利用生物信息学分析鉴定胰腺癌关键基因

发布时间：2021-04-29 02:55

　　目的:通过生物信息学的方法,寻找在胰腺癌中差异表达的基因,同时分析差异表达基因在胰腺癌中生物学作用,探讨其与胰腺癌的关系。方法:利用GEO数据库中的数据集寻找差异基因。利用DAVID数据库进行差异基因的生物学分析。利用STRING数据库进行蛋白相互作用分析,并用Cytoscape软件识别蛋白互作网络中最重要的模块,筛选出关键基因并进行功能富集分析。利用cBioPortal数据库中肿瘤患者的临床数据,对关键基因进行生存分析。同时利用Oncomine数据库中数据集验证关键基因表达情况,并分析关键基因与肿瘤分级、分期、分子标记和药物敏感性的关系。结果:本研究从基因表达综合数据库（GEO）下载基因芯片GSE28735、GSE15471和GSE62452,以确定在胰腺癌癌变和进展中起作用的候选基因。最初,在三个数据集中共鉴定出219个差异表达基因,其中161个上调基因,58个下调基因。通过富集分析确定了这些基因的功能和途径。结果表明,差异基因参与了细胞粘附、细胞外基质组织、蛋白水解、钙离子结合、丝氨酸型内肽酶活性、胞外小体、质膜、胞外区和胞外间隙的变化。在此基础上,构建了蛋白质相互作用网络,并将... 

【文章来源】：中国医科大学辽宁省

【文章页数】：42 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略语
1 前言
2 资料与方法
    2.1 数据来源
    2.2 识别差异基因
    2.3 差异基因的KEGG和 GO富集分析
    2.4 PPI网络建设与模块分析
    2.5 关键基因的选择和分析
3 结果
    3.1 胰腺癌中差异基因的识别
    3.2 胰腺癌中差异基因的GO分析
    3.3 PPI网络构建与模块分析
    3.4 关键基因选择和分析
4 讨论
5 结论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述
    参考文献
致谢
个人简介



本文编号：3166695