龙眼SPL基因家族全基因组鉴定及表达分析
发布时间：2021-04-27 07:33
【目的】鉴定龙眼SPL（DlSPL）基因家族所有成员,并对其成员进行表达分析,为探究SPL在龙眼生长发育中的功能研究提供参考。【方法】采用生物信息学方法对龙眼SPL基因家族成员进行鉴定,并对其基本理化性质、基因结构、系统进化关系、启动子顺式作用元件、FPKM值进行分析;利用qRT-PCR技术检测其在非胚性愈伤组织（nonembryonic callus,NEC）、胚性培养物及不同激素处理下的胚性愈伤组织（embryonic callus,EC）中的表达情况。【结果】DlSPL基因家族共有14个成员,其基因结构和蛋白结构均高度保守且只有一个SBP结构域,DlSPL启动子存在大量的光反应元件、组织特异性调控元件、激素应答元件、胁迫响应元件和植物生长发育有关的顺式调控元件。RNA-seq表达量分析（FPKM值）表明,11个DlSPL成员在不同光质处理的EC中表达,只有DlSPL8在蓝光和白光处理下的EC中呈下调表达趋势;11个DlSPL成员在激素2,4-D和KT中表达,其中DlSPL3和DlSPL13在2,4-D和激动素（kinetin,KT）共同处理下的表达量高于2,4-D和KT分开处理;...
【文章来源】：中国农业科学. 2020,53(20)北大核心CSCD
【文章页数】：12 页
【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 龙眼Dl SPL家族成员的鉴定
1.2.2 龙眼Dl SPL家族系统进化树的构建
1.2.3 龙眼Dl SPL家族基因结构、蛋白质理化性质及保守基序分析
1.2.4 龙眼Dl SPL家族成员启动子序列的获得和分析
1.2.5 基于转录组的Dl SPL家族FPKM值分析
1.2.6 Dl SPL家族的q RT-PCR分析
2 结果
2.1 龙眼Dl SPL家族成员鉴定及基本理化性质分析
2.2 Dl SPL基因家族的系统进化树分析
2.3 Dl SPL家族基因结构及保守基序分析
2.4 龙眼Dl SPL基因家族启动子元件分析
2.5 Dl SPL家族在不同光质下、不同激素处理以及非胚性及胚性培养物的RNA-Seq表达分析
2.6 龙眼Dl SPL基因家族成员在非胚性及胚性培养物的中的q RT-PCR分析
2.7 龙眼Dl SPL家族成员在ABA和Me JA处理下的q RT-PCR分析
3 讨论
3.1 龙眼DLSPL基因家族成员的分子特性
3.2 DLSPL家族成员可能参与龙眼体胚发生过程
3.3 龙眼Dl SPL家族响应ABA和Me JA激素应答
4 结论
【参考文献】：
期刊论文
[1]银杏SQUAMOSA启动子结合蛋白（SBP）基因家族的鉴定及表达分析[J]. 杨果,董金金,李萌,汪贵斌,郁万文,杨婷婷,刘艳玲,唐隆平,蒋舜村,王义强. 植物生理学报. 2019(07)
[2]SPL调控因子在植物生长调控的研究进展[J]. 陈婉冰,周波. 分子植物育种. 2020(05)
[3]SPL转录因子的研究进展[J]. 吴艳,侯智红,程群,董利东,芦思佳,南海洋,甘卓然,刘宝辉. 大豆科学. 2019(02)
[4]三裂叶薯SPL基因家族鉴定、表达及miR156的调控分析[J]. 王婷,唐锐敏,王瑞晋,贺立恒,刘霞宇,刘世芳,李润植,贾小云. 植物遗传资源学报. 2019(03)
[5]干旱胁迫下外源茉莉酸甲酯对玉米幼苗根系吸水的影响[J]. 忽雪琦,李东阳,严加坤,张岁岐. 植物生理学报. 2018(06)
[6]SPL转录因子调控植物花发育及其分子机制研究进展[J]. 田晶,赵雪媛,谢隆聖,权晋谊,姚连梅,王国东,郑要强,刘雪梅. 南京林业大学学报(自然科学版). 2018(03)
[7]茶树miR156a靶基因SPL6和SPL9的克隆及表达分析[J]. 刘亚芹,田坤红,孙琪璐,潘铖,李叶云,蒋家月,江昌俊. 茶叶科学. 2017(06)
[8]茉莉酸甲酯对杂交鹅掌楸体胚发育的影响[J]. 成铁龙,孟岩,陈金慧,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2017(06)
[9]牡丹PsSPL3基因的克隆和表达特性分析[J]. 战新梅,管世铭,张玉喜. 华北农学报. 2017(04)
[10]11条白桦BpSPL家族基因的生物信息学和表达分析[J]. 宁坤,杨洋,马述山,李慧玉. 林业科学研究. 2016(05)
博士论文
[1]脱落酸（ABA）对水稻耐碱胁迫的诱抗效应及机理研究[D]. 刘晓龙.中国科学院大学(中国科学院东北地理与农业生态研究所) 2019
[2]脱落酸及脱落酸-乙烯互作调控番茄果实成熟的效应与机理[D]. 牟望舒.浙江大学 2019
[3]陆地棉体细胞胚胎发生过程中miRNAs及其靶标的鉴定和GhmiR157a/GhSPL10功能分析[D]. 王丽晨.华中农业大学 2017
[4]柑橘珠心胚起始相关miRNA挖掘与csi-miR156a调控体细胞胚发生作用机理[D]. 龙健梅.华中农业大学 2017
