沙利度胺作用于血液系统肿瘤靶基因的预测和验证

发布时间：2021-05-07 13:26

　　目的:利用生物信息学技术,预测沙利度胺在血液系统肿瘤治疗中所参与的信号通路、蛋白互作网络及靶基因,并通过分子对接软件进行靶基因验证。研究方法:利用Pubchem数据库获取沙利度胺的药物信息;BATMAN-TCM数据库及Drugbank数据库获得沙利度胺的作用靶点;STRING10.5数据库对沙利度胺作用靶点相关基因的表达产物进行蛋白质相互作用分析;WebGestalt数据库对富集基因进行GO分析及Pathway分析;cBioPortal数据库和HumanProteinAtlas数据库分析靶基因在人体组织中的表达及变异情况;Schrodinger Suites软件对沙利度胺及靶基因进行分子对接验证。结果:利用BATMAN-TCM数据库及Drugbank数据库筛选出52个沙利度胺作用靶点;利用STRING10.5数据库分别对52个靶基因所对应的蛋白进行分析,共筛选出300个与靶蛋白相互作用的蛋白;利用WebGestalt数据库对上述基因进行Pathway分析,富集在10条通路,筛选出4条与肿瘤相关的信号通路:MAPK signaling pathway、Ras signaling path... 

【文章来源】：中国医科大学辽宁省

【文章页数】：32 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
英文缩略语
1 前言
2 材料方法
3 研究结果
    3.1 利用Pubchem数据库获得沙利度胺的药物信息及分子结构式并利BATMAN-TCM数据库及获取沙利度胺的作用靶点
    3.2 通过STRING数据库进行蛋白互作分析
    3.3 通过Web Gestalt数据库将基因富集到通路上
    3.4 hub基因在肿瘤中的变异情况
    3.5 hub基因在人类不同癌组织中的表达情况
    3.6 通过Schrodinger Suites软件对靶基因进行分子对接验证
4 讨论
5 结论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述
    参考文献
致谢
个人简介


【参考文献】：
期刊论文
[1]炎症在肿瘤发生过程中所起作用研究进展[J]. 周峰,刘子杰,段勇.  世界最新医学信息文摘. 2018(09)
[2]MAPK/ERK信号传导通路与肿瘤发生的相关机制研究进展[J]. 刘伟,黄玮,李瑞琴.  中国现代医药杂志. 2016(08)
[3]靶向RAS信号通路的抗肿瘤药物治疗[J]. 何勤思,钟军,郑智.  实用癌症杂志. 2016(07)
[4]沙利度胺抗肿瘤机制及其作用靶点CRBN的研究进展[J]. 黄海宁,张浩,汪海.  中国药理学通报. 2015(06)
[5]基于PubChem数据库的天然产物快速寻靶方法[J]. 刘海波,彭勇,黄璐琦,肖培根.  中草药. 2012(11)



本文编号：3173472