁,李丽淑,何新民. 生物技术通报. 2019(04)
[9]马铃薯淀粉物化特性分析及其对马铃薯热干面品质影响[J]. 蔡沙,施建斌,隋勇,何建军,陈学玲,范传会,蔡芳,梅新. 现代食品科技. 2019(01)
[10]果实蔗糖转运蛋白研究进展[J]. 李馨玥,王爱德. 北方果树. 2018(05)
博士论文
[1]棉花GhMYB44, GhAP2和GhARC基因功能鉴定及CRISPR/Cas9全基因组脱靶分析[D]. HAKIM.华中农业大学 2019
[2]蔗糖及茉莉酸信号在草莓果实发育中的作用及其机理分析[D]. 贾海锋.中国农业大学 2013
[3]植物黄酮类化合物槲皮素与转录因子AtMYB44诱导和调控植物防卫反应的研究[D]. 贾振华.南京农业大学 2010
硕士论文
[1]蔗糖诱导马铃薯(S.tuberosum L.)试管薯形成的转录组分析与关键基因筛选[D]. 高小溪.华中农业大学 2018
[2]棕色棉色素相关MYB转录因子基因的克隆及功能研究[D]. 张小萌.中国农业科学院 2017
[3]蔗糖诱导CmFTL2调控夏菊开花的分子机理研究[D]. 王恒.南京农业大学 2017
[4]火龙果CAT基因在烟草中的遗传转化及功能分析[D]. 葛菲.贵州大学 2016
[5]StPP2C和StABF对马铃薯块茎形成的影响[D]. 叶晖.华中农业大学 2014
[6]茉莉酸信号参与的马铃薯离体块茎发育调控[D]. 李辉军.甘肃农业大学 2013
[7]转录因子AtMYB44促进拟南芥抗病耐热及抑制开花的作用[D]. 田双梅.南京农业大学 2012
[8]蔗糖诱导马铃薯块茎形成的信号分子功能研究[D]. 杨彩菊.云南师范大学 2006
本文编号:3113799
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