基于转录组的三月李及其红肉突变体Expansin基因家族鉴定及分析

发布时间：2021-05-06 08:18

　　【目的】Expansin是广泛存在于植物中的一类细胞壁蛋白,通过调节细胞壁柔韧性在植物生长发育过程中发挥作用。本研究旨在分析Expansin基因家族特征及其在果实成熟过程中的表达模式,并比较Expansin基因在三月李及其红肉突变体之间的差异表达。【方法】基于三月李及其红肉突变体果实成熟过程的转录组数据,采用生物信息学分析方法进行Expansin家族基因鉴定与分析。【结果】鉴定出33个李Expansin基因家族成员,编码蛋白长度在176～460 aa,分子量在19.21～51.33 kD,等电点4.62～9.83,大部分为位于细胞外的稳定亲水蛋白。系统进化树分析表明李Expansin家族成员可分为4个组:22个EXPA、 6个EXPB、 1个EXPLA和4个EXPLB。所有李Expansin蛋白质均具有保守的DPBB₁和Pollen_allerg₁结构域。保守基序分析表明,同一组Expansin成员具有相似的基序组成。9个Expansin基因在三月李及其红肉突变体果实成熟过程中差异表达。【结论】Expansin在三月李及其... 

【文章来源】：福建农业学报. 2020,35(09)北大核心CSCD

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【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3171585