硕士论文
[1]银杏种子休眠过程与休眠解除研究[D]. 何青松.扬州大学 2018
[2]拟南芥SPL8同源基因的克隆和功能分析[D]. 杨柳.山西大学 2018
[3]小麦穗发育相关基因TaSPL20的生物学功能分析[D]. 徐伟娜.中国农业科学院 2016
[4]葡萄两个重要SBP基因的克隆、亚细胞定位及表达分析[D]. 曹雪.南京农业大学 2010
本文编号：3163060
【文章来源】：中国农业科学. 2020,53(20)北大核心CSCD
【文章页数】：12 页
【文章目录】：
0 引言
1 材料与方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 龙眼Dl SPL家族成员的鉴定
1.2.2 龙眼Dl SPL家族系统进化树的构建
1.2.3 龙眼Dl SPL家族基因结构、蛋白质理化性质及保守基序分析
1.2.4 龙眼Dl SPL家族成员启动子序列的获得和分析
1.2.5 基于转录组的Dl SPL家族FPKM值分析
1.2.6 Dl SPL家族的q RT-PCR分析
2 结果
2.1 龙眼Dl SPL家族成员鉴定及基本理化性质分析
2.2 Dl SPL基因家族的系统进化树分析
2.3 Dl SPL家族基因结构及保守基序分析
2.4 龙眼Dl SPL基因家族启动子元件分析
2.5 Dl SPL家族在不同光质下、不同激素处理以及非胚性及胚性培养物的RNA-Seq表达分析
2.6 龙眼Dl SPL基因家族成员在非胚性及胚性培养物的中的q RT-PCR分析
2.7 龙眼Dl SPL家族成员在ABA和Me JA处理下的q RT-PCR分析
3 讨论
3.1 龙眼DLSPL基因家族成员的分子特性
3.2 DLSPL家族成员可能参与龙眼体胚发生过程
3.3 龙眼Dl SPL家族响应ABA和Me JA激素应答
4 结论
【参考文献】：
期刊论文
[1]银杏SQUAMOSA启动子结合蛋白（SBP）基因家族的鉴定及表达分析[J]. 杨果,董金金,李萌,汪贵斌,郁万文,杨婷婷,刘艳玲,唐隆平,蒋舜村,王义强. 植物生理学报. 2019(07)
[2]SPL调控因子在植物生长调控的研究进展[J]. 陈婉冰,周波. 分子植物育种. 2020(05)
[3]SPL转录因子的研究进展[J]. 吴艳,侯智红,程群,董利东,芦思佳,南海洋,甘卓然,刘宝辉. 大豆科学. 2019(02)
[4]三裂叶薯SPL基因家族鉴定、表达及miR156的调控分析[J]. 王婷,唐锐敏,王瑞晋,贺立恒,刘霞宇,刘世芳,李润植,贾小云. 植物遗传资源学报. 2019(03)
[5]干旱胁迫下外源茉莉酸甲酯对玉米幼苗根系吸水的影响[J]. 忽雪琦,李东阳,严加坤,张岁岐. 植物生理学报. 2018(06)
[6]SPL转录因子调控植物花发育及其分子机制研究进展[J]. 田晶,赵雪媛,谢隆聖,权晋谊,姚连梅,王国东,郑要强,刘雪梅. 南京林业大学学报(自然科学版). 2018(03)
[7]茶树miR156a靶基因SPL6和SPL9的克隆及表达分析[J]. 刘亚芹,田坤红,孙琪璐,潘铖,李叶云,蒋家月,江昌俊. 茶叶科学. 2017(06)
[8]茉莉酸甲酯对杂交鹅掌楸体胚发育的影响[J]. 成铁龙,孟岩,陈金慧,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2017(06)
[9]牡丹PsSPL3基因的克隆和表达特性分析[J]. 战新梅,管世铭,张玉喜. 华北农学报. 2017(04)
[10]11条白桦BpSPL家族基因的生物信息学和表达分析[J]. 宁坤,杨洋,马述山,李慧玉. 林业科学研究. 2016(05)
博士论文
[1]脱落酸（ABA）对水稻耐碱胁迫的诱抗效应及机理研究[D]. 刘晓龙.中国科学院大学(中国科学院东北地理与农业生态研究所) 2019
[2]脱落酸及脱落酸-乙烯互作调控番茄果实成熟的效应与机理[D]. 牟望舒.浙江大学 2019
[3]陆地棉体细胞胚胎发生过程中miRNAs及其靶标的鉴定和GhmiR157a/GhSPL10功能分析[D]. 王丽晨.华中农业大学 2017
[4]柑橘珠心胚起始相关miRNA挖掘与csi-miR156a调控体细胞胚发生作用机理[D]. 龙健梅.华中农业大学 2017
硕士论文
[1]银杏种子休眠过程与休眠解除研究[D]. 何青松.扬州大学 2018
[2]拟南芥SPL8同源基因的克隆和功能分析[D]. 杨柳.山西大学 2018
[3]小麦穗发育相关基因TaSPL20的生物学功能分析[D]. 徐伟娜.中国农业科学院 2016
[4]葡萄两个重要SBP基因的克隆、亚细胞定位及表达分析[D]. 曹雪.南京农业大学 2010
本文编号：3163060
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/jiyingongcheng/3163060.html
